Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 6160 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    1201 5b5m:K (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1202 5b5m:L (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1203 5b5m:L (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1204 5b5m:L (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1205 5b5m:L (3.3) BS07 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1206 5b5m:M (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1207 5b5m:M (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1208 5b5m:N (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1209 5b5m:N (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1210 5b5m:O (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1211 5b5m:O (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1212 5b5m:P (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1213 5b5m:P (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1214 5b5m:Q (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1215 5b5m:Q (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1216 5b5m:R (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1217 5b5m:R (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1218 5b5m:S (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1219 5b5m:S (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1220 5b5m:T (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1221 5b5m:U (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1222 5b5m:U (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1223 5b5m:V (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1224 5b5m:V (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1225 5b5m:W (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1226 5b5m:W (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1227 5b5m:X (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1228 5b5m:X (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1229 5b5m:Y (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1230 5b5m:Y (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1231 5b5m:Z (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1232 5b5m:Z (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1233 5b5m:c (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1234 5b5m:c (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1235 5b5m:d (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1236 5b5m:d (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1237 5b5m:d (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1238 5b5m:e (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1239 5b5m:e (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1240 5b5m:f (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1241 5b5m:f (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1242 5b5m:g (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1243 5b5m:g (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1244 5b5m:h (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1245 5b5m:h (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1246 5b5m:i (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1247 5b5m:i (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1248 5b5m:j (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1249 5b5m:j (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1250 5b5m:k (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1251 5b5m:k (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1252 5b5m:l (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1253 5b5m:l (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1254 5b5m:l (3.3) BS06 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1255 5b5m:m (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1256 5b5m:m (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1257 5b5m:n (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1258 5b5m:n (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1259 5b5m:p (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1260 5b5m:p (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1261 5b5m:q (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1262 5b5m:q (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1263 5b5m:r (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1264 5b5m:r (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1265 5b5m:r (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1266 5b5m:s (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1267 5b5m:s (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1268 5b5m:u (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1269 5b5m:u (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1270 5b5m:u (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1271 5b5m:v (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1272 5b5m:v (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1273 5b5m:w (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1274 5b5m:w (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1275 5b5m:x (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1276 5b5m:x (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1277 5b5m:x (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1278 5b5m:x (3.3) BS07 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1279 5b5m:y (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1280 5b5m:y (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1281 5b5m:z (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1282 5b5m:z (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1283 5b5n:0 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1284 5b5n:0 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1285 5b5n:1 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1286 5b5n:1 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1287 5b5n:1 (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1288 5b5n:2 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1289 5b5n:2 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1290 5b5n:3 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1291 5b5n:3 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1292 5b5n:4 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1293 5b5n:4 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1294 5b5n:5 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1295 5b5n:5 (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1296 5b5n:6 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1297 5b5n:6 (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1298 5b5n:6 (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1299 5b5n:7 (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1300 5b5n:7 (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1301 5b5n:8 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1302 5b5n:8 (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1303 5b5n:9 (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1304 5b5n:9 (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1305 5b5n:9 (3.3) BS06 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1306 5b5n:A (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1307 5b5n:A (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1308 5b5n:AA (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1309 5b5n:AA (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1310 5b5n:AB (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1311 5b5n:AB (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1312 5b5n:AC (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1313 5b5n:AC (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1314 5b5n:AD (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1315 5b5n:AD (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1316 5b5n:AE (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1317 5b5n:AE (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1318 5b5n:AF (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1319 5b5n:AF (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1320 5b5n:AG (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1321 5b5n:AG (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1322 5b5n:AH (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1323 5b5n:AH (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1324 5b5n:AI (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1325 5b5n:AI (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1326 5b5n:AJ (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1327 5b5n:AJ (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1328 5b5n:AK (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1329 5b5n:AK (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1330 5b5n:AK (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1331 5b5n:AL (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1332 5b5n:AL (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1333 5b5n:B (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1334 5b5n:B (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1335 5b5n:D (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1336 5b5n:D (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1337 5b5n:E (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1338 5b5n:E (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1339 5b5n:F (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1340 5b5n:F (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1341 5b5n:G (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1342 5b5n:G (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1343 5b5n:I (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1344 5b5n:I (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1345 5b5n:J (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1346 5b5n:J (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1347 5b5n:K (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1348 5b5n:K (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1349 5b5n:L (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1350 5b5n:L (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1351 5b5n:L (3.3) BS06 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1352 5b5n:L (3.3) BS07 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P3 27933779
    1353 5b5n:M (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1354 5b5n:M (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1355 5b5n:M (3.3) BS06 BCL ? GO:0005515 ... A8ASG6 27933779
    1356 5b5n:N (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1357 5b5n:N (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1358 5b5n:O (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1359 5b5n:O (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1360 5b5n:P (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1361 5b5n:P (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1362 5b5n:Q (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1363 5b5n:Q (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1364 5b5n:Q (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1365 5b5n:R (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1366 5b5n:R (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1367 5b5n:S (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1368 5b5n:S (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1369 5b5n:T (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1370 5b5n:T (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1371 5b5n:U (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1372 5b5n:U (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1373 5b5n:U (3.3) BS05 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1374 5b5n:V (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1375 5b5n:V (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1376 5b5n:W (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1377 5b5n:W (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1378 5b5n:X (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1379 5b5n:X (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1380 5b5n:Y (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1381 5b5n:Y (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1382 5b5n:Z (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1383 5b5n:Z (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1384 5b5n:c (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1385 5b5n:c (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1386 5b5n:d (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1387 5b5n:d (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1388 5b5n:d (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1389 5b5n:e (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1390 5b5n:e (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1391 5b5n:f (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1392 5b5n:f (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1393 5b5n:g (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1394 5b5n:g (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1395 5b5n:h (3.3) BS02 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1396 5b5n:h (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779
    1397 5b5n:i (3.3) BS01 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1398 5b5n:i (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1399 5b5n:i (3.3) BS04 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P1 27933779
    1400 5b5n:j (3.3) BS03 BCL ? GO:0005515 ... D2Z0P2 27933779

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218