Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 832530 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.

    • Sort results by
    << < 4019 4020 4021 4022 4023 4024 4025 4026 4027 4028 4029 4030 4031 4032 4033 4034 4035 4036 4037 4038 4039 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)     		Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    805601 8q1y:G (2.6) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... P15690 38870289
    805602 8q1y:G (2.6) BS03 FES 7.1.1.2 GO:0005739 ... P15690 38870289
    805603 8q1y:I (2.6) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P42028 38870289
    805604 8q1y:I (2.6) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P42028 38870289
    805605 8q1y:M (2.6) BS01 ZN 7.1.1.2 GO:0003954 ... P03910 38870289
    805606 8q1y:O (2.6) BS01 DGT ? GO:0005737 ... P34942 38870289
    805607 8q1y:P (2.6) BS01 NDP ? GO:0005739 ... P34943 38870289
    805608 8q1y:R (2.6) BS01 ZN ? GO:0005739 ... P23934 38870289
    805609 8q1y:U (2.6) BS01 EHZ ? GO:0000035 ... P52505 38870289
    805610 8q1y:W (2.6) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... Q02366 38870289
    805611 8q1y:n (2.6) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... Q02369 38870289
    805612 8q1z:A (1.85) BS01 IKD 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q86Y07 N/A
    805613 8q25:B (2.8) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P42026 38870289
    805614 8q25:D (2.8) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P17694 38870289
    805615 8q25:E (2.8) BS01 FES 7.1.1.2 GO:0003954 ... P04394 38870289
    805616 8q25:F (2.8) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... P25708 38870289
    805617 8q25:F (2.8) BS02 FMN 7.1.1.2 GO:0005739 ... P25708 38870289
    805618 8q25:G (2.8) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... P15690 38870289
    805619 8q25:G (2.8) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... P15690 38870289
    805620 8q25:G (2.8) BS03 FES 7.1.1.2 GO:0005739 ... P15690 38870289
    805621 8q25:H (2.8) BS01 U10 7.1.1.2 GO:0003954 ... P03887 38870289
    805622 8q25:I (2.8) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P42028 38870289
    805623 8q25:I (2.8) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... P42028 38870289
    805624 8q25:M (2.8) BS01 ZN 7.1.1.2 GO:0003954 ... P03910 38870289
    805625 8q25:O (2.8) BS01 DGT ? GO:0005737 ... P34942 38870289
    805626 8q25:P (2.8) BS01 NDP ? GO:0005739 ... P34943 38870289
    805627 8q25:R (2.8) BS01 ZN ? GO:0005739 ... P23934 38870289
    805628 8q25:T (2.8) BS01 EHZ ? GO:0000035 ... P52505 38870289
    805629 8q25:W (2.8) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... Q02366 38870289
    805630 8q25:n (2.8) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... Q02369 38870289
    805631 8q28:A (1.8) BS01 CA ? N/A C5BSV8 38446458
    805632 8q28:A (1.8) BS02 MG ? N/A C5BSV8 38446458
    805633 8q28:B (1.8) BS01 CA ? N/A C5BSV8 38446458
    805634 8q28:B (1.8) BS02 MG ? N/A C5BSV8 38446458
    805635 8q29:A (1.5) BS01 CA ? N/A C5BSV8 38446458
    805636 8q29:A (1.5) BS02 MG ? N/A C5BSV8 38446458
    805637 8q29:B (1.5) BS01 CA ? N/A C5BSV8 38446458
    805638 8q29:B (1.5) BS02 MG ? N/A C5BSV8 38446458
    805639 8q2a:A (2.2) BS01 CA ? N/A C5BNC6 38446458
    805640 8q2a:B (2.2) BS01 CA ? N/A C5BNC6 38446458
    805641 8q2a:C (2.2) BS01 CA ? N/A C5BNC6 38446458
    805642 8q2e:C (1.68) BS01 IS9 3.5.1.5 GO:0005737 ... P41020 37879152
    805643 8q2e:C (1.68) BS02 NI 3.5.1.5 GO:0005737 ... P41020 37879152
    805644 8q2e:C (1.68) BS03 NI 3.5.1.5 GO:0005737 ... P41020 37879152
    805645 8q2m:AA (3.21) BS01 peptide ? GO:0003677 ... P13123 N/A
    805646 8q2o:A (1.7) BS01 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805647 8q2o:A (1.7) BS02 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805648 8q2o:A (1.7) BS03 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805649 8q2o:A (1.7) BS04 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805650 8q2o:A (1.7) BS05 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805651 8q2o:A (1.7) BS06 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805652 8q2o:A (1.7) BS07 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805653 8q2o:A (1.7) BS08 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805654 8q2o:A (1.7) BS09 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805655 8q2o:A (1.7) BS10 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805656 8q2o:A (1.7) BS11 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805657 8q2o:A (1.7) BS12 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805658 8q2o:A (1.7) BS13 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805659 8q2o:A (1.7) BS14 C8E ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805660 8q2o:A (1.7) BS15 IRY ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805661 8q2o:A (1.7) BS16 C8E ? GO:0009279 ... P18895 N/A
    805662 8q2p:A (1.9) BS01 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805663 8q2p:A (1.9) BS02 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805664 8q2p:A (1.9) BS03 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805665 8q2p:A (1.9) BS04 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805666 8q2p:A (1.9) BS05 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805667 8q2p:A (1.9) BS06 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805668 8q2p:A (1.9) BS07 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805669 8q2p:A (1.9) BS08 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805670 8q2p:A (1.9) BS09 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805671 8q2p:A (1.9) BS10 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805672 8q2p:A (1.9) BS11 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805673 8q2p:A (1.9) BS12 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805674 8q2p:A (1.9) BS13 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805675 8q2p:A (1.9) BS14 IRY 2.3.1.269 GO:0005515 ... P23930 N/A
    805676 8q2q:A (1.3) BS01 IT6 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805677 8q2q:B (1.3) BS01 IT6 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805678 8q2r:A (1.6) BS01 ITJ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805679 8q2r:B (1.6) BS01 ITJ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805680 8q2s:A (1.41) BS01 IU2 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805681 8q2s:B (1.41) BS01 IU2 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805682 8q2t:A (1.41) BS01 IUA ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805683 8q2t:B (1.41) BS01 IUA ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805684 8q2u:A (1.36) BS01 IUH ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805685 8q2u:B (1.36) BS01 IUH ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805686 8q2v:A (1.71) BS01 IUQ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805687 8q2v:B (1.71) BS01 IUQ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805688 8q2w:A (1.41) BS01 IUZ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805689 8q2w:B (1.41) BS01 IUZ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805690 8q2x:A (1.6) BS01 IV6 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805691 8q2x:B (1.6) BS01 IV6 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805692 8q2y:A (1.71) BS01 IVI ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805693 8q2y:B (1.71) BS01 IVI ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805694 8q31:A (1.32) BS01 IVR ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805695 8q31:B (1.32) BS01 IVR ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805696 8q32:A (1.43) BS01 IW0 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805697 8q32:B (1.43) BS01 IW0 ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805698 8q33:A (1.43) BS01 IWV ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805699 8q33:B (1.43) BS01 IWV ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805700 8q34:A (1.48) BS01 IX4 ? N/A O60885 39085342
    805701 8q34:B (1.48) BS01 IX4 ? N/A O60885 39085342
    805702 8q34:C (1.48) BS01 IX4 ? N/A O60885 39085342
    805703 8q34:D (1.48) BS01 IX4 ? N/A O60885 39085342
    805704 8q35:A (1.31) BS01 IWM ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805705 8q35:B (1.31) BS01 IWM ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805706 8q36:AAA (2.604) BS01 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805707 8q36:AAA (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805708 8q36:BBB (2.604) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805709 8q36:BBB (2.604) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805710 8q36:CCC (2.604) BS01 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805711 8q36:CCC (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805712 8q36:DDD (2.604) BS01 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805713 8q36:DDD (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805714 8q36:EEE (2.604) BS01 peptide ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805715 8q36:EEE (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805716 8q36:EEE (2.604) BS03 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805717 8q36:FFF (2.604) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805718 8q36:FFF (2.604) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805719 8q36:GGG (2.604) BS01 peptide ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805720 8q36:GGG (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805721 8q36:GGG (2.604) BS03 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805722 8q36:HHH (2.604) BS01 peptide ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805723 8q36:HHH (2.604) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805724 8q36:HHH (2.604) BS03 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805725 8q37:A (1.28) BS01 IWF ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805726 8q37:B (1.28) BS01 IWF ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805727 8q38:A (1.42) BS01 IZJ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805728 8q38:B (1.42) BS01 IZJ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805729 8q39:A (1.42) BS01 K1O ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805730 8q39:B (1.42) BS01 K1O ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805731 8q3a:A (1.43) BS01 IYQ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805732 8q3a:B (1.43) BS01 IYQ ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805733 8q3b:A (2.69) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805734 8q3b:A (2.69) BS02 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805735 8q3b:A (2.69) BS03 MG 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805736 8q3b:B (2.69) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42487 38383525
    805737 8q3b:I (2.69) BS01 ZN ? GO:0044423 ... Q65157 38383525
    805738 8q3b:I (2.69) BS02 ZN ? GO:0044423 ... Q65157 38383525
    805739 8q3b:J (2.69) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P42488 38383525
    805740 8q3e:AAA (2.174) BS01 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805741 8q3e:AAA (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805742 8q3e:BBB (2.174) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805743 8q3e:BBB (2.174) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805744 8q3e:CCC (2.174) BS01 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805745 8q3e:CCC (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805746 8q3e:DDD (2.174) BS01 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805747 8q3e:DDD (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805748 8q3e:EEE (2.174) BS01 peptide ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805749 8q3e:EEE (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805750 8q3e:EEE (2.174) BS03 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805751 8q3e:FFF (2.174) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805752 8q3e:FFF (2.174) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805753 8q3e:GGG (2.174) BS01 peptide ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805754 8q3e:GGG (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805755 8q3e:GGG (2.174) BS03 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805756 8q3e:HHH (2.174) BS01 peptide ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805757 8q3e:HHH (2.174) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805758 8q3e:HHH (2.174) BS03 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805759 8q3g:A (1.42) BS01 J7L ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805760 8q3g:B (1.42) BS01 J7L ? GO:0003723 ... Q96MU7 38787793
    805761 8q3k:A (2.92) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805762 8q3k:A (2.92) BS02 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805763 8q3k:A (2.92) BS03 MG 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42486 38383525
    805764 8q3k:B (2.92) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P42487 38383525
    805765 8q3k:I (2.92) BS01 ZN ? GO:0044423 ... Q65157 38383525
    805766 8q3k:I (2.92) BS02 ZN ? GO:0044423 ... Q65157 38383525
    805767 8q3k:J (2.92) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P42488 38383525
    805768 8q3m:AAA (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805769 8q3m:AAA (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805770 8q3m:BBB (2.503) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805771 8q3m:BBB (2.503) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805772 8q3m:CCC (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805773 8q3m:CCC (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805774 8q3m:DDD (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805775 8q3m:DDD (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805776 8q3m:EEE (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805777 8q3m:EEE (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... P68431 38495982
    805778 8q3m:FFF (2.503) BS01 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805779 8q3m:FFF (2.503) BS02 dna ? GO:0003677 ... P62805 38495982
    805780 8q3m:GGG (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805781 8q3m:GGG (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805782 8q3m:GGG (2.503) BS03 peptide ? GO:0000786 ... P04908 38495982
    805783 8q3m:HHH (2.503) BS01 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805784 8q3m:HHH (2.503) BS02 dna ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805785 8q3m:HHH (2.503) BS03 peptide ? GO:0000786 ... O60814 38495982
    805786 8q3n:A (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805787 8q3n:B (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805788 8q3n:B (2.63) BS02 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805789 8q3n:C (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805790 8q3n:C (2.63) BS02 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805791 8q3n:D (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805792 8q3n:E (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805793 8q3n:E (2.63) BS02 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805794 8q3n:F (2.63) BS01 ADP 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805795 8q3o:A (3.0) BS01 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805796 8q3o:B (3.0) BS01 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805797 8q3o:B (3.0) BS02 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805798 8q3o:C (3.0) BS01 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805799 8q3o:C (3.0) BS02 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    805800 8q3o:D (3.0) BS01 0O2 3.6.4.- GO:0003676 ... P0AG30 37645988
    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218