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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    1 7v3x:A (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    2 7v3x:A (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    3 7v3x:A (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    4 7v3x:A (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    5 7v3x:B (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    6 7v3x:B (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    7 7v3x:B (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    8 7v3x:B (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    9 7v3x:C (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    10 7v3x:C (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    11 7v3x:C (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    12 7v3x:C (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    13 7v3x:C (3.1) BS05 MG 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    14 7v3x:D (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    15 7v3x:D (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    16 7v3x:D (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    17 7v3x:D (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    18 7v3x:E (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    19 7v3x:E (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    20 7v3x:E (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    21 7v3x:E (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    22 7v3x:F (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    23 7v3x:F (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    24 7v3x:F (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    25 7v3x:F (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    26 7v3x:G (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    27 7v3x:G (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    28 7v3x:G (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    29 7v3x:G (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    30 7v3x:H (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    31 7v3x:H (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    32 7v3x:H (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    33 7v3x:H (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    34 7v3x:I (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    35 7v3x:I (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    36 7v3x:I (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    37 7v3x:I (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    38 7v3x:J (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    39 7v3x:J (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    40 7v3x:J (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    41 7v3x:J (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    42 7v3x:K (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    43 7v3x:K (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    44 7v3x:K (3.1) BS03 MG 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    45 7v3x:K (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    46 7v3x:K (3.1) BS05 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    47 7v3x:L (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    48 7v3x:L (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    49 7v3x:L (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    50 7v3x:L (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    51 7v3x:M (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    52 7v3x:M (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    53 7v3x:M (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    54 7v3x:M (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    55 7v3x:N (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    56 7v3x:N (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    57 7v3x:N (3.1) BS03 MG 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    58 7v3x:N (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    59 7v3x:N (3.1) BS05 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    60 7v3x:O (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
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    61 7v3x:O (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
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    62 7v3x:O (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    63 7v3x:O (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    64 7v3x:P (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    65 7v3x:P (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    66 7v3x:P (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    67 7v3x:P (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    68 7v3x:Q (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    69 7v3x:Q (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    70 7v3x:Q (3.1) BS03 ADP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    71 7v3x:Q (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    72 7v3x:R (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    73 7v3x:R (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    74 7v3x:R (3.1) BS03 MG 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    75 7v3x:R (3.1) BS04 MG 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    76 7v3x:R (3.1) BS05 ADP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    77 7v3x:R (3.1) BS06 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    78 7v3x:S (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    79 7v3x:S (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    80 7v3x:S (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    81 7v3x:S (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    82 7v3x:T (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    83 7v3x:T (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    84 7v3x:T (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    85 7v3x:T (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    86 7v3x:U (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    87 7v3x:U (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    88 7v3x:U (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    89 7v3x:U (3.1) BS04 ADP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    90 7v3x:V (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    91 7v3x:V (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    92 7v3x:V (3.1) BS03 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    93 7v3x:W (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    94 7v3x:W (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    95 7v3x:W (3.1) BS03 ADP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    96 7v3x:W (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    97 7v3x:X (3.1) BS01 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    98 7v3x:X (3.1) BS02 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    99 7v3x:X (3.1) BS03 ADP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    100 7v3x:X (3.1) BS04 ATP 2.7.11.1
    3.6.4.-    		 GO:0000287 ... Q79PF4 35427168
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

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