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TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
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    4804 7aiq:A (3.72) BS01 ATP ? GO:0005515 ... Q9UP95 34031912
    4805 7aiq:B (3.72) BS01 ATP ? GO:0005515 ... Q9UP95 34031912
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    4807 7air:B (3.66) BS01 ATP ? GO:0005515 ... Q9UP95 34031912
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    4809 7ak6:O (3.82) BS01 ATP ? GO:0005739 ... Q99LC3 33514727
    4810 7am2:BW (3.4) BS03 ATP ? GO:0003676 ... Q4QHU1 33168716
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    4817 7bg4:B (4.2) BS01 ATP 7.6.2.- GO:0005524 ... O06967 35080979
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    4832 7cfi:A (2.45) BS01 ATP ? N/A A0A109QFA5 33568487
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    4843 7cm9:D (2.249) BS01 ATP N/A GO:0005524 ... N/A 33970104
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    4863 7d4u:A (2.7) BS02 ATP 2.7.7.- GO:0005524 ... P0DSP4 33836064
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    3.6.4.-
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  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
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  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218