>PF04826 (250 residues) CHCKHKTNMDPRELEKLICMIEMTEEPSIHEIANNALFNSPDYPFSHEVIHNAGRISIIE SLLNNPHPSVRQKALNALNNISVAAENHRKVKTYLNQVCEDTVTYPLNSNVQLAGLRLIR HLTIISEYQHMVTNYISEFLRLLTVGGRETKEHILGMLLNFSKNPSMTKDLLIASAPTSI INIFSKKEAKENIINALLLFENINDHFKRRSRVFTQDSFSKNSLYFVFQRPKACAKKLRV LAAEYKDPEV |
Rank | PDB hit | ID1 | ID2 | Cov | Norm. Zscore | Threadingprogram | 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 | | | | | | | | | | | | | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Seq | CHCKHKTNMDPRELEKLICMIEMTEEPSIHEIANNALFNSPDYPFSHEVIHNAGRISIIESLLNNPHPSVRQKALNALNNISVAAENHRKVKTYLNQVCEDTVTYPLNSNVQLAGLRLIRHLTIISEYQHMVTNYISEFLRLLTVGGRETKEHILGMLLNFSKNPSMTKDLLIASAPTSIINIFSKKEAKENIINALLLFENINDHFKRRSRVFTQDSFSKNSLYFVFQRPKACAKKLRVLAAEYKDPEV | |||||||||||||||||||
1 | 4rxhB | 0.15 | 0.14 | 0.96 | 1.33 | DEthreader | QTPQPDWNTIAPALPVLAKLVY-SLDDEVLIDACWAISYLDGSNDKIQAVIEAGIPRRLVELLMHASTSVQTPALRSVGNIVTGDVQTQVIINGALPCLLSLLSS-NKDGIRKEACWTISNITGNSAQIQSVINIIPPLIHLLSHADLKTRKEACWAISNATSGPDQIRYLVAQGCIKPLCDLLA-CPDNKIIQVALDGLENILKVGELDKNA-A-----INRYALFIEEC-GGMEKIHDCQT-NANEEI | |||||||||||||
2 | 4knhA | 0.08 | 0.08 | 1.00 | 1.33 | DEthreader | SLAAAHNFLLDETWSQIFKELEYFKIESMLECYLRLIAKLAESEIARKRLIMDNLVDTILKLSVGVIHRLRACIFYVLKALMIRKTELDAMWRWVEWMTMMMFREGTGFEQSNAFIQLLTTLLVPVPFPLGIEPYVDFVFDVFATILRILRLSCLDFVMVCLVTFHPFSRVMEWNVITSLINTIHQDLLVVSILRAIQVMIKALELQETYLHRP-LPANAYSAFEDGILSHLSLVVDLGKYCNLGHAELA | |||||||||||||
3 | 4rxhB | 0.16 | 0.15 | 0.96 | 1.92 | HHpred | CRPQPDWNTIAPALPVLAKLV-YSLDDEVLIDACWAISYLSDGSDKIQAVIEAGIPRRLVELLMHASTSVQTPALRSVGNIVTDDVQTQVINCGALPCLLSLLSSN-KDGIRKEACWTISNITAGNSQIQSVINIIPPLIHLLSHADLKTRKEACWAISNATSGPDQIRYLVAQGCIKPLCDLLACPD-NKIIQVALDGLENILKVGELDKNA-----ASINRYALFIEEC-GGMEKIHDCQ-TNANEEI | |||||||||||||
4 | 4rv1A | 0.16 | 0.15 | 0.96 | 0.59 | DisCoVER | ARAASDIKVDAGGVEVLVKLLT-STDSEVQKEAARALANIASGDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIASPDEAIKAIVGGVEVLVKLLT-S-TDSEVQKEAARALANIASGPTAIKAIVGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIASGPDAIKAIVDAGGVEVLVKLLTST-DSEVQKEAARALANIASGPDEAIKAIVD--A--GGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANI- | |||||||||||||
5 | 5xjgA | 0.16 | 0.16 | 0.96 | 0.30 | MRFsearch | ---NKHKIATSGALIPLTKLAKS-KHIRVQRNATGALLNMTHSEENRKELVNAGAVPVLVSLLSSTDPDVQYYCTTALSNIAVDEANRKKLAQTEPRLVSKLVSLMPSSRVKCQATLALRNLASDTSYQLEIAGGLPHLVKLIQSDSIPLVLASVACIRNISIHPLNEGLIVDAGFLKPLVRLLDYKDSEEIQCHAVSTLRNLAASSEKNRKEFFES-GAVEKCKELALPVSVQSEISACFAILA----- | |||||||||||||
6 | 4hxtA | 0.16 | 0.15 | 0.94 | 1.37 | SPARKS-K | -----------NDVEKLVKLL-TSTDSETQKEAARDLAEIAGPASAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDGVEVLVKLL-TST-DSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIASPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTST-DSEVQKEAARALANIASGPTSAIKAIVDA-GGVEVLQKLLTSDSEVQKEAQRALENIKSGGW | |||||||||||||
7 | 4rv1A | 0.17 | 0.16 | 0.97 | 0.63 | MAPalign | --EAIKAIVDAGGVEVLVKLLT-STDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPTSAIKAIVDGVEVLV-KLLTS-TDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLT-STDSEVQKEAARALANIASGPDEAIKAIVDAGG-VEVLVKLLTSTSEVQKEAARALANIASGP- | |||||||||||||
8 | 4rv1A | 0.17 | 0.17 | 0.99 | 0.44 | CEthreader | PASAIKAIVDAGGVEVLVKLL-TSTDSEVQKEAARALANISGPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDAGVEVLVKLLTST-DSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPTSAIKAIVDAGGVEVLVKLLT-STDSEVQKEAARALANIASGPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIASGPD | |||||||||||||
9 | 4hxtA | 0.17 | 0.16 | 0.94 | 1.19 | MUSTER | -----------NDVEKLVKLLT-STDSETQKEAARDLAEIAGPASAIKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDAGVEVLVKLLTST-DSEVQKEAARALANIASGPDKAIVDAGGVEVLVKLLTSTDSEVQKEAARALANIAGPDEAIKAIVDAGGVEVLVKLLTST-DSEVQKEAARALANIASGPTSAIKAIV-DAGGVEVLQKLLTSTDSEVQKEAQRALENSGGWL | |||||||||||||
10 | 4r0zA | 0.13 | 0.12 | 0.98 | 1.05 | HHsearch | EDPNFFNAPGFSFVEALMAAS-KSSNVNVRRNAIGALSHMSEQRGGPLLIFRSGGLAEIIRMLYDSLESVVHYAVTTLRNLLMHVSDRAQAALNAVEALTPHLHKT-NPKLLAQVADGLYFLLIDDASKITFLLGPQILVSILREDHRKLIYTVVRCIRSLSVCPSNKPALISLGCLPALYVELCTKD-ERSQTAILVAMRNLSDLQTNLIELTQEGHTAVSLTMDILRRAPPFLDLLHRLL-AHPDEVL | |||||||||||||
|
|
References: | |
1. | Wei Zheng, Yang Li, Chengxin Zhang, Robin Pearce, S. M. Mortuza, Yang Zhang. "Deep-learning contact-map guided protein structure prediction in CASP13." Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 87: 1149-1164 (2019). |