Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
VGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLDSWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFTV
LNLFIGIIVD

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6sxc:A 271 90 0.9778 0.3247 0.9778 2.14e-59 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
2 7pgg:A 147 90 0.6333 0.3878 0.6333 6.67e-39 7pgg:B, 7pgi:E
3 5ek0:A 250 88 0.6667 0.2400 0.6818 1.58e-38 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
4 6n4i:C 226 88 0.6556 0.2611 0.6705 4.61e-38 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 5hk7:A 139 87 0.6000 0.3885 0.6207 2.29e-37 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
6 5klb:A 267 88 0.6556 0.2210 0.6705 3.42e-37 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
7 4dxw:A 210 87 0.4222 0.1810 0.4368 8.00e-16
8 8j7m:A 257 92 0.3222 0.1128 0.3152 1.09e-08 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 8j7h:B 290 67 0.2444 0.0759 0.3284 3.06e-08 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
10 7eeb:A 258 95 0.3444 0.1202 0.3263 1.43e-06
11 6kzo:A 967 70 0.2444 0.0228 0.3143 7.59e-06
12 6kzo:A 967 94 0.2444 0.0228 0.2340 0.006
13 6kzo:A 967 62 0.1667 0.0155 0.2419 0.92
14 6kzo:A 967 59 0.2000 0.0186 0.3051 3.1
15 6kzp:A 1014 70 0.2444 0.0217 0.3143 8.39e-06
16 6kzp:A 1014 95 0.2444 0.0217 0.2316 0.009
17 6kzp:A 1014 62 0.1667 0.0148 0.2419 0.99
18 6kzp:A 1014 59 0.2000 0.0178 0.3051 3.1
19 9ayh:A 1056 70 0.2444 0.0208 0.3143 1.45e-05 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
20 9ayh:A 1056 93 0.2222 0.0189 0.2151 0.004 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
21 9ayh:A 1056 59 0.2000 0.0170 0.3051 2.0 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
22 7wli:A 1135 86 0.2778 0.0220 0.2907 6.06e-05 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
23 7wli:A 1135 102 0.2222 0.0176 0.1961 0.018 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
24 7wli:A 1135 49 0.1889 0.0150 0.3469 2.9 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
25 7wli:A 1135 79 0.1889 0.0150 0.2152 6.8 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
26 8e59:A 1230 113 0.3111 0.0228 0.2478 0.002 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
27 8e59:A 1230 67 0.2000 0.0146 0.2687 0.039 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
28 8e59:A 1230 66 0.1889 0.0138 0.2576 0.88 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
29 6jp5:A 1274 113 0.3000 0.0212 0.2389 0.004 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
30 6jp5:A 1274 60 0.1889 0.0133 0.2833 0.028 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
31 6jp5:A 1274 66 0.1778 0.0126 0.2424 1.2 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
32 7jpx:A 1116 113 0.3000 0.0242 0.2389 0.004 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
33 7jpx:A 1116 60 0.1889 0.0152 0.2833 0.026 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
34 7jpx:A 1116 66 0.1778 0.0143 0.2424 1.1 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
35 8wea:A 1206 107 0.3000 0.0224 0.2523 0.005
36 8wea:A 1206 59 0.1778 0.0133 0.2712 0.34
37 8wea:A 1206 66 0.1889 0.0141 0.2576 0.56
38 7mix:A 1326 54 0.1889 0.0128 0.3148 0.007 7miy:A
39 7mix:A 1326 108 0.2778 0.0189 0.2315 0.043 7miy:A
40 7vfs:A 1266 54 0.1889 0.0134 0.3148 0.008 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
41 7vfs:A 1266 108 0.2778 0.0197 0.2315 0.039 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
42 7xm9:A 1230 70 0.2222 0.0163 0.2857 0.013 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
43 7xm9:A 1230 84 0.2444 0.0179 0.2619 0.10 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
44 7xm9:A 1230 58 0.1667 0.0122 0.2586 3.7 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
45 7w9l:A 1420 61 0.2111 0.0134 0.3115 0.015 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
46 7w9l:A 1420 84 0.2444 0.0155 0.2619 0.097 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
47 7w9l:A 1420 58 0.1667 0.0106 0.2586 4.6 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
48 8fhs:A 1282 111 0.3000 0.0211 0.2432 0.020 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
49 8fhs:A 1282 59 0.1778 0.0125 0.2712 0.35 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
50 8fhs:A 1282 66 0.1889 0.0133 0.2576 0.59 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
51 8x90:A 1377 51 0.1778 0.0116 0.3137 0.020 8x91:A, 8x93:A
52 8x90:A 1377 87 0.2889 0.0189 0.2989 0.045 8x91:A, 8x93:A
53 8x90:A 1377 26 0.1333 0.0087 0.4615 0.094 8x91:A, 8x93:A
54 8fhd:A 1294 70 0.2222 0.0155 0.2857 0.021
55 8fhd:A 1294 83 0.2333 0.0162 0.2530 0.30
56 8gz2:B 1174 70 0.2222 0.0170 0.2857 0.022 8gz1:B
57 8gz2:B 1174 81 0.2111 0.0162 0.2346 0.36 8gz1:B
58 6agf:A 1138 62 0.2333 0.0185 0.3387 0.024
59 6agf:A 1138 84 0.2333 0.0185 0.2500 3.7
60 8epm:A 991 59 0.1889 0.0172 0.2881 0.028
61 8epm:A 991 119 0.3111 0.0283 0.2353 0.055
62 8epm:A 991 87 0.2444 0.0222 0.2529 0.063
63 7xlq:A 1319 50 0.1778 0.0121 0.3200 0.028 8epl:A, 7yg5:A
64 7xlq:A 1319 119 0.3111 0.0212 0.2353 0.057 8epl:A, 7yg5:A
65 7xlq:A 1319 87 0.2444 0.0167 0.2529 0.075 8epl:A, 7yg5:A
66 8f6p:A 1091 70 0.2333 0.0192 0.3000 0.078
67 8f6p:A 1091 81 0.2222 0.0183 0.2469 0.92
68 8f6p:A 1091 48 0.1444 0.0119 0.2708 4.0
69 8eoi:K 1116 115 0.3111 0.0251 0.2435 0.078
70 8eoi:K 1116 59 0.1778 0.0143 0.2712 0.29
71 8eoi:K 1116 66 0.1889 0.0152 0.2576 0.55
72 6uz3:A 1126 70 0.2333 0.0187 0.3000 0.079 7fbs:A
73 6uz3:A 1126 81 0.2222 0.0178 0.2469 0.92 7fbs:A
74 6uz3:A 1126 48 0.1444 0.0115 0.2708 4.0 7fbs:A
75 7xsu:A 1085 70 0.2333 0.0194 0.3000 0.083
76 7xsu:A 1085 81 0.2222 0.0184 0.2469 0.98
77 7xsu:A 1085 48 0.1444 0.0120 0.2708 4.1
78 8t6l:A 1237 70 0.2333 0.0170 0.3000 0.084 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
79 8t6l:A 1237 81 0.2222 0.0162 0.2469 0.97 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
80 8t6l:A 1237 48 0.1444 0.0105 0.2708 4.4 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
81 8xmn:A 1277 84 0.2444 0.0172 0.2619 0.094 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
82 8xmn:A 1277 70 0.2111 0.0149 0.2714 0.14 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
83 8xmn:A 1277 58 0.1667 0.0117 0.2586 3.7 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
84 6j8e:A 1139 71 0.2333 0.0184 0.2958 0.11 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
85 6j8e:A 1139 84 0.2444 0.0193 0.2619 0.30 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
86 6xiw:A 1256 67 0.1667 0.0119 0.2239 0.18
87 6xiw:A 1256 62 0.1556 0.0111 0.2258 2.5
88 6xiw:A 1256 61 0.1889 0.0135 0.2787 4.2
89 7we4:A 1122 72 0.2556 0.0205 0.3194 0.19 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
90 7we4:A 1122 49 0.1556 0.0125 0.2857 1.3 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
91 7cu3:A 1277 67 0.1667 0.0117 0.2239 0.20
92 7cu3:A 1277 62 0.1556 0.0110 0.2258 3.0
93 7cu3:A 1277 61 0.1889 0.0133 0.2787 4.6
94 7sx3:A 1386 67 0.1667 0.0108 0.2239 0.21 7sx4:A
95 7sx3:A 1386 62 0.1556 0.0101 0.2258 2.8 7sx4:A
96 7sx3:A 1386 61 0.1889 0.0123 0.2787 4.8 7sx4:A
97 7roq:A 1831 41 0.2000 0.0098 0.4390 0.42
98 8f0p:A 1116 73 0.2111 0.0170 0.2603 0.67 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
99 6a91:A 1323 73 0.2111 0.0144 0.2603 0.75 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
100 8ouo:A 648 103 0.2444 0.0340 0.2136 1.2
101 6c9a:B 723 61 0.1667 0.0207 0.2459 1.2 6c9a:A
102 8ouo:B 625 103 0.2444 0.0352 0.2136 1.3 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
103 8ee6:A 1808 38 0.1556 0.0077 0.3684 1.4 8edw:A
104 4xzw:A 305 37 0.1444 0.0426 0.3514 1.4
105 3gyy:D 311 23 0.1333 0.0386 0.5217 1.4 3gyy:A, 3gyy:B, 3gyy:C, 2vpn:A, 2vpn:B, 2vpo:A, 2vpo:B
106 7tj9:A 1111 70 0.2000 0.0162 0.2571 1.5
107 8eop:A 1687 38 0.1556 0.0083 0.3684 1.5
108 7tbw:A 1928 38 0.1778 0.0083 0.4211 5.8
109 7tby:A 1788 38 0.1778 0.0089 0.4211 6.2 7tc0:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218