Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPN

The query sequence (length=77) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4bs2:A 174 77 1.0000 0.4425 1.0000 5.68e-54 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
2 4bs2:A 174 55 0.2078 0.0920 0.2909 0.12 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
3 2cjk:A 167 71 0.3636 0.1677 0.3944 4.31e-14 2km8:C
4 2cjk:A 167 67 0.2727 0.1257 0.3134 9.91e-05 2km8:C
5 2rs2:A 84 73 0.4026 0.3690 0.4247 3.94e-13
6 6jvx:A 87 73 0.3247 0.2874 0.3425 2.05e-10 6jvy:A
7 1wtb:A 79 73 0.3377 0.3291 0.3562 1.38e-09 1x0f:A
8 9gpj:A 184 72 0.2597 0.1087 0.2778 8.52e-09 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 9gpj:A 184 72 0.3247 0.1359 0.3472 9.28e-08 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
10 2mgz:B 105 73 0.3117 0.2286 0.3288 1.28e-08 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
11 5en1:A 184 72 0.3247 0.1359 0.3472 1.65e-08 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
12 5en1:A 184 72 0.2857 0.1196 0.3056 2.40e-08 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
13 8any:A6 74 61 0.2857 0.2973 0.3607 7.35e-08
14 8xxm:3G 84 56 0.2727 0.2500 0.3750 8.37e-08 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
15 2rra:A 99 68 0.3247 0.2525 0.3676 9.26e-08 2kxn:B
16 7q33:A 93 59 0.2857 0.2366 0.3729 2.24e-07 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
17 4ed5:B 169 49 0.2468 0.1124 0.3878 2.51e-07 4ed5:A
18 4ed5:B 169 49 0.2597 0.1183 0.4082 4.09e-07 4ed5:A
19 8esq:o 137 74 0.3117 0.1752 0.3243 3.04e-07 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
20 7dvq:Y 140 50 0.2468 0.1357 0.3800 3.83e-07 8i0p:Y, 8i0r:Y
21 8y6o:W 167 56 0.2727 0.1257 0.3750 4.59e-07
22 5x3z:A 96 72 0.3377 0.2708 0.3611 7.13e-07
23 1fnx:H 174 60 0.2597 0.1149 0.3333 9.98e-07 1fxl:A, 1g2e:A
24 1fnx:H 174 51 0.2208 0.0977 0.3333 5.28e-05 1fxl:A, 1g2e:A
25 5ith:A 80 37 0.2338 0.2250 0.4865 2.09e-06 5o3j:A
26 7csz:A 175 46 0.2338 0.1029 0.3913 2.64e-06
27 7csz:A 175 60 0.2727 0.1200 0.3500 2.43e-05
28 4qqb:A 169 64 0.2987 0.1361 0.3594 5.02e-06 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
29 4qqb:A 169 60 0.2208 0.1006 0.2833 1.06e-04 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
30 2xb2:D 89 83 0.2987 0.2584 0.2771 5.92e-06 2xb2:Z
31 1rk8:A 87 65 0.2468 0.2184 0.2923 6.21e-06
32 8pv1:CI 152 75 0.2857 0.1447 0.2933 7.21e-06 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
33 6r5k:H 394 59 0.2597 0.0508 0.3390 8.26e-06 6r5k:D, 6r5k:F
34 6r5k:H 394 35 0.2208 0.0431 0.4857 6.02e-04 6r5k:D, 6r5k:F
35 6r5k:H 394 62 0.2468 0.0482 0.3065 6.84e-04 6r5k:D, 6r5k:F
36 7ohx:o 112 51 0.2338 0.1607 0.3529 8.55e-06
37 2mb0:B 95 71 0.2857 0.2316 0.3099 1.10e-05
38 2x1f:A 94 60 0.2338 0.1915 0.3000 1.33e-05 2km8:B, 2x1a:A
39 6m75:A 167 60 0.2597 0.1198 0.3333 1.44e-05
40 6m75:A 167 53 0.2208 0.1018 0.3208 1.65e-04
41 6c0f:o 133 51 0.2338 0.1353 0.3529 1.62e-05 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
42 6gd2:A 84 61 0.2597 0.2381 0.3279 2.23e-05 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
43 6n7p:A 186 44 0.2208 0.0914 0.3864 2.75e-05 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
44 8fkp:SH 150 73 0.2987 0.1533 0.3151 3.91e-05 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
45 6g90:B 193 44 0.2208 0.0881 0.3864 4.56e-05
46 2leb:A 101 71 0.2857 0.2178 0.3099 4.67e-05 2lec:A
47 5m8i:A 114 67 0.2727 0.1842 0.3134 1.10e-04
48 8h6e:4R 106 45 0.2208 0.1604 0.3778 1.31e-04 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
49 2n82:B 104 73 0.2727 0.2019 0.2877 1.33e-04 2err:A, 7vrl:B
50 7zap:A 97 49 0.2078 0.1649 0.3265 1.38e-04
51 5kw6:A 201 54 0.1818 0.0697 0.2593 1.42e-04 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
52 5kw6:A 201 69 0.2208 0.0846 0.2464 0.24 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
53 2rqc:A 115 67 0.2857 0.1913 0.3284 2.16e-04
54 8i0s:Y 320 51 0.2597 0.0625 0.3922 3.06e-04 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
55 8ch6:V 285 51 0.2597 0.0702 0.3922 3.14e-04 7qtt:V
56 5x8p:v 190 57 0.2597 0.1053 0.3509 4.09e-04 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
57 2xs2:A 87 60 0.2727 0.2414 0.3500 4.95e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
58 8i0v:4 161 68 0.2208 0.1056 0.2500 6.74e-04
59 8i0v:4 161 61 0.2857 0.1366 0.3607 0.003
60 6qx9:1K 201 71 0.2338 0.0896 0.2535 0.001 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
61 6xlv:A 203 49 0.2078 0.0788 0.3265 0.002 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
62 2kg1:A 105 56 0.2468 0.1810 0.3393 0.002
63 3smz:A 280 58 0.2208 0.0607 0.2931 0.003
64 7pcv:A 116 48 0.2338 0.1552 0.3750 0.004 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
65 5ifm:C 256 49 0.2338 0.0703 0.3673 0.008 5ifm:A
66 5ifm:C 256 51 0.2338 0.0703 0.3529 0.65 5ifm:A
67 7zew:A 117 59 0.2208 0.1453 0.2881 0.010 7zex:A
68 4pkd:B 240 69 0.2338 0.0750 0.2609 0.011 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
69 5mqf:o 223 59 0.2208 0.0762 0.2881 0.014 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
70 2mkc:A 118 54 0.1818 0.1186 0.2593 0.034 2my3:A
71 7dco:X 128 54 0.1818 0.1094 0.2593 0.038 5gm6:V, 5zwm:X
72 2n7c:A 89 67 0.2078 0.1798 0.2388 0.049
73 4lmz:A 176 60 0.2208 0.0966 0.2833 0.063 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
74 6zj3:Sg 199 58 0.2208 0.0854 0.2931 0.089
75 7slp:B 321 68 0.2468 0.0592 0.2794 0.093 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
76 7uj1:B 270 47 0.2208 0.0630 0.3617 0.12 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
77 5vsu:A 387 70 0.2338 0.0465 0.2571 0.13 6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
78 2vod:B 188 53 0.2338 0.0957 0.3396 0.13 2vod:A, 2von:A, 2von:B, 2voo:A, 2voo:B, 2vop:A, 1yty:A, 1yty:B, 1zh5:A, 1zh5:B
79 4f02:A 175 60 0.2208 0.0971 0.2833 0.17 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
80 2m8d:B 91 51 0.2208 0.1868 0.3333 0.18 7abg:A6
81 1gpe:B 587 56 0.2208 0.0290 0.3036 0.24 1gpe:A
82 6gej:Y 447 43 0.1818 0.0313 0.3256 0.36 8ets:W, 8ets:U, 8ets:Y, 8etu:W, 8etu:U, 8etu:Y, 8etw:W, 8etw:U, 8etw:Y, 8eu9:W, 8eu9:U, 8eu9:Y, 8euf:W, 8euf:U, 8euf:Y, 6gej:U, 6gej:W, 6gen:U, 6gen:W, 6gen:Y
83 6fec:u 76 42 0.1558 0.1579 0.2857 0.45
84 8idf:A 459 67 0.2857 0.0479 0.3284 0.52
85 2mkk:A 213 56 0.2338 0.0845 0.3214 0.75
86 8ro0:O 342 40 0.1558 0.0351 0.3000 1.0 8ro1:O
87 4uer:b 572 50 0.1948 0.0262 0.3000 1.1
88 6gsn:p 658 50 0.1948 0.0228 0.3000 1.4 8cah:p, 8cas:p, 6fyx:p, 6fyy:p, 6gsm:p, 6zce:p, 6zu9:p
89 3d2w:A 72 55 0.1818 0.1944 0.2545 1.7
90 8by6:B 152 72 0.2597 0.1316 0.2778 2.2 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
91 8ch6:U 295 30 0.1688 0.0441 0.4333 2.4 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
92 7abi:P 237 30 0.1688 0.0549 0.4333 3.1 7aav:P, 7abg:P
93 4jbm:A 190 55 0.2338 0.0947 0.3273 3.6 4jbm:B
94 6lfr:A 166 16 0.1039 0.0482 0.5000 9.0 6lfs:A, 6lft:A, 6lfu:A, 6lfu:B
95 6sga:Fa 163 53 0.1688 0.0798 0.2453 9.8 6sg9:Fa, 6sgb:Fa

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218