BioLiP

>protein
VVSIPINNAGFEDPFIEVVDDYTVDTPPGWTTYNPNNLVPEKRTTWTSNNGVGYVGPGTQFYNQLAPEGRNIGYIYLAQK
PGSGVAGFEQILDATLEPDTNYTLKVDVGNLAGTFKGLSFAGFPGYRVELLAGDTVLAADHNNLFIKEGEFKTSTVTYTS
TAKDLHLGQKLGIRLVNLLQDKFSGLDFDNVRLTAEPT

The query sequence (length=198) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6j03:A	200	198	0.9343	0.9250	0.9343	1.53e-136	6a92:A, 6a92:B, 6a92:C, 6a92:D, 6adu:A, 6adu:B, 6adu:C, 6adu:D, 5yvk:A, 5yvp:A, 5yvp:B, 5yvp:C, 5yvp:D, 5z53:A, 5z53:B, 5z53:C, 5z53:D, 5zfj:A, 5zfj:B, 5zfj:C, 5zfj:D
2	5yvl:D	206	197	0.8838	0.8495	0.8883	6.54e-128	6al6:A, 6al6:B, 6al7:A, 6al7:B, 6al7:D, 6al7:E, 6al8:A, 6al8:B, 6al8:D, 6al8:E, 5wpp:A, 5wpp:B, 5wpr:A, 5wps:A, 5wpu:A, 5yvl:A, 5yvl:B, 5yvl:C, 5z54:A, 5z54:B, 5z54:C, 5z54:D
3	6a8x:A	203	197	0.6616	0.6453	0.6650	2.32e-98	6a8x:B, 6a98:A, 6a98:B, 6a98:C, 6a98:D, 6a99:A, 6a99:B, 6a99:C, 6a99:D, 6a9f:A, 6a9f:B, 6a9f:C, 6a9f:D
4	1w52:X	448	56	0.0909	0.0402	0.3214	0.009
5	4cyg:A	463	54	0.0707	0.0302	0.2593	2.9	4cyg:B, 7slv:A, 7slx:A, 7sly:A
6	4hhz:D	296	61	0.0657	0.0439	0.2131	3.6
7	5xsu:C	328	61	0.0657	0.0396	0.2131	3.8	4hhy:D, 4uxb:A
8	5huq:A	433	49	0.0808	0.0370	0.3265	4.4	6c1w:A, 6c1w:B, 6c1w:C, 8ezf:B, 8ezh:B, 8ezi:B, 5huq:B
9	8p84:B	450	52	0.0859	0.0378	0.3269	4.8	8p84:A
10	8g0h:D	475	61	0.0657	0.0274	0.2131	5.5	5a00:A, 7aab:A, 7aab:B, 7aac:A, 7aac:B, 7aad:A, 7aad:B, 6bhv:A, 6bhv:B, 6bhv:C, 6bhv:D, 7cmw:A, 7cmw:B, 4dqy:C, 4dqy:F, 5ds3:A, 8fyy:A, 8fyz:B, 8fyz:A, 8fz1:A, 8fz1:B, 8g0h:B, 6ghk:A, 6ghk:B, 3gjw:A, 3gn7:A, 4gv7:A, 4gv7:B, 4gv7:C, 4gv7:D, 5ha9:B, 8he7:A, 8he7:B, 4hhy:A, 4hhy:B, 4hhy:C, 4hhz:A, 4hhz:B, 4hhz:C, 8hlr:A, 8hlr:B, 8jnz:A, 8jnz:B, 7kk3:A, 7kk3:B, 7kk3:C, 7kk3:D, 7kk4:A, 7kk4:B, 7kk5:A, 7kk5:B, 7kk5:C, 7kk5:D, 7kk6:A, 7kk6:B, 5kpn:A, 5kpn:B, 5kpo:A, 5kpo:B, 5kpp:A, 5kpp:B, 5kpq:A, 5kpq:B, 3l3l:A, 3l3m:A, 4l6s:A, 4l6s:B, 6m3i:B, 6nrf:A, 6nrg:A, 6nrh:A, 6nri:A, 6nrj:A, 6ntu:A, 7onr:A, 7onr:B, 7ons:A, 7ons:B, 7ont:A, 7ont:B, 4opx:C, 4opx:F, 4oqa:C, 4oqa:F, 4oqb:C, 4oqb:F, 4pjt:A, 4pjt:B, 4pjt:C, 4pjt:D, 4r5w:A, 4r5w:B, 4r6e:A, 4r6e:B, 4r6e:C, 4r6e:D, 2rcw:A, 2rd6:A, 4rv6:A, 4rv6:B, 7s68:B, 7s6h:B, 7s6h:D, 7s6m:D, 7s6m:B, 7s81:C, 8u4w:A, 8u4w:B, 8u4w:C, 8u4w:D, 1uk0:A, 1uk0:B, 1uk1:A, 1uk1:B, 4und:A, 4und:B, 4uxb:B, 6vkk:A, 6vkk:D, 6vkk:C, 6vkk:B, 6vko:A, 6vko:B, 6vko:C, 6vko:D, 6vkq:A, 6vkq:B, 6vkq:C, 6vkq:D, 1wok:A, 1wok:B, 1wok:C, 1wok:D, 5wrq:A, 5wrq:B, 5wry:A, 5wry:B, 5wrz:A, 5wrz:B, 5ws0:A, 5ws0:B, 5ws1:A, 5ws1:B, 5wtc:A, 5wtc:B, 5xsr:A, 5xst:A, 5xsu:A, 5xsu:B, 5xsu:D, 6xvw:A, 6xvw:B, 4zzz:A, 4zzz:B
11	3t6s:B	342	23	0.0455	0.0263	0.3913	7.2
12	6nz4:A	467	34	0.0606	0.0257	0.3529	8.3	6nz4:B, 6nz5:B, 6nz6:A, 6nz6:B

[Back]