BioLiP

>protein
TSIKPFQMEDLFELNPVNLDPLTENFNVSFYSQYLIEWPQLFYKSVETPNGQASGYMMAKTEGQLKKEWHTHITAVTVLD
QYRRIGLASKLCLELENLTQVKDTLFIDLFVKVTNTLGRILYEKLGYSVFRRVVGYNKIDDSVDAFDMRKLLP

The query sequence (length=153) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5k18:B	179	163	1.0000	0.8547	0.9387	2.58e-108	5k04:B, 5k18:D
2	8g0l:A	158	156	0.4575	0.4430	0.4487	9.43e-47	7stx:A, 6vp9:A
3	6zmp:A	190	165	0.4183	0.3368	0.3879	4.18e-31	6zmp:B
4	4kvm:E	153	123	0.2680	0.2680	0.3333	5.51e-18	4kvm:F, 4kvm:G, 4kvm:H, 4kvo:E, 4kvo:F, 4kvo:G, 4kvo:H, 4kvx:A, 4kvx:B
5	6c95:B	160	153	0.3072	0.2938	0.3072	1.48e-14	6ppl:C, 6pw9:C
6	5nnp:B	179	158	0.2810	0.2402	0.2722	4.77e-12	5nnp:F
7	4hnx:B	213	169	0.2810	0.2019	0.2544	2.87e-10	4hnw:B, 6o07:B, 4xnh:B, 4xpd:B, 4y49:B, 4y49:H, 4y49:N
8	5c88:A	158	159	0.2745	0.2658	0.2642	2.42e-08	6ag4:A, 6ag5:A, 5c88:B, 4lx9:A, 4r3k:A, 4r3l:A, 2x7b:A
9	7l1k:A	149	146	0.2026	0.2081	0.2123	7.23e-06
10	4pv6:G	154	156	0.2549	0.2532	0.2500	5.42e-05	4pv6:C, 4pv6:I, 4pv6:F, 4pv6:A, 4pv6:H, 4pv6:J, 4pv6:E
11	7mx2:A	152	144	0.2288	0.2303	0.2431	6.47e-04	7rb3:A
12	2ob0:C	166	154	0.2614	0.2410	0.2597	0.005	2ob0:A, 2ob0:B, 6ppl:A, 2psw:A, 2psw:B, 2psw:C, 3tfy:A, 3tfy:B, 3tfy:C, 6wf3:A, 6wf3:B, 6wf3:C, 6wf3:D, 6wf3:E, 6wf3:F, 6wf5:A, 6wf5:B, 6wfg:A, 6wfg:C, 6wfg:E, 6wfk:A, 6wfk:B, 6wfk:C, 6wfn:A, 6wfo:A, 6wfo:B, 6wfo:C, 4x5k:A
13	6z00:A	156	131	0.1830	0.1795	0.2137	0.18	6yzz:A, 6z00:B
14	3pp9:A	176	101	0.1569	0.1364	0.2376	0.20	3pp9:B, 3pp9:C
15	3s6f:A	143	64	0.1307	0.1399	0.3125	0.22
16	2ge3:A	164	104	0.1569	0.1463	0.2308	1.3	2ge3:B, 2ge3:C
17	6sjy:B	175	53	0.1111	0.0971	0.3208	1.3	6sjy:A, 6sjy:C, 6sk1:A, 6sl8:A, 6sll:A, 6sll:B
18	6yug:A	143	86	0.1569	0.1678	0.2791	1.7	6yug:B
19	1s5k:A	153	66	0.0980	0.0980	0.2273	4.6	1s3z:A, 1s3z:B, 1s5k:B, 1s60:A, 2vbq:A, 2vbq:B
20	4qvt:D	146	83	0.1373	0.1438	0.2530	5.0	2pdo:H, 2pdo:B, 4qvt:A, 4qvt:B, 4qvt:C, 4qvt:E, 4qvt:F, 4qvt:G, 4qvt:H
21	5e9a:B	684	45	0.0915	0.0205	0.3111	5.2	5e9a:A, 5e9a:C, 5e9a:D, 5e9a:E, 5e9a:F
22	8g7t:A	647	68	0.1176	0.0278	0.2647	5.6	4ay2:A, 4bpb:A, 8dvr:A, 8g7u:A, 8g7u:C, 8g7v:A, 8g7v:C, 8scz:A, 8sd0:A, 7tnx:A, 7to1:A, 2ykg:A, 3zd6:A
23	8dvs:A	682	68	0.1176	0.0264	0.2647	5.8	7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
24	6c8z:A	488	93	0.1438	0.0451	0.2366	9.5	6xio:A

[Back]