[back to server]

Format of user-specified templates

[See PDB format]


  User can specify up to 40 templates with the following format.

  1, Use only CA atoms with PDB format
  2, Use "TER" to end every template
  3, Templates can just be parts of the full-length model
  4, Be sure your templates are agree with your input sequence



An example

ATOM      1  CA  ASP     1      27.500  11.500  25.500
ATOM      2  CA  ILE     2      30.500  12.500  22.500
ATOM      3  CA  LEU     3      27.500  14.500  20.500
ATOM      4  CA  LYS     4      24.500  15.500  22.500
ATOM      5  CA  ALA     5      23.500  15.500  26.500
ATOM      6  CA  SER     6      19.500  15.500  26.500
ATOM      7  CA  ALA     7      17.500  16.500  29.500
ATOM      8  CA  THR     8      13.500  16.500  30.500
ATOM      9  CA  GLN     9      10.500  18.500  31.500
TER
ATOM      1  CA  ASP     1      28.725  11.868  23.400
ATOM      2  CA  ILE     2      27.785  13.916  20.292
ATOM      3  CA  LEU     3      24.651  15.048  22.035
ATOM      4  CA  LYS     4      22.717  14.731  25.265
ATOM      5  CA  ALA     5      19.262  15.709  26.504
ATOM      6  CA  SER     6      17.388  16.575  29.644
ATOM      7  CA  ALA     7      13.598  16.525  29.834
ATOM      8  CA  THR     8      11.010  18.398  31.810
TER