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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
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    1.14.14.56
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    1.14.14.55
    1.14.14.56
    1.14.14.73    		 GO:0002933 ... P08684 28590129
    603 5vcg:A (2.2) BS03 GOL 1.14.14.1
    1.14.14.55
    1.14.14.56
    1.14.14.73    		 GO:0002933 ... P08684 28590129
    604 5vcg:A (2.2) BS04 GOL 1.14.14.1
    1.14.14.55
    1.14.14.56
    1.14.14.73    		 GO:0002933 ... P08684 28590129
    605 5wab:A (2.45) BS01 GOL ? GO:0004553 ... A1A2P2 29555372
    606 5x5t:A (2.25) BS01 GOL 1.2.1.24
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    607 5x5t:B (2.25) BS01 GOL 1.2.1.24
    1.2.1.26    		 GO:0004777 ... Q1JUP4 28393833
    608 5x5u:A (2.3) BS02 GOL 1.2.1.24
    1.2.1.26    		 GO:0004777 ... Q1JUP4 28393833
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    615 5xrn:A (1.6) BS01 GOL ? GO:0002667 ... Q05315 29293962
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    621 5yn3:C (2.7) BS03 GOL 5.3.1.5 GO:0005975 ... Q9P8C9 29385668
    622 5yn3:D (2.7) BS03 GOL 5.3.1.5 GO:0005975 ... Q9P8C9 29385668
    623 5yt4:A (2.0) BS01 GOL ? GO:0002667 ... Q05315 29293962
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    641 5z3f:A (1.1) BS03 GOL 3.2.1.205 GO:0000272 ... D2PPM8 34665923
    642 5z3f:A (1.1) BS04 GOL 3.2.1.205 GO:0000272 ... D2PPM8 34665923
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    702 6kb0:A (1.35) BS01 GOL ? GO:0003677 ... Q07869 33205029
    703 6kb1:A (1.25) BS01 GOL ? GO:0003677 ... Q07869 33205029
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    722 6lx8:A (1.54) BS01 GOL ? GO:0003677 ... Q07869 33205029
    723 6lx9:A (1.4) BS01 GOL ? GO:0003677 ... Q07869 33205029
    724 6lxa:A (1.23) BS01 GOL ? GO:0003677 ... Q07869 33205029
    725 6n1g:A (3.995) BS01 GOL ? GO:0005515 ... O14520 32695023
    726 6n1g:B (3.995) BS01 GOL ? GO:0005515 ... O14520 32695023
    727 6n1g:C (3.995) BS01 GOL ? GO:0005515 ... O14520 32695023
    728 6n1g:D (3.995) BS01 GOL ? GO:0005515 ... O14520 32695023
    729 6nke:A (1.72) BS01 GOL 2.5.1.41 GO:0000287 ... Q97AR4 32496216
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    800 7dkt:A (1.65) BS08 GOL 3.2.1.45 GO:0004348 ... F6BL85 34019851
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

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