BioLiP

>protein
VTYTFLGPQGTFTEAALMQVPGAADATRIPCTNVNTALERVRAGEADAAMVPIENSVEGGVTATLDAIATGQELRIIREA
LVPITFVLVARPGVELSDIKRISTHGHAWAQCRLWVDEHLPNADYVPGSSTAASAMGLLEDDAPYEAAICAPLIAAEQPG
LNVLAEDIGDNPDAVTRFILVSRPGALPERTGADKTTVVVPLPEDHPGALMEILDQFASRGVNLSRIESRPTGQYLGHYF
FSIDADGHATDSRVADALAGLHRISPATRFLGSYARADKQPAVVAPHTSDAAFASAHAWVDSILKG

The query sequence (length=306) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3mwb:A	306	306	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3mwb:B
2	6vh5:D	282	278	0.2876	0.3121	0.3165	3.87e-32	6vh5:A, 6vh5:C, 6vh5:B
3	2qmx:A	278	277	0.2614	0.2878	0.2888	5.58e-28	2qmx:B
4	7am0:B	278	272	0.2843	0.3129	0.3199	2.69e-21	7am0:A, 7am0:C, 7am0:D
5	3luy:A	326	288	0.2582	0.2423	0.2743	1.71e-17
6	7alz:A	194	182	0.1569	0.2474	0.2637	7.22e-06	7alz:B
7	7alz:A	194	58	0.0654	0.1031	0.3448	2.2	7alz:B
8	5jk5:A	400	42	0.0490	0.0375	0.3571	0.16	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
9	5fii:B	78	25	0.0425	0.1667	0.5200	0.38	5fii:A, 5fii:C, 5fii:D
10	6p81:A	440	155	0.1209	0.0841	0.2387	0.55	7az5:A, 7az5:B, 7az5:C, 7az5:D, 7az6:A, 7az7:A, 7az8:A, 7az8:B, 7azc:A, 7azc:C, 7azc:B, 7azc:D, 7azd:A, 7azd:B, 7azd:D, 7azd:C, 7aze:A, 7aze:B, 7azf:A, 7azf:D, 7azf:B, 7azf:C, 7azg:A, 7azg:C, 7azg:B, 7azg:D, 7azg:E, 7azg:G, 7azg:F, 7azg:H, 7azk:A, 7azk:B, 7azk:C, 7azk:D, 7azl:A, 7azl:B, 7azl:C, 7azl:D, 3bep:B, 3bep:A, 8cix:A, 8ciy:A, 8ciz:A, 8ciz:B, 3d1e:A, 3d1f:A, 3d1f:B, 3d1g:A, 3d1g:B, 3f1v:A, 3f1v:B, 6fvl:A, 6fvl:B, 6fvl:C, 6fvl:D, 6fvm:A, 6fvm:B, 5jne:C, 5jne:G, 4k3k:A, 4k3k:B, 4k3l:A, 4k3l:B, 4k3m:A, 4k3m:B, 4k3o:A, 4k3o:B, 4k3p:A, 4k3q:A, 4k3q:B, 4k3r:A, 4k3s:A, 4k74:A, 4k74:B, 5m1s:C, 4mjp:B, 4mjq:A, 4mjq:B, 4mjr:A, 4mjr:B, 4n94:A, 4n94:B, 4n95:A, 4n96:A, 4n96:B, 4n97:A, 4n97:B, 4n98:A, 4n98:B, 4n99:A, 4n99:B, 4n9a:A, 4n9a:B, 1ok7:B, 4ovf:A, 4ovf:B, 4ovg:A, 4ovg:B, 4ovh:A, 8pat:A, 8pay:A, 4pnu:A, 4pnu:B, 4pnv:A, 4pnv:B, 4pnw:A, 4pnw:B, 3q4j:B, 3q4j:C, 3q4j:D, 3q4j:E, 3q4j:F, 3q4k:A, 3q4k:B, 3q4l:A, 3q4l:B, 3qsb:A, 3qsb:B, 3v62:A, 3v62:D, 8var:G
11	1aom:B	559	45	0.0523	0.0286	0.3556	0.77	1aof:A, 1aof:B, 1aom:A, 1aoq:A, 1aoq:B, 1dy7:A, 1dy7:B, 1e2r:A, 1e2r:B, 1gq1:A, 1gq1:B, 1h9x:A, 1h9x:B, 1h9y:A, 1h9y:B, 1hcm:A, 1hcm:B, 1hj3:A, 1hj3:B, 1hj4:A, 1hj4:B, 1hj5:A, 1hj5:B, 1qks:A, 1qks:B
12	5h81:B	354	36	0.0523	0.0452	0.4444	0.89	5h81:A, 5h82:A, 5h82:B
13	4gme:A	403	63	0.0556	0.0422	0.2698	3.1	4gme:C, 3vcn:A, 3vcn:C
14	5fgj:A	428	36	0.0458	0.0327	0.3889	3.2	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
15	3zyp:A	218	52	0.0490	0.0688	0.2885	4.0
16	1ko5:A	172	70	0.0686	0.1221	0.3000	4.6	1ko5:B, 1ko8:A, 1kof:A, 1kof:B
17	6f4v:A	341	52	0.0425	0.0381	0.2500	7.6
18	4fi4:A	407	63	0.0523	0.0393	0.2540	9.0	4fi4:B, 4fi4:C
19	8bf3:B	348	23	0.0327	0.0287	0.4348	9.8	8bf3:A

[Back]