Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIGGRWCDCKLPN

The query sequence (length=77) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4bs2:A 174 77 0.9870 0.4368 0.9870 5.59e-53 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
2 4bs2:A 174 55 0.2078 0.0920 0.2909 0.11 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
3 2cjk:A 167 71 0.3506 0.1617 0.3803 4.64e-13 2km8:C
4 2cjk:A 167 65 0.2338 0.1078 0.2769 2.02e-04 2km8:C
5 2rs2:A 84 73 0.3896 0.3571 0.4110 5.82e-12
6 1wtb:A 79 73 0.3506 0.3418 0.3699 1.33e-10 1x0f:A
7 6jvx:A 87 73 0.3117 0.2759 0.3288 3.27e-09 6jvy:A
8 9gpj:A 184 72 0.2597 0.1087 0.2778 1.15e-08 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 9gpj:A 184 72 0.3117 0.1304 0.3333 9.65e-07 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
10 5en1:A 184 72 0.2857 0.1196 0.3056 3.17e-08 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
11 5en1:A 184 72 0.3117 0.1304 0.3333 2.07e-07 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
12 8xxm:3G 84 56 0.2727 0.2500 0.3750 7.27e-08 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
13 2mgz:B 105 73 0.2987 0.2190 0.3151 1.48e-07 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
14 7q33:A 93 59 0.2857 0.2366 0.3729 2.22e-07 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
15 4ed5:B 169 49 0.2468 0.1124 0.3878 2.44e-07 4ed5:A
16 4ed5:B 169 49 0.2597 0.1183 0.4082 4.13e-07 4ed5:A
17 2rra:A 99 47 0.2727 0.2121 0.4468 3.13e-07 2kxn:B
18 1fnx:H 174 70 0.2727 0.1207 0.3000 3.31e-07 1fxl:A, 1g2e:A
19 1fnx:H 174 60 0.2338 0.1034 0.3000 4.73e-05 1fxl:A, 1g2e:A
20 5ith:A 80 61 0.2857 0.2750 0.3607 3.47e-07 5o3j:A
21 8esq:o 137 74 0.3117 0.1752 0.3243 3.68e-07 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
22 7dvq:Y 140 50 0.2468 0.1357 0.3800 4.17e-07 8i0p:Y, 8i0r:Y
23 8y6o:W 167 56 0.2727 0.1257 0.3750 4.69e-07
24 5x3z:A 96 72 0.3377 0.2708 0.3611 9.54e-07
25 8any:A6 74 61 0.2727 0.2838 0.3443 1.26e-06
26 2x1f:A 94 75 0.2727 0.2234 0.2800 1.41e-06 2km8:B, 2x1a:A
27 7csz:A 175 46 0.2338 0.1029 0.3913 2.84e-06
28 7csz:A 175 60 0.2727 0.1200 0.3500 2.17e-05
29 8fkp:SH 150 73 0.3117 0.1600 0.3288 3.17e-06 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
30 4qqb:A 169 64 0.2987 0.1361 0.3594 4.00e-06 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
31 4qqb:A 169 60 0.2208 0.1006 0.2833 9.63e-05 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
32 6r5k:H 394 59 0.2597 0.0508 0.3390 7.35e-06 6r5k:D, 6r5k:F
33 6r5k:H 394 35 0.2208 0.0431 0.4857 5.25e-04 6r5k:D, 6r5k:F
34 6r5k:H 394 62 0.2468 0.0482 0.3065 6.02e-04 6r5k:D, 6r5k:F
35 8pv1:CI 152 75 0.2857 0.1447 0.2933 7.52e-06 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
36 1rk8:A 87 65 0.2468 0.2184 0.2923 9.24e-06
37 7ohx:o 112 51 0.2338 0.1607 0.3529 9.41e-06
38 6m75:A 167 66 0.2727 0.1257 0.3182 1.10e-05
39 6m75:A 167 53 0.2208 0.1018 0.3208 1.54e-04
40 2xb2:D 89 58 0.2208 0.1910 0.2931 1.15e-05 2xb2:Z
41 6c0f:o 133 51 0.2338 0.1353 0.3529 1.71e-05 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
42 6gd2:A 84 61 0.2597 0.2381 0.3279 1.94e-05 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
43 2mb0:B 95 71 0.2857 0.2316 0.3099 2.06e-05
44 6n7p:A 186 44 0.2208 0.0914 0.3864 2.39e-05 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
45 6g90:B 193 44 0.2208 0.0881 0.3864 3.76e-05
46 2leb:A 101 49 0.2338 0.1782 0.3673 6.78e-05 2lec:A
47 8h6e:4R 106 50 0.2597 0.1887 0.4000 1.04e-04 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
48 7zap:A 97 49 0.2078 0.1649 0.3265 1.15e-04
49 5kw6:A 201 60 0.1948 0.0746 0.2500 1.54e-04 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
50 5kw6:A 201 69 0.2338 0.0896 0.2609 0.025 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
51 5m8i:A 114 67 0.2727 0.1842 0.3134 1.92e-04
52 8ch6:V 285 51 0.2597 0.0702 0.3922 2.34e-04 7qtt:V
53 8i0s:Y 320 51 0.2597 0.0625 0.3922 2.42e-04 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
54 2rqc:A 115 49 0.2468 0.1652 0.3878 2.87e-04
55 5x8p:v 190 62 0.2727 0.1105 0.3387 3.82e-04 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
56 2xs2:A 87 60 0.2727 0.2414 0.3500 4.40e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
57 2n82:B 104 73 0.2727 0.2019 0.2877 4.90e-04 2err:A, 7vrl:B
58 8i0v:4 161 68 0.2208 0.1056 0.2500 6.74e-04
59 8i0v:4 161 65 0.2987 0.1429 0.3538 0.002
60 6xlv:A 203 49 0.2078 0.0788 0.3265 0.001 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
61 2kg1:A 105 56 0.2468 0.1810 0.3393 0.002
62 3smz:A 280 58 0.2208 0.0607 0.2931 0.003
63 7pcv:A 116 48 0.2338 0.1552 0.3750 0.005 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
64 2mkc:A 118 68 0.2338 0.1525 0.2647 0.005 2my3:A
65 7dco:X 128 68 0.2338 0.1406 0.2647 0.007 5gm6:V, 5zwm:X
66 7zew:A 117 67 0.2468 0.1624 0.2836 0.007 7zex:A
67 5ifm:C 256 49 0.2338 0.0703 0.3673 0.007 5ifm:A
68 5ifm:C 256 51 0.2338 0.0703 0.3529 0.60 5ifm:A
69 5mqf:o 223 59 0.2208 0.0762 0.2881 0.010 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
70 6qx9:1K 201 71 0.2208 0.0846 0.2394 0.011 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
71 8idf:A 459 67 0.2987 0.0501 0.3433 0.049
72 2n7c:A 89 63 0.1948 0.1685 0.2381 0.059
73 6zj3:Sg 199 58 0.2208 0.0854 0.2931 0.095
74 7slp:B 321 68 0.2468 0.0592 0.2794 0.11 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
75 7uj1:B 270 47 0.2208 0.0630 0.3617 0.11 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
76 4pkd:B 240 69 0.2208 0.0708 0.2464 0.11 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
77 5vsu:A 387 70 0.2338 0.0465 0.2571 0.13 6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
78 2vod:B 188 53 0.2338 0.0957 0.3396 0.13 2vod:A, 2von:A, 2von:B, 2voo:A, 2voo:B, 2vop:A, 1yty:A, 1yty:B, 1zh5:A, 1zh5:B
79 4f02:A 175 60 0.2208 0.0971 0.2833 0.16 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
80 2m8d:B 91 51 0.2208 0.1868 0.3333 0.18 7abg:A6
81 4lmz:A 176 60 0.2208 0.0966 0.2833 0.22 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
82 1gpe:B 587 56 0.2208 0.0290 0.3036 0.24 1gpe:A
83 6fec:u 76 44 0.1688 0.1711 0.2955 0.43
84 2mkk:A 213 56 0.2338 0.0845 0.3214 0.85
85 8ro0:O 342 40 0.1558 0.0351 0.3000 0.93 8ro1:O
86 4uer:b 572 50 0.1948 0.0262 0.3000 1.1
87 6gsn:p 658 50 0.1948 0.0228 0.3000 1.3 8cah:p, 8cas:p, 6fyx:p, 6fyy:p, 6gsm:p, 6zce:p, 6zu9:p
88 3d2w:A 72 55 0.1818 0.1944 0.2545 1.9
89 6gej:Y 447 30 0.1299 0.0224 0.3333 2.3 8ets:W, 8ets:U, 8ets:Y, 8etu:W, 8etu:U, 8etu:Y, 8etw:W, 8etw:U, 8etw:Y, 8eu9:W, 8eu9:U, 8eu9:Y, 8euf:W, 8euf:U, 8euf:Y, 6gej:U, 6gej:W, 6gen:U, 6gen:W, 6gen:Y
90 8ch6:U 295 32 0.1688 0.0441 0.4062 2.7 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
91 7abi:P 237 30 0.1688 0.0549 0.4333 2.8 7aav:P, 7abg:P
92 8by6:B 152 72 0.2597 0.1316 0.2778 3.4 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
93 5zn7:A 680 10 0.0909 0.0103 0.7000 3.8 5zn7:C, 5zn7:D, 5zn7:F, 5zn7:H
94 4jbm:A 190 55 0.2338 0.0947 0.3273 4.4 4jbm:B
95 6sga:Fa 163 53 0.1688 0.0798 0.2453 8.3 6sg9:Fa, 6sgb:Fa
96 6lfr:A 166 16 0.1039 0.0482 0.5000 8.9 6lfs:A, 6lft:A, 6lfu:A, 6lfu:B
97 4evh:A 294 58 0.1948 0.0510 0.2586 9.2
98 1wte:A 272 22 0.1299 0.0368 0.4545 10.0 1wte:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218