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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    201 2rgm:A (1.55) BS03 GOL 3.2.1.21 GO:0004553 ... Q75I93 18308333
    202 2rgm:B (1.55) BS03 GOL 3.2.1.21 GO:0004553 ... Q75I93 18308333
    203 2v2q:A (2.3) BS01 GOL 2.7.1.148 GO:0005524 ... O67060 18033714
    204 2v2q:B (2.3) BS01 GOL 2.7.1.148 GO:0005524 ... O67060 18033714
    205 2v2v:A (2.4) BS03 GOL 2.7.1.148 GO:0005524 ... O67060 18033714
    206 2v2v:B (2.4) BS04 GOL 2.7.1.148 GO:0005524 ... O67060 18033714
    207 2v2v:B (2.4) BS05 GOL 2.7.1.148 GO:0005524 ... O67060 18033714
    208 2veo:B (2.2) BS01 GOL 3.1.1.3 GO:0004806 ... W3VKA4 18155238
    209 2vou:A (2.6) BS02 GOL 1.14.13.10 GO:0000166 ... Q93NG3 18440023
    210 2vou:B (2.6) BS02 GOL 1.14.13.10 GO:0000166 ... Q93NG3 18440023
    211 2vou:C (2.6) BS02 GOL 1.14.13.10 GO:0000166 ... Q93NG3 18440023
    212 2vuv:A (1.3) BS02 GOL ? GO:0046872 ... Q3KVL7 18687680
    213 2vuv:A (1.3) BS03 GOL ? GO:0046872 ... Q3KVL7 18687680
    214 2vuz:A (1.7) BS04 GOL ? GO:0046872 ... Q3KVL7 18687680
    215 2vuz:A (1.7) BS05 GOL ? GO:0046872 ... Q3KVL7 18687680
    216 2vuz:A (1.7) BS06 GOL ? GO:0046872 ... Q3KVL7 18687680
    217 2w40:A (1.49) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    218 2w40:A (1.49) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    219 2w40:B (1.49) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    220 2w40:B (1.49) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    221 2w40:C (1.49) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    222 2w40:C (1.49) BS02 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    223 2w40:C (1.49) BS03 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    224 2w40:C (1.49) BS04 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    225 2w40:C (1.49) BS05 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    226 2w40:C (1.49) BS06 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    227 2w40:D (1.49) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... Q8IDI4 19040641
    228 2w97:B (2.29) BS02 GOL ? GO:0000082 ... P06730 19440045
    229 2wnw:A (2.0) BS01 GOL 3.2.1.75 GO:0004348 ... Q9KIJ7 19717598
    230 2wnw:B (2.0) BS01 GOL 3.2.1.75 GO:0004348 ... Q9KIJ7 19717598
    231 2wnw:B (2.0) BS02 GOL 3.2.1.75 GO:0004348 ... Q9KIJ7 19717598
    232 2wnw:B (2.0) BS03 GOL 3.2.1.75 GO:0004348 ... Q9KIJ7 19717598
    233 2y4s:A (2.1) BS03 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    234 2y4s:A (2.1) BS04 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    235 2y4s:A (2.1) BS05 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    236 2y4s:A (2.1) BS06 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    237 2y4s:A (2.1) BS07 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    238 2y4s:A (2.1) BS08 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... Q9S7S8 20863834
    239 2y5e:A (2.49) BS02 GOL 3.2.1.41 GO:0004553 ... O48541 20863834
    240 2ygt:A (2.4) BS02 GOL ? GO:0005576 ... B8QGZ7 23805259
    241 2yy7:A (2.061) BS02 GOL 1.1.1.103 GO:0000166 ... Q8KZM4 21078123
    242 2yy7:B (2.061) BS02 GOL 1.1.1.103 GO:0000166 ... Q8KZM4 21078123
    243 3a9s:A (1.6) BS01 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    244 3a9s:A (1.6) BS03 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    245 3a9s:A (1.6) BS04 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    246 3a9s:B (1.6) BS01 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    247 3a9s:B (1.6) BS02 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    248 3a9s:B (1.6) BS04 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    249 3a9s:C (1.6) BS02 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    250 3a9s:C (1.6) BS03 GOL 5.3.1.25 GO:0005737 ... C0SSE7 20123133
    251 3apa:A (1.65) BS01 GOL ? GO:0005515 ... O60844 21110947
    252 3auj:A (2.1) BS01 GOL 4.2.1.28 GO:0003824 ... Q59470 22221669 Manual survey: Km=1.2+-0.2mM (22221669)
    253 3auj:L (2.1) BS01 GOL 4.2.1.28 GO:0003824 ... Q59470 22221669 Manual survey: Km=1.2+-0.2mM (22221669)
    254 3b3r:A (0.98) BS02 GOL 1.1.3.6
    5.3.3.1    		 GO:0016614 ... P12676 18029419
    255 3b3r:A (0.98) BS03 GOL 1.1.3.6
    5.3.3.1    		 GO:0016614 ... P12676 18029419
    256 3c02:A (2.05) BS01 GOL ? GO:0005886 ... Q8II36 18500352
    257 3d7e:O (2.03) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    258 3d7e:X (2.03) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    259 3eqa:A (1.9) BS09 GOL 3.2.1.3 GO:0004339 ... P69328 21301084
    260 3eug:A (1.43) BS01 GOL 3.2.2.27 GO:0004844 ... P12295 10090282
    261 3eug:A (1.43) BS02 GOL 3.2.2.27 GO:0004844 ... P12295 10090282
    262 3ezw:A (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    263 3ezw:B (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    264 3ezw:C (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    265 3ezw:D (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    266 3ezw:E (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    267 3ezw:F (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    268 3ezw:G (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    269 3ezw:H (2.0) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... P0A6F3 17441732
    270 3fah:A (1.72) BS05 GOL 1.2.99.7 GO:0005506 ... Q46509 19459677 MOAD: Ki=26.8mM
    271 3fah:A (1.72) BS06 GOL 1.2.99.7 GO:0005506 ... Q46509 19459677 MOAD: Ki=26.8mM
    272 3fah:A (1.72) BS07 GOL 1.2.99.7 GO:0005506 ... Q46509 19459677 MOAD: Ki=26.8mM
    273 3flc:O (1.85) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    274 3flc:X (1.85) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    275 3fvs:B (1.5) BS01 GOL 2.6.1.64
    2.6.1.7
    4.4.1.13    		 GO:0005515 ... Q16773 19338303
    276 3fvu:A (1.55) BS02 GOL 2.6.1.64
    2.6.1.7
    4.4.1.13    		 GO:0005515 ... Q16773 19338303
    277 3fvu:B (1.55) BS03 GOL 2.6.1.64
    2.6.1.7
    4.4.1.13    		 GO:0005515 ... Q16773 19338303
    278 3h3n:O (1.73) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    279 3h3n:X (1.73) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    280 3h46:O (1.75) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    281 3h46:X (1.75) BS01 GOL 2.7.1.30 GO:0004370 ... O34153 19102629
    282 3hju:A (2.2) BS01 GOL 3.1.1.23 GO:0004622 ... Q99685 19957260
    283 3hju:B (2.2) BS01 GOL 3.1.1.23 GO:0004622 ... Q99685 19957260
    284 3hs4:A (1.1) BS02 GOL 4.2.1.1
    4.2.1.69    		 GO:0002009 ... P00918 19851004
    285 3iwj:A (2.15) BS02 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    286 3iwj:A (2.15) BS03 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    287 3iwj:B (2.15) BS02 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    288 3iwj:B (2.15) BS03 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    289 3iwj:B (2.15) BS04 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    290 3iwj:B (2.15) BS05 GOL 1.2.1.-
    1.2.1.19
    1.2.1.54    		 GO:0000166 ... Q93YB2 20026072
    291 3k6m:C (1.5) BS01 GOL 2.8.3.5 GO:0005739 ... Q29551 20606260
    292 3k6m:C (1.5) BS02 GOL 2.8.3.5 GO:0005739 ... Q29551 20606260
    293 3mdl:A (2.2) BS01 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... Q05769 21489986
    294 3mdl:B (2.2) BS01 GOL 1.14.99.1 GO:0001516 ... Q05769 21489986
    295 3mio:B (1.8) BS02 GOL 3.5.4.25
    4.1.99.12    		 GO:0008686 ... A5U2B7 21296160
    296 3nka:A (2.5) BS01 GOL ? GO:0005515 ... P60844 20855585
    297 3p53:A (2.0) BS01 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    298 3p53:A (2.0) BS02 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    299 3p53:A (2.0) BS03 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    300 3p53:B (2.0) BS01 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    301 3p53:B (2.0) BS02 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    302 3p53:B (2.0) BS03 GOL ? GO:0001725 ... Q16658 21685497
    303 3pbf:A (1.8) BS02 GOL ? N/A P08427 21047777
    304 3pbf:A (1.8) BS03 GOL ? N/A P08427 21047777
    305 3pbf:A (1.8) BS04 GOL ? N/A P08427 21047777
    306 3pdu:A (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    307 3pdu:A (1.89) BS03 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    308 3pdu:B (1.89) BS01 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    309 3pdu:B (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    310 3pdu:C (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    311 3pdu:D (1.89) BS01 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    312 3pdu:D (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    313 3pdu:D (1.89) BS04 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    314 3pdu:E (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    315 3pdu:F (1.89) BS01 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    316 3pdu:F (1.89) BS03 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    317 3pdu:G (1.89) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q74DE4 24878278
    318 3pef:A (2.07) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q39R98 24878278
    319 3pef:A (2.07) BS03 GOL ? GO:0000166 ... Q39R98 24878278
    320 3pef:A (2.07) BS04 GOL ? GO:0000166 ... Q39R98 24878278
    321 3pef:C (2.07) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q39R98 24878278
    322 3pef:E (2.07) BS02 GOL ? GO:0000166 ... Q39R98 24878278
    323 3pfw:O (2.15) BS02 GOL 1.2.1.12 GO:0006006 ... O14556 21269272
    324 3pfw:O (2.15) BS03 GOL 1.2.1.12 GO:0006006 ... O14556 21269272
    325 3pfw:O (2.15) BS04 GOL 1.2.1.12 GO:0006006 ... O14556 21269272
    326 3pfw:P (2.15) BS02 GOL 1.2.1.12 GO:0006006 ... O14556 21269272
    327 3pfw:P (2.15) BS03 GOL 1.2.1.12 GO:0006006 ... O14556 21269272
    328 3q6v:A (1.37) BS01 GOL 3.5.2.6 GO:0008270 ... Q9RMI1 21762699
    329 3q6v:B (1.37) BS01 GOL 3.5.2.6 GO:0008270 ... Q9RMI1 21762699
    330 3qe3:A (1.9) BS02 GOL 1.1.1.-
    1.1.1.14
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    331 3sx3:A (1.45) BS02 GOL 2.4.1.37
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    332 3sx7:A (1.42) BS03 GOL 2.4.1.37
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    341 3u52:A (1.95) BS06 GOL ? GO:0016491 ... Q84AQ2 22136180
    342 3u52:A (1.95) BS07 GOL ? GO:0016491 ... Q84AQ2 22136180
    343 3u52:A (1.95) BS08 GOL ? GO:0016491 ... Q84AQ2 22136180
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    384 3wy4:A (2.5) BS06 GOL 3.2.1.20 GO:0004556 ... H3K096 26057678
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    400 3x3z:A (1.51) BS05 GOL 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46881 26269595
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

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