BioLiP

>protein
WIFHALVFSYISFALISDKRYQKKEPLISSVHTKVKGIAEVKAEILENGMKKMVSGVFDTADYTFPLQGNSFFVMTNFIK
TEGQQQGLCPDFPTARTICSSDRGCKKGRMDPQSKGIQTGRCVVYKERLKTCEVSAWCPIEEVKDAPRPALLNSAENFTV
LIKNNIDFPGHNYTTRNILPGVNITCTFHKTQNPQCPIFRLGDIFQETGDSFSDVAIQGGIMGIEIYWDCNLDGWFHHCR
PKYSFRRLDDKTTSESLYPGYNFRYAKYYKENNVEKRTLIKVFGIRFDILVFGTGGKFNVIQLAVYIGSVISYFGLATVF

The query sequence (length=320) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5u1x:A	321	320	1.0000	0.9969	1.0000	0.0	8jv7:A, 8jv7:B, 8jv7:C, 8jv8:A, 8jv8:B, 8jv8:C, 5u1u:A, 5u1y:A
2	6u9w:A	562	319	0.7688	0.4377	0.7712	0.0	8tr5:A, 8tr5:B, 8tr5:C, 8trj:A, 8trj:C, 8trj:B, 6u9v:A, 6u9v:B, 6u9v:C, 6u9w:B, 6u9w:C, 8v4s:A, 8v4s:B, 8v4s:C
3	5xw6:C	320	319	0.5188	0.5188	0.5204	2.30e-121	5xw6:B, 5xw6:A
4	4dw1:A	324	324	0.4813	0.4753	0.4753	4.72e-104	8jv5:A, 8jv5:B, 8jv5:C, 8jv6:A, 8jv6:B, 8jv6:C, 5wzy:A
5	6ah4:B	357	327	0.4375	0.3922	0.4281	4.48e-80	6ah4:C, 6ah4:A, 6ah5:C, 6ah5:A, 6ah5:B, 9ik1:A, 9ik1:B, 9ik1:C, 5svk:A, 5svk:B, 5svl:A, 5svl:B, 5svm:A, 5svm:B, 5svp:A, 5svp:B, 5svq:A, 5svr:A, 5yve:A
6	5f1c:B	355	342	0.4062	0.3662	0.3801	4.07e-65	5f1c:A, 5f1c:C
7	7s7j:A	84	89	0.0875	0.3333	0.3146	0.23
8	9ata:A	306	89	0.0656	0.0686	0.2360	2.0	9ata:B, 9atd:A, 9ate:A, 9ate:B, 9atf:A, 9atg:A, 9ath:A, 9ath:B, 9ati:A, 9atj:A, 9ats:A, 9att:A, 9att:B, 9boo:A, 8czt:A, 8czu:A, 8czv:A, 7d3c:A, 7d3c:B, 8dgy:A, 8e6b:A, 8e6b:B, 8e6c:A, 8e6d:A, 8e6e:A, 7ene:A, 7ene:B, 7ene:C, 7ene:D, 8hut:A, 8hut:B, 8ig6:A, 8ig6:B, 8j34:A, 8j34:B, 4rsp:A, 7t3y:A, 7t3y:B, 7t3z:A, 7t3z:B, 7t40:A, 7t41:A, 7tq7:A, 7tq8:A, 6vgy:A, 6vgy:B, 6vgz:A, 6vgz:B, 6vh0:A, 6vh0:B, 6vh1:A, 6vh1:B, 6vh2:A, 6vh2:B, 6vh3:A, 6vh3:B, 7vtc:A, 5wkj:A, 5wkk:A, 5wkl:A, 5wkm:A, 7wqj:A, 7xry:A, 7xry:B, 4ylu:A, 4ylu:B, 4ylu:C, 4ylu:D
9	6pv4:C	608	69	0.0625	0.0329	0.2899	2.2	6pv4:A, 6pv4:B, 6pv4:D
10	4yo9:A	306	89	0.0688	0.0719	0.2472	2.3	2ynb:B, 4yog:A, 4yog:B, 4yoi:A, 4yoi:B, 4yoj:A, 4yoj:B
11	4l92:B	391	31	0.0437	0.0358	0.4516	4.5	4l92:A, 4l97:A, 4l97:B, 4l99:A, 4l99:B, 4rga:A, 4rga:B, 4rgg:A, 4rgg:B
12	5kvv:A	327	37	0.0406	0.0398	0.3514	6.0	5kvv:B
13	8que:D	654	31	0.0344	0.0168	0.3548	9.3	7ogr:D
14	7ogp:D	510	31	0.0344	0.0216	0.3548	9.5

[Back]