Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VIVPEGTQLDEKQHIVINNGAEPQSFDPHKTEGVPESNVAYQLLEGLVTSDSEGKLQPGAAESWENTPDFKTWTFHLRKD
AKWSNGDPVTAHDFVFAWRRLVDPATAAPYASYLSYLQVENAQDIIDGKKKPAELGVEAKDDYTFVVHATNPVPYAVSLT
THQSLLPLPQKVVEKLGDAWVKKENYVGNGAYKLANHIINEKIEFERNPLYWNDKETVINSATFLAIENPSTDVARYRAG
DLDMTSYGLPPEQFAKLKKELLGEVYVTRTLGTYSYELNNKKAPFDNVNIRKALNLSLDRNVITDKVLGQGQTPTYVFTP
TYIEEGHLIQQPAYSKEPMAQRNEEAIKLLEEAGYSKANPLKFSILYNTNENHKKVAIAAASMWKANTKGLIDVKLENQE
WKTYIDSRRAGRYDVARAGWHADYNQATTFGNYFLSNSSNNTAKYANPEYDKAMAESYAATDAEGRAKAYAKAEEILGKD
YGIVPIFNYVNPRLVKPYVKGYSGKDPQDHIYLRNLYIIKH

The query sequence (length=521) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6dtg:A 522 521 1.0000 0.9981 1.0000 0.0 6dqq:A, 6dqr:A, 6dqt:A, 6dqu:A, 6dtf:A, 6dth:A
2 1b05:A 517 519 0.5605 0.5648 0.5626 0.0 1b0h:A, 1b1h:A, 1b2h:A, 1b32:A, 1b3f:A, 1b3g:A, 1b3h:A, 1b3l:A, 1b3l:C, 1b40:A, 1b46:A, 1b4h:A, 1b4z:A, 1b51:A, 1b52:A, 1b58:A, 1b5h:A, 1b5i:A, 1b5j:A, 1b6h:A, 1b7h:A, 1b9j:A, 1jet:A, 1jeu:A, 1jev:A, 1ola:A, 1olc:A, 2olb:A, 1qka:A, 1qkb:A, 2rkm:A
3 2z23:A 517 519 0.5509 0.5551 0.5530 0.0
4 3tcf:A 517 519 0.5355 0.5397 0.5376 0.0 3tcf:B, 3tcf:C, 3tcf:D, 3tcf:E, 3tcf:F, 3tcf:G, 3tcf:H, 3tcg:A, 3tcg:B, 3tcg:C, 3tcg:D, 3tcg:E, 3tcg:F, 3tcg:G, 3tcg:H
5 3o9p:A 509 515 0.4299 0.4401 0.4350 5.24e-150
6 3zs6:A 506 513 0.3916 0.4032 0.3977 1.47e-121
7 4gl8:A 500 465 0.3071 0.3200 0.3441 1.00e-86 4gl8:B
8 8arn:A 509 515 0.3378 0.3458 0.3417 5.97e-82 8are:A, 8arn:B
9 8ay0:B 496 497 0.2975 0.3125 0.3119 5.73e-66 8ay0:A, 8ay0:C
10 6npo:A 518 505 0.2975 0.2992 0.3069 2.27e-59
11 5kzt:B 510 494 0.3071 0.3137 0.3239 3.22e-57 5kzt:A
12 4faj:A 507 502 0.2610 0.2682 0.2709 1.18e-43
13 8upi:A 510 298 0.1727 0.1765 0.3020 6.25e-31
14 6ofq:A 512 519 0.2860 0.2910 0.2871 3.07e-26 6pu3:A
15 3m8u:A 508 480 0.2284 0.2343 0.2479 1.64e-25
16 3e3k:B 500 473 0.2284 0.2380 0.2516 6.47e-24 7a0c:A, 7a0c:B, 4dcx:A, 4dcx:B, 4dcy:A, 4dcy:B, 3dp8:A, 3dp8:B, 3dp8:C, 3e3k:A, 3e3k:C, 4i8c:A, 4i8c:B, 4i8c:C, 4i9d:A, 4i9d:B, 5l8d:A, 5l8d:B, 3mvw:A, 3mvw:B, 3mvx:A, 3mvx:B, 3mvy:A, 3mvy:B, 3mvz:A, 3mvz:B, 3mw0:A, 3mw0:B, 5mwu:A, 5mwu:B, 3mz9:A, 3mz9:B, 3mzb:A, 3mzb:B, 2noo:A, 5on0:A, 5on0:B, 5on1:A, 5on1:B, 5on4:A, 5on4:B, 5on5:A, 5on5:B, 5on8:A, 5on8:B, 5on9:A, 5on9:B, 6r4q:A, 6r4q:B, 8spm:A, 1zlq:A, 1zlq:B
17 6hlx:A 491 462 0.2150 0.2281 0.2424 9.23e-24
18 7kz9:A 478 483 0.2169 0.2364 0.2340 1.31e-21 7kz9:B
19 8wda:A 517 494 0.2303 0.2321 0.2429 2.62e-21 6e3d:A, 6e4d:A, 7jls:A
20 4qfl:A 507 505 0.2438 0.2505 0.2515 6.24e-21 4qfl:B, 4qfn:A, 4qfn:B, 4qfo:A, 4qfo:B, 4qfp:A, 4qfp:B
21 5f1q:A 513 530 0.2399 0.2437 0.2358 9.11e-21 5f1q:B
22 1dpp:A 507 526 0.2361 0.2426 0.2338 6.32e-20 1dpp:C, 1dpp:E, 1dpp:G
23 5z99:A 485 436 0.2131 0.2289 0.2546 1.20e-19 5yyb:A, 5yyb:B
24 4oes:A 498 487 0.2169 0.2269 0.2320 8.16e-19
25 8a42:A 627 360 0.1900 0.1579 0.2750 1.17e-18 8qm0:A, 8qm0:B, 8qm0:C, 8qm0:D
26 1uqw:A 487 510 0.2246 0.2402 0.2294 4.81e-18 1uqw:B
27 8qlj:A 621 487 0.2265 0.1900 0.2423 1.49e-17 8qlk:A, 8qlm:A, 8qlm:B, 8qlv:A
28 8qlg:A 624 459 0.1996 0.1667 0.2266 1.97e-17 8qlg:B
29 8caw:A 491 388 0.1862 0.1976 0.2500 6.29e-17 8cay:A, 8cb9:A, 8cdo:A
30 8ch2:A 479 388 0.1823 0.1983 0.2448 5.79e-16 8ch1:A, 8ch3:A, 8chc:A, 8ci6:A, 8cju:A
31 8cko:A 492 387 0.1689 0.1789 0.2274 5.72e-14 8ckd:A, 8cke:A, 6i7w:A, 4ra1:A, 4ze9:A, 4zeb:A, 4zeb:B, 4zec:A, 4zed:A, 4zei:A, 4zek:A
32 3ryb:A 563 506 0.2169 0.2007 0.2233 1.39e-12 3drf:A, 3drg:A, 3drh:A, 3dri:A, 3drj:A, 3drk:A, 3rya:A
33 2wop:A 554 469 0.1996 0.1877 0.2217 2.05e-11 2wok:A
34 6tfx:B 494 276 0.1248 0.1316 0.2355 9.12e-11 6tfq:A, 6tfq:B, 6tfs:A, 6tfs:B, 6tfx:A
35 3i5o:A 582 481 0.2131 0.1907 0.2308 1.86e-10 3i5o:B, 4jsd:A, 4jso:A, 2o7i:A
36 1xoc:A 504 497 0.2188 0.2262 0.2294 2.75e-10
37 7ebi:A 537 468 0.1977 0.1918 0.2201 8.43e-10 7ebm:A, 6lzq:A, 6lzt:A, 6lzu:A, 6lzv:A, 6lzw:A
38 4gfr:A 529 412 0.1919 0.1890 0.2427 4.98e-09 8i5j:A, 8i5j:B, 8i5k:A, 1zu0:A
39 5yh8:A 510 332 0.1478 0.1510 0.2319 9.83e-09 5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A
40 7og0:B 498 333 0.1555 0.1627 0.2432 1.63e-08 7ofw:A, 7ofz:A, 7og0:A
41 4ofo:A 497 489 0.2015 0.2113 0.2147 1.04e-07 4ofl:A, 4ofl:B, 4ofo:B, 4ofo:C, 4ofo:D
42 7z8e:A 590 542 0.2284 0.2017 0.2196 4.10e-07
43 6epz:C 673 328 0.1459 0.1129 0.2317 9.18e-06 6epy:A, 6epy:B, 6epy:C, 6epy:D, 6epz:A, 6epz:D, 6epz:B, 6eq0:A, 6eq0:B, 6eq1:A, 6eq1:B, 6eq8:D, 6eq8:B, 6eq8:C, 6eq8:A
44 7veu:A 612 47 0.0441 0.0376 0.4894 1.00e-05 7vev:A, 7vew:A, 7vew:B
45 4pfy:A 539 473 0.1881 0.1818 0.2072 5.88e-05 4pft:A, 4pft:B, 4pfy:B
46 8j5u:A 534 292 0.1152 0.1124 0.2055 2.98e-04 8j5q:A, 8j5s:A
47 4oev:A 494 269 0.1075 0.1134 0.2082 6.92e-04 4oeu:A, 4oeu:B, 4oev:B
48 4ofj:A 465 379 0.1497 0.1677 0.2058 0.045 3rqt:A, 4xkn:A, 4xkp:A, 4xkq:A, 4xkr:A
49 4pfu:B 542 483 0.1843 0.1771 0.1988 0.11 5hm4:B, 4pfu:A, 4pfw:A, 4pfw:B
50 2d5w:A 602 58 0.0269 0.0233 0.2414 0.30 2d5w:B
51 2d5w:A 602 20 0.0211 0.0183 0.5500 2.9 2d5w:B
52 6o7c:A 506 66 0.0345 0.0356 0.2727 0.58 6o6j:A
53 7nsj:Bk 165 108 0.0537 0.1697 0.2593 2.2 5aj4:Bk, 6gaw:Bk, 6gb2:Bk, 7nqh:Bk, 7nql:Bk, 7nsh:Bk, 7nsi:Bk, 8oin:Bw, 8oiq:Bw, 6ydp:Bk, 6ydw:Bk
54 5kcv:A 353 87 0.0480 0.0708 0.2874 2.8
55 1w78:A 414 52 0.0365 0.0459 0.3654 3.9 1w7k:A
56 7stz:C 540 41 0.0365 0.0352 0.4634 4.5 6cxy:C, 3ff8:A, 3ff8:B, 8h62:B, 1o6s:B, 2o72:A, 2omt:B, 2omv:B, 2omx:B, 2omy:B, 7stz:D, 6vel:C, 4zt1:A, 4zt1:B, 4zte:A, 4zte:B
57 6hzf:A 860 80 0.0441 0.0267 0.2875 6.1 6hze:A, 6hze:B, 6hzf:B, 6hzg:A
58 5dkp:k 194 50 0.0269 0.0722 0.2800 7.2 5dkp:A, 5dkp:G, 5dkp:B, 5dkp:C, 5dkp:D, 5dkp:E, 5dkp:F, 5dkp:H, 5dkp:N, 5dkp:I, 5dkp:J, 5dkp:K, 5dkp:L, 5dkp:M, 5dkp:a, 5dkp:g, 5dkp:b, 5dkp:c, 5dkp:d, 5dkp:e, 5dkp:f, 5dkp:h, 5dkp:n, 5dkp:i, 5dkp:j, 5dkp:l, 5dkp:m, 6nah:A, 6nah:G, 6nah:B, 6nah:C, 6nah:D, 6nah:E, 6nah:F, 6nah:H, 6nah:N, 6nah:I, 6nah:J, 6nah:K, 6nah:L, 6nah:M, 6nah:O, 6nah:U, 6nah:P, 6nah:Q, 6nah:R, 6nah:S, 6nah:T, 6nah:V, 6nah:b, 6nah:W, 6nah:X, 6nah:Y, 6nah:Z, 6nah:a, 8szn:V, 8szn:b, 8szn:W, 8szn:X, 8szn:Y, 8szn:Z, 8szn:a, 8szn:H, 8szn:N, 8szn:I, 8szn:J, 8szn:K, 8szn:L, 8szn:M, 6w9t:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218