BioLiP

>protein
YKKIITSESVGAGHPDKICDQISDAILDECLSQDQNSRVACEVLACNRLIVIAGEITTHAYVDVVKTAWEIIKPLGYDEN
DFTIISNVNKQSVDIAQSVDKTNKNLIGAGDQGIVFGYACDETPQYMPLTSVLAHELLKEIERQRRSKEFIKIQADMKSQ
VSIDYSNSTPLIETMLVSIQHDEDYDVEYFNKKVSAIMEQIAKKYNLNTNFKKIINSSGRFVIGGPIGDTGLTGRKIIVD
TYGGVGHHGGGAFSGKDPTKVDRSASYFARWIAKNVVAAKLAKQCEIQLAFAIGQPQPVAMYVNTFNTNLIDETKIFEAI
KKSFNFDIKTFINDLNLWTTKYLPVATYGHFGRDDLDLSWEKLNKVEDLIKNS

The query sequence (length=373) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6rk7:E	375	373	1.0000	0.9947	1.0000	0.0	6rk7:A, 6rk7:B, 6rk7:F, 6rk7:H, 6rk7:G, 6rka:A, 6rka:B, 6rka:C, 6rka:D, 6rkc:A, 6rkc:B, 6rkc:D, 6rkc:C, 6rkc:E, 6rkc:F, 6rkc:G, 6rkc:H
2	3s82:B	376	378	0.4424	0.4388	0.4365	1.17e-109	3rv2:A, 3s82:A
3	7loz:B	390	380	0.4531	0.4333	0.4447	5.74e-107	7ll3:A, 7ll3:B, 7lnn:A, 7lnn:B, 7lo2:A, 7lo2:B, 7lo2:C, 7lo2:D, 7loo:A, 7loo:Q, 7loo:B, 7loo:R, 7low:A, 7low:B, 7loz:A, 1mxa:A, 1mxb:A, 1mxc:A, 1p7l:A, 1p7l:B, 1p7l:C, 1p7l:D, 7r2w:A, 1rg9:A, 1rg9:B, 1rg9:C, 1rg9:D, 1xra:A
4	8jzg:B	390	379	0.4316	0.4128	0.4248	1.93e-104	8jzg:A, 8jzg:D, 8jzg:C
5	5t8s:A	388	382	0.4692	0.4510	0.4581	6.73e-103	5t8s:B, 5t8t:A, 5t8t:B
6	7r3b:C	371	371	0.4611	0.4636	0.4636	6.83e-103	7r3b:A, 7r3b:B, 7r3b:D, 7r3b:E, 7r3b:F, 7r3b:G, 7r3b:H
7	8p4h:A	388	379	0.4611	0.4433	0.4538	4.99e-96	5a19:A, 5a1g:A, 5a1i:A, 8axz:A, 7bhr:A, 7bhs:A, 7bht:A, 7bhu:A, 7bhv:A, 7bhw:A, 7bhx:A, 6fbn:A, 6fbo:A, 6fbp:A, 6fbp:B, 6fcb:A, 6fcd:A, 6g6r:A, 7kcc:A, 7kce:A, 7kcf:A, 7kda:A, 7kdb:A, 4ktt:B, 4ktt:D, 4ktv:A, 4ktv:B, 4ktv:D, 7l1a:A, 7lnh:A, 7lnh:B, 4ndn:A, 4ndn:B, 4ndn:D, 8oog:A, 2p02:A, 8p1t:AAA, 8p1v:AAA, 8p1w:AAA, 8p4h:B, 8p4h:C, 8p4h:D, 6p9v:A, 8qdy:A, 8qdz:A, 8qe0:A, 8qe1:A, 8qe2:A, 8qe3:A, 7rw5:A, 7rw5:B, 7rw5:C, 7rw7:A, 7rwg:A, 7rwh:A, 7rxv:A, 7rxw:A, 7rxx:A, 5ugh:A, 5ugh:C, 5ugh:D, 6wkb:A, 6wkb:B, 8xam:A, 8xam:B, 8xar:A, 8xb0:A
8	6vd1:A	395	378	0.4504	0.4253	0.4444	8.46e-96	6vcy:A, 6vd0:A, 6vd0:B, 6vd0:C, 6vd0:D, 6vd1:B, 6vd2:A, 6vd2:B
9	2obv:A	384	378	0.4531	0.4401	0.4471	4.43e-95	1o90:A, 1o90:B, 1o92:A, 1o92:B, 1o93:A, 1o93:B, 1o9t:A, 1o9t:B, 8swa:A
10	4odj:A	386	382	0.4450	0.4301	0.4346	1.03e-88	6c07:A, 6c07:B, 6c07:C, 6ltv:A, 6ltv:B
11	5ugh:B	365	371	0.4236	0.4329	0.4259	3.01e-86	6fbn:B, 4ktt:A, 4ktt:C, 4ktv:C, 4ndn:C, 7rw5:D
12	8sny:A	1388	187	0.1126	0.0303	0.2246	0.11	8fu3:A, 8snx:A
13	8fpi:A	1357	187	0.1126	0.0310	0.2246	0.21
14	5k6x:A	374	33	0.0349	0.0348	0.3939	1.1	5k6y:A
15	7p84:C	408	356	0.2011	0.1838	0.2107	1.5	7p84:A, 7p8m:A, 7p8m:C
16	7w1m:E	1226	90	0.0590	0.0179	0.2444	3.2	6wg3:E, 6wge:E
17	8k21:E	295	42	0.0375	0.0475	0.3333	4.4	8k21:d, 8k21:e, 8k21:D, 8k22:E, 8k22:d, 8k22:e, 8k22:D, 8k23:E, 8k23:d, 8k23:e, 8k23:D, 8k24:d, 8k24:e, 8k24:E, 8k24:D, 8k25:d
18	8a5q:U	606	166	0.0885	0.0545	0.1988	4.7	8a5d:U, 8a5p:U
19	7u7h:A	423	80	0.0563	0.0496	0.2625	6.2	7u7h:B
20	6s83:A	400	355	0.2038	0.1900	0.2141	7.1	6s83:B, 6s83:C, 6s83:D, 6s83:E, 6s83:F, 6s83:G, 6s83:H
21	1wl4:A	394	49	0.0402	0.0381	0.3061	8.9

[Back]