Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 6639 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.

    • Sort results by
    << < 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    1 1a2v:A (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    2 1a2v:B (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    3 1a2v:C (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    4 1a2v:D (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    5 1a2v:E (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    6 1a2v:F (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P12807 15299901
    7 1a4a:A (1.89) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    8 1a4a:B (1.89) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    9 1a4b:A (1.91) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    10 1a4b:B (1.91) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    11 1a4c:A (2.45) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    12 1a4c:B (2.45) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    13 1a4c:C (2.45) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    14 1a4c:D (2.45) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 9520385
    15 1a65:A (2.23) BS01 CU 1.10.3.2 GO:0005507 ... Q9Y780 9546223
    16 1a65:A (2.23) BS02 CU 1.10.3.2 GO:0005507 ... Q9Y780 9546223
    17 1a65:A (2.23) BS03 CU 1.10.3.2 GO:0005507 ... Q9Y780 9546223
    18 1a8v:A (2.0) BS01 CU 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 10230401
    19 1a8v:B (2.0) BS01 CU 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 10230401
    20 1aac:A (1.31) BS01 CU ? GO:0005507 ... P22364 15299631
    21 1aan:A (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P22364 8495197
    22 1adw:A (2.5) BS01 CU ? GO:0005507 ... P80401 7583671
    23 1adw:B (2.5) BS01 CU ? GO:0005507 ... P80401 7583671
    24 1ag0:A (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    25 1ag0:B (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    26 1ag6:A (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00289 9792096
    27 1and:A (2.3) BS01 CU 3.4.21.4 GO:0004252 ... P00763 8448149
    28 1aoz:A (1.9) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 1548698
    29 1aoz:B (1.9) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 1548698
    30 1aq8:A (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    31 1aq8:A (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    32 1aq8:B (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    33 1aq8:B (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    34 1aq8:C (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    35 1aq8:C (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    36 1aqp:A (2.0) BS01 CU 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 9275172
    37 1aqp:A (2.0) BS02 CU 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 9275172
    38 1ar1:A (2.7) BS01 CU 7.1.1.9 GO:0004129 ... P98002 9380672
    39 1ar1:B (2.7) BS01 CU 7.1.1.9 GO:0004129 ... P08306 9380672
    40 1ar1:B (2.7) BS02 CU 7.1.1.9 GO:0004129 ... P08306 9380672
    41 1as6:A (1.8) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    42 1as6:A (1.8) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    43 1as6:B (1.8) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    44 1as6:B (1.8) BS03 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    45 1as6:C (1.8) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    46 1as6:C (1.8) BS03 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    47 1as7:A (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    48 1as7:A (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    49 1as7:B (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    50 1as7:B (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    51 1as7:C (2.0) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    52 1as7:C (2.0) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    53 1as8:A (1.85) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    54 1as8:A (1.85) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    55 1as8:B (1.85) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    56 1as8:B (1.85) BS03 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    57 1as8:C (1.85) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    58 1as8:C (1.85) BS03 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 9353305
    59 1aso:A (2.2) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    60 1aso:A (2.2) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    61 1aso:A (2.2) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    62 1aso:A (2.2) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    63 1aso:B (2.2) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    64 1aso:B (2.2) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    65 1aso:B (2.2) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    66 1aso:B (2.2) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    67 1asp:A (2.59) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    68 1asp:A (2.59) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    69 1asp:A (2.59) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    70 1asp:A (2.59) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    71 1asp:B (2.59) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    72 1asp:B (2.59) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    73 1asp:B (2.59) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    74 1asp:B (2.59) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    75 1asq:A (2.32) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    76 1asq:A (2.32) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    77 1asq:A (2.32) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    78 1asq:A (2.32) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    79 1asq:B (2.32) BS01 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    80 1asq:B (2.32) BS02 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    81 1asq:B (2.32) BS03 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    82 1asq:B (2.32) BS04 CU 1.10.3.3 GO:0005507 ... P37064 8478945
    83 1av4:A (2.2) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46881 9405045
    84 1avl:A (2.8) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46881 9405045
    85 1azb:A (2.2) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 15299522
    86 1azb:B (2.2) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 15299522
    87 1azc:A (1.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 15299522
    88 1azc:B (1.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00280 15299522
    89 1azn:A (2.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299318
    90 1azn:B (2.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299318
    91 1azn:C (2.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299318
    92 1azn:D (2.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299318
    93 1azr:A (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299504
    94 1azr:B (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299504
    95 1azr:C (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299504
    96 1azr:D (2.4) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 15299504
    97 1azu:A (2.7) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    98 1azv:A (1.9) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000302 ... P00441 9541385
    99 1azv:B (1.9) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000302 ... P00441 9541385
    100 1b4l:A (1.8) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    101 1b4t:A (1.8) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    102 1baw:A (2.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... Q51883 10089349
    103 1baw:B (2.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... Q51883 10089349
    104 1baw:C (2.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... Q51883 10089349
    105 1bex:A (2.3) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10089343
    106 1bex:A (2.3) BS02 CU ? GO:0005507 ... P00282 10089343
    107 1bex:B (2.3) BS02 CU ? GO:0005507 ... P00282 10089343
    108 1bex:B (2.3) BS03 CU ? GO:0005507 ... P00282 10089343
    109 1bq5:A (2.05) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... O68601 9792907
    110 1bq5:A (2.05) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... O68601 9792907
    111 1bqk:A (1.35) BS01 CU ? GO:0005507 ... P19567 10364229
    112 1bqr:A (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P19567 10364229
    113 1bug:A (2.7) BS01 CU 1.10.3.1 GO:0004097 ... Q9ZP19 9846879
    114 1bug:A (2.7) BS02 CU 1.10.3.1 GO:0004097 ... Q9ZP19 9846879
    115 1bug:B (2.7) BS01 CU 1.10.3.1 GO:0004097 ... Q9ZP19 9846879
    116 1bug:B (2.7) BS02 CU 1.10.3.1 GO:0004097 ... Q9ZP19 9846879
    117 1bxu:A (1.9) BS01 CU ? GO:0005507 ... P55020 10320332
    118 1bxv:A (1.8) BS01 CU ? GO:0005507 ... P55020 10320332
    119 1byo:A (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P07030 10220581
    120 1byo:B (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P07030 10220581
    121 1byp:A (1.75) BS01 CU ? GO:0005507 ... P07030 10220581
    122 1bzo:A (2.1) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00446 9878406
    123 1cb4:A (2.3) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 10092461
    124 1cb4:A (2.3) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 10092461
    125 1cb4:B (2.3) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 10092461
    126 1cbj:A (1.65) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 10092461
    127 1cbj:B (1.65) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 10092461
    128 1cc3:A (1.65) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10231517
    129 1cc3:A (1.65) BS02 CU ? GO:0005507 ... P00282 10231517
    130 1cc3:B (1.65) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10231517
    131 1cc3:B (1.65) BS02 CU ? GO:0005507 ... P00282 10231517
    132 1cob:A (2.0) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 1619651
    133 1cob:B (2.0) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 1619651
    134 1cuo:A (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P12335 14516747
    135 1cur:A (-1.00) BS01 CU ? GO:0005507 ... P0C918 8947573
    136 1d6u:A (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    137 1d6u:B (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    138 1d6y:A (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    139 1d6y:B (2.4) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    140 1d6z:A (2.1) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    141 1d6z:B (2.1) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10576737
    142 1dsw:A (-1.00) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000302 ... P00441 10631612
    143 1dyu:A (2.04) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10387067
    144 1dyu:B (2.04) BS01 CU 1.4.3.21 GO:0005507 ... P46883 10387067
    145 1dyz:A (1.75) BS01 CU ? GO:0005507 ... P56275 10818345
    146 1e30:A (1.5) BS01 CU ? GO:0005507 ... P0C918 10504237
    147 1e30:B (1.5) BS01 CU ? GO:0005507 ... P0C918 10504237
    148 1e5y:A (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    149 1e5y:B (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    150 1e5y:C (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    151 1e5y:D (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    152 1e5z:A (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    153 1e5z:B (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    154 1e5z:C (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    155 1e5z:D (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    156 1e9o:A (1.85) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    157 1e9o:A (1.85) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    158 1e9o:B (1.85) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    159 1e9o:B (1.85) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    160 1e9p:A (1.7) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    161 1e9p:A (1.7) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    162 1e9p:B (1.7) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    163 1e9q:A (1.75) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    164 1e9q:A (1.75) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    165 1e9q:B (1.75) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000209 ... P00442 11080458
    166 1ehk:A (2.4) BS01 CU 7.1.1.9 GO:0004129 ... Q5SJ79 10775261
    167 1eqw:A (2.3) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P0CW86 10970746
    168 1eqw:B (2.3) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P0CW86 10970746
    169 1eqw:C (2.3) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P0CW86 10970746
    170 1eqw:D (2.3) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P0CW86 10970746
    171 1eso:A (2.0) BS02 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P0AGD1 9405149
    172 1et5:A (1.9) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    173 1et5:A (1.9) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    174 1et7:A (1.7) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    175 1et7:A (1.7) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    176 1et8:A (1.8) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    177 1et8:A (1.8) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P38501 10811642
    178 1etj:A (2.3) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 9100002
    179 1etj:B (2.3) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 9100002
    180 1etj:C (2.3) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 9100002
    181 1etj:D (2.3) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 9100002
    182 1ezl:A (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10880975
    183 1ezl:B (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10880975
    184 1ezl:C (2.0) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 10880975
    185 1f18:A (1.7) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    186 1f1a:A (1.8) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    187 1f1d:A (2.1) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    188 1f1g:A (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    189 1f1g:B (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    190 1f1g:C (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    191 1f1g:D (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    192 1f1g:E (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    193 1f1g:F (1.35) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0004784 ... P00445 10026301
    194 1fa4:A (-1.00) BS01 CU ? GO:0005507 ... Q3M9H8 N/A
    195 1fft:A (3.5) BS01 CU 7.1.1.3 GO:0004129 ... P0ABI8 11017202
    196 1fft:F (3.5) BS01 CU 7.1.1.3 GO:0004129 ... P0ABI8 11017202
    197 1fr4:A (1.6) BS01 CU 4.2.1.1
    4.2.1.69    		 GO:0002009 ... P00918 11076507
    198 1fsr:A (2.0) BS01 CU 4.2.1.1
    4.2.1.69    		 GO:0002009 ... P00918 11076507
    199 1fsr:B (2.0) BS01 CU 4.2.1.1
    4.2.1.69    		 GO:0002009 ... P00918 11076507
    200 1fun:A (2.85) BS01 CU 1.15.1.1 GO:0000302 ... P00441 9294870
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218