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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    439201 8qrn:X (2.98) BS03 GNP N/A GO:0003723 ... P51398 38969660
    439202 8qro:A (2.6) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439203 8qro:B (2.6) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439204 8qro:C (2.6) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439205 8qrp:B (2.7) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439206 8qrq:B (2.74) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439207 8qrr:B (2.78) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439208 8qrs:B (2.86) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439209 8qrt:AAA (2.0) BS01 WP2 N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439210 8qrt:BBB (2.0) BS01 WP2 N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439211 8qrt:CCC (2.0) BS01 WP2 N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439212 8qrt:DDD (2.0) BS01 WP2 N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439213 8qru:B (2.9) BS01 GLN N/A N/A Q15758 39095408
    439214 8qs0:AAA (2.3) BS01 WOX N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439215 8qs0:BBB (2.3) BS01 WOX N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439216 8qs0:CCC (2.3) BS01 WOX N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439217 8qs0:DDD (2.3) BS01 WOX N/A GO:0006633 ... N/A 38334233
    439218 8qsj:r (3.0) BS02 FES ? GO:0003735 ... Q9NVS2 38042949
    439219 8qsj:v (3.0) BS01 PM8 ? GO:0000266 ... L0R8F8 38042949
    439220 8qsj:x (3.0) BS02 SAM 2.1.1.- GO:0001510 ... Q96CB9 38042949
    439221 8qsj:z (3.0) BS02 GNP ? GO:0003924 ... Q9BT17 38042949
    439222 8qsk:A (3.3) BS01 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439223 8qsk:A (3.3) BS02 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439224 8qsk:A (3.3) BS03 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439225 8qsk:A (3.3) BS04 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
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    439227 8qsk:A (3.3) BS06 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439228 8qsk:A (3.3) BS07 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439229 8qsk:A (3.3) BS08 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439230 8qsk:C (3.3) BS01 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439231 8qsk:C (3.3) BS02 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439232 8qsk:C (3.3) BS03 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439233 8qsk:C (3.3) BS04 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439234 8qsk:C (3.3) BS05 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439235 8qsk:C (3.3) BS06 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439236 8qsk:C (3.3) BS07 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439237 8qsk:C (3.3) BS08 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439238 8qsl:A (2.81) BS01 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439239 8qsl:A (2.81) BS02 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439240 8qsl:A (2.81) BS03 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439241 8qsl:A (2.81) BS04 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439242 8qsl:A (2.81) BS05 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439243 8qsl:A (2.81) BS06 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439244 8qsl:A (2.81) BS07 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439245 8qsl:C (2.81) BS01 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439246 8qsl:C (2.81) BS02 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439247 8qsl:C (2.81) BS03 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439248 8qsl:C (2.81) BS04 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439249 8qsl:C (2.81) BS05 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439250 8qsl:C (2.81) BS06 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439251 8qsl:C (2.81) BS07 Y01 ? GO:0005290 ... Q8N697 N/A
    439252 8qso:A (2.106) BS01 GLC ? GO:0005515 ... P0AEX9
    Q07820    		 38306405
    439253 8qso:A (2.106) BS02 GLC ? GO:0005515 ... P0AEX9
    Q07820    		 38306405
    439254 8qso:A (2.106) BS03 WXW ? GO:0005515 ... P0AEX9
    Q07820    		 38306405
    439255 8qsr:A (2.56) BS01 BGC N/A N/A P69786 N/A
    439256 8qsr:B (2.56) BS01 BGC N/A N/A P69786 N/A
    439257 8qst:A (2.89) BS01 BGC N/A N/A P69786 N/A
    439258 8qst:B (2.89) BS01 BGC N/A N/A P69786 N/A
    439259 8qt6:A (2.29) BS01 FAD N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439260 8qt6:A (2.29) BS02 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439261 8qt6:A (2.29) BS03 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439262 8qt7:A (2.2) BS01 NDP N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439263 8qt7:A (2.2) BS02 FAD N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439264 8qt7:A (2.2) BS03 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439265 8qt7:A (2.2) BS04 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439266 8qt9:A (2.36) BS01 FAD N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439267 8qt9:A (2.36) BS02 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439268 8qt9:A (2.36) BS03 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439269 8qt9:A (2.36) BS04 NAI N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439270 8qta:A (2.64) BS01 NDP N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439271 8qta:A (2.64) BS02 FAD N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439272 8qta:A (2.64) BS03 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439273 8qta:A (2.64) BS04 HEM N/A GO:0016020 ... Q8CZ28 39039317
    439274 8qtg:A (1.419) BS01 WUQ 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    439275 8qth:A (2.198) BS01 WX0 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    439276 8qtj:A (1.523) BS03 WUI 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    439277 8qtk:A (1.873) BS03 WX9 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
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    439279 8qtl:B (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    439280 8qtl:C (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    439281 8qtl:D (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    439282 8qtl:E (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    439283 8qto:A (2.4) BS01 SF4 ? GO:0003677 ... Q70ET4 N/A
    439284 8qu5:v (2.42) BS01 PNS N/A GO:0000266 ... L0R8F8 38969660
    439285 8qu5:w (2.42) BS01 PNS N/A GO:0000035 ... O14561 38969660
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    439288 8qu8:F (3.5) BS02 WYL 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 N/A
    439289 8qub:A (1.63) BS01 WVZ ? GO:0016032 ... P12493 38581280
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    439294 8quc:B (2.9) BS01 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
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    439299 8quc:C (2.9) BS02 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439300 8quc:C (2.9) BS03 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439301 8quc:C (2.9) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439302 8quc:D (2.9) BS01 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
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    439304 8quc:D (2.9) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
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    439308 8qud:B (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439309 8qud:B (2.5) BS02 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439310 8qud:B (2.5) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439311 8qud:C (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439312 8qud:C (2.5) BS02 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439313 8qud:C (2.5) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439314 8qud:D (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439315 8qud:D (2.5) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    439316 8qud:D (2.5) BS04 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
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    439339 8qv2:f (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439340 8qv2:g (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439341 8qv2:h (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439342 8qv2:i (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439343 8qv2:j (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439344 8qv2:k (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439345 8qv2:l (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439346 8qv2:m (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439347 8qv2:n (9.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439348 8qv3:c (8.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439349 8qv3:d (8.2) BS01 GTP ? GO:0000930 ... N/A 38609662
    439350 8qv4:A (2.7) BS01 WZX ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    439351 8qv7:A (2.66) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 N/A
    439352 8qv7:B (2.66) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 N/A
    439353 8qv7:C (2.66) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 N/A
    439354 8qv7:D (2.66) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 N/A
    439355 8qv9:A (1.76) BS01 WZL ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    439356 8qva:A (2.0) BS01 WZ9 ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    439357 8qvb:A (2.7) BS01 HEM N/A GO:0046872 ... B8HNS6 38846772
    439358 8qvb:B (2.7) BS01 HEM N/A GO:0046872 ... B8HNS6 38846772
    439359 8qve:A (1.7) BS01 FAD ? GO:0000166 ... A0A2I9D0D5 38508304
    439360 8qvf:A (2.4) BS01 XQ9 N/A N/A P34913 39072424
    439361 8qvg:A (2.2) BS01 6N8 N/A N/A P34913 39072424
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    439370 8qvu:E (2.24) BS02 GDP 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 N/A
    439371 8qvu:F (2.24) BS01 WYL ? GO:0000122 ... P40337 N/A
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    439398 8qw2:C (1.87) BS01 UDP N/A N/A Q13232 N/A
    439399 8qw2:D (1.87) BS01 UDP N/A N/A Q13232 N/A
    439400 8qw2:E (1.87) BS01 UDP N/A N/A Q13232 N/A
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

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