Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VPRGSHMDKQYPVRQWAHGADLVVSQLEAQGVRQVFGIPGAKIDKVFDSLLDSSIRIIPVRHEANAAFMAAAVGRITGKA
GVALVTSGPGCSNLITGMATANSEGDPVVALGGAVKRADKAKQVHQSMDTVAMFSPVTKYAIEVTAPDALAEVVSNAFRA
AEQGRPGSAFVSLPQDVVDGPVSGKVLPASGAPQMGAAPDDAIDQVAKLIAQAKNPIFLLGLMASQPENSKALRRLLETS
HIPVTSTYQAAGAVNQDNFSRFAGRVGLFNNQAGDRLLQLADLVICIGYSPVEYEPAMWNSGNATLVHIDVLPAYEERNY
TPDVELVGDIAGTLNKLAQNIDHRLVLSPQAAEILRDRQHQRELNQFALHPLRIVRAMQDIVNSDVTLTVDMGSFHIWIA
RYLYSFRARQVMISNGQQTMGVALPWAIGAWLVNPERKVVSVSGDGGFLQSSMELETAVRLKANVLHLIWVDNGYNMVAI
QEEKKYQRLSGVEFGPMDFKAYAESFGAKGFAVESAEALEPTLRAAMDVDGPAVVAIPVDYRDNPLLMGQLHLSQIL

The query sequence (length=557) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5dx6:B 557 557 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
2 4rji:C 555 538 0.5045 0.5063 0.5223 0.0 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
3 6lpi:B 539 541 0.2855 0.2950 0.2939 1.07e-62 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
4 6u9d:B 607 556 0.2747 0.2521 0.2752 3.83e-55 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
5 6wo1:A 551 534 0.2693 0.2722 0.2809 1.12e-52
6 1t9b:A 583 546 0.2675 0.2556 0.2729 2.79e-52 1t9d:B, 1t9d:C
7 6deq:A 601 554 0.2675 0.2479 0.2690 6.09e-52 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
8 5k2o:A 585 561 0.2675 0.2547 0.2656 2.02e-51 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
9 7egv:A 590 547 0.2585 0.2441 0.2633 8.33e-49 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
10 6vz8:D 531 487 0.2406 0.2524 0.2752 2.63e-47 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
11 2ihv:A 563 538 0.2711 0.2682 0.2807 3.62e-46 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
12 4fee:A 586 512 0.2585 0.2457 0.2812 2.30e-45 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
13 4qq8:C 569 552 0.2729 0.2671 0.2754 3.80e-44 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
14 1y9d:D 560 507 0.2531 0.2518 0.2781 1.82e-43 1y9d:A, 1y9d:C
15 3ey9:A 571 531 0.2549 0.2487 0.2674 4.55e-43 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
16 8i01:A 594 540 0.2549 0.2391 0.2630 1.08e-41 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
17 7pt4:B 584 552 0.2855 0.2723 0.2880 2.53e-41 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
18 6xn8:A 540 550 0.2657 0.2741 0.2691 6.89e-39 6xn8:B
19 2dji:A 590 559 0.2567 0.2424 0.2558 9.74e-36 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
20 5ahk:A 555 545 0.2388 0.2396 0.2440 2.58e-34 5ahk:B
21 4d5e:B 587 551 0.2496 0.2368 0.2523 3.86e-34 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
22 8rph:D 608 562 0.2316 0.2122 0.2295 1.41e-30 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
23 2q28:A 550 561 0.2442 0.2473 0.2424 1.39e-29 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
24 2ji6:A 559 556 0.2406 0.2397 0.2410 6.86e-28 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
25 7b2e:A 548 552 0.2442 0.2482 0.2464 5.25e-27 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
26 9ev3:A 577 546 0.2370 0.2288 0.2418 3.38e-26 9ev5:A, 9ev5:B, 9ev5:C, 9ev5:D, 9ev6:A, 9ev6:B, 9ev6:C, 9ev6:D
27 6u9d:R 416 240 0.1418 0.1899 0.3292 8.52e-26
28 9ev4:A 553 449 0.1993 0.2007 0.2472 5.64e-24
29 6a50:A 527 533 0.2190 0.2315 0.2289 6.25e-19 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
30 4q9d:B 519 534 0.2190 0.2351 0.2285 7.13e-19 4q9d:A
31 7orx:CCC 531 544 0.2280 0.2392 0.2335 2.72e-18 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
32 2q5l:A 538 555 0.2298 0.2379 0.2306 1.20e-17 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
33 4k9q:A 531 531 0.2011 0.2109 0.2109 1.34e-17 4k9q:B
34 2vbf:B 546 571 0.2190 0.2234 0.2137 1.69e-17 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
35 6vgs:BBB 543 513 0.1867 0.1915 0.2027 2.00e-17 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
36 6qsi:A 525 528 0.2226 0.2362 0.2348 1.23e-16 6qsi:B
37 8rph:F 520 192 0.0952 0.1019 0.2760 1.46e-13
38 8rph:F 520 176 0.0718 0.0769 0.2273 3.87e-08
39 5npu:A 547 553 0.2226 0.2267 0.2242 5.92e-13 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
40 2vjy:A 562 490 0.1957 0.1940 0.2224 1.23e-12 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
41 8hp4:A 540 477 0.1903 0.1963 0.2222 8.42e-12 8hp4:B
42 6efg:D 537 479 0.1921 0.1993 0.2234 2.21e-11 6efg:A, 6efg:B
43 1ovm:A 535 555 0.2190 0.2280 0.2198 8.02e-11 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
44 2vk1:A 562 538 0.2101 0.2082 0.2175 1.08e-10 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
45 2vbi:A 554 528 0.2083 0.2094 0.2197 2.31e-10 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
46 5tma:A 567 189 0.0808 0.0794 0.2381 8.54e-08 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
47 5euj:E 556 172 0.0682 0.0683 0.2209 3.39e-04 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
48 4cok:B 549 176 0.0718 0.0729 0.2273 0.003 4cok:A
49 7tin:B 556 134 0.0575 0.0576 0.2388 0.040 7tin:A, 7tin:C, 7tin:D
50 1jwq:A 179 94 0.0467 0.1453 0.2766 0.24
51 2jkg:A 165 78 0.0395 0.1333 0.2821 0.48
52 2x7j:A 579 197 0.0808 0.0777 0.2284 0.76 2x7j:B, 2x7j:C, 2x7j:D
53 3o3m:C 401 37 0.0287 0.0399 0.4324 1.2 3o3m:A, 3o3n:A, 3o3n:C, 3o3o:A
54 6yle:C 545 83 0.0377 0.0385 0.2530 1.6
55 6p7u:C 410 98 0.0413 0.0561 0.2347 2.3 6pk2:C, 6pk2:G, 6prw:C, 6prw:G, 6tzv:C, 6tzv:G
56 4g2r:B 441 98 0.0413 0.0522 0.2347 2.5 4g2r:A, 6p7u:A, 6p7u:B, 6p7u:D, 6pk2:A, 6pk2:B, 6pk2:D, 6pk2:E, 6pk2:F, 6pk2:H, 6prw:A, 6prw:B, 6prw:D, 6prw:E, 6prw:F, 6prw:H, 6tzv:A, 6tzv:B, 6tzv:D, 6tzv:E, 6tzv:F, 6tzv:H
57 4p8b:A 314 86 0.0467 0.0828 0.3023 3.4
58 7m6b:A 244 120 0.0503 0.1148 0.2333 3.5 7m6b:B
59 5ej4:A 556 140 0.0521 0.0522 0.2071 4.3 5ej4:B, 5ej4:C, 5ej4:D, 5ej4:E, 5ej4:F, 5ej4:G, 5ej4:H, 5ej5:A, 5ej5:B, 5ej5:C, 5ej5:D, 5ej5:E, 5ej5:F, 5ej5:G, 5ej5:H, 5ej6:A, 5ej6:B, 5ej6:C, 5ej6:D, 5ej6:E, 5ej6:F, 5ej6:G, 5ej6:H, 5ej7:A, 5ej7:B, 5ej7:C, 5ej7:D, 5ej7:E, 5ej7:F, 5ej7:G, 5ej7:H, 5ej8:A, 5ej8:B, 5ej8:C, 5ej8:D, 5ej8:E, 5ej8:F, 5ej8:G, 5ej8:H, 5ej9:A, 5ej9:B, 5ej9:C, 5ej9:D, 5ej9:E, 5ej9:F, 5ej9:G, 5ej9:H, 5eja:A, 5eja:B, 5eja:C, 5eja:D, 5eja:E, 5eja:F, 5eja:G, 5eja:H, 5ejm:A, 5ejm:B, 5ejm:C, 5ejm:D, 5ejm:E, 5ejm:F, 5ejm:G, 5ejm:H, 3hww:A, 3hwx:A, 3hwx:B, 3hwx:I, 3hwx:J, 3hwx:R, 3hwx:S, 3hwx:Z, 3hwx:1, 2jla:A, 2jla:B, 2jla:C, 2jla:D, 2jlc:A, 2jlc:B, 5z2p:A, 5z2p:B, 5z2p:C, 5z2p:D, 5z2p:E, 5z2p:G, 5z2p:F, 5z2p:H, 5z2r:A, 5z2r:B, 5z2r:C, 5z2r:D, 5z2r:E, 5z2r:F, 5z2r:G, 5z2r:H, 5z2u:A, 5z2u:H, 5z2u:B, 5z2u:G, 5z2u:C, 5z2u:D, 5z2u:E, 5z2u:F
60 2i2x:B 258 76 0.0449 0.0969 0.3289 4.8 2i2x:D, 2i2x:F, 2i2x:H, 2i2x:J, 2i2x:L, 2i2x:N, 2i2x:P
61 3hww:D 532 140 0.0521 0.0545 0.2071 8.0
62 6q1h:A 240 53 0.0269 0.0625 0.2830 8.4 6q1h:B, 6q1h:C, 6q1h:E, 6q1h:F, 6q1h:G

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218