BioLiP

>protein
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALK
AHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIR
TLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNA
LREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTD
YWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMF
WHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYI
TSAPGSDSAWLKVGRVA

The query sequence (length=497) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1e6z:B	498	497	0.9980	0.9960	0.9980	0.0	7c34:A, 7c34:B, 7c92:A, 7c92:B, 7cb1:A, 7cb1:B, 1e6r:A, 1e6r:B, 1e6z:A, 1h0g:B, 1h0g:A, 1h0i:A, 1h0i:B, 6jk9:A, 6jk9:B, 6jkf:A, 6jkf:B, 1o6i:A, 1o6i:B, 1ogg:A, 1ogg:B, 1ur8:A, 1ur8:B, 1ur9:A, 1ur9:B, 1w1p:A, 1w1p:B, 1w1t:A, 1w1t:B, 1w1v:A, 1w1v:B, 1w1y:A, 1w1y:B, 3wd1:A, 3wd2:A, 3wd3:A, 3wd4:A, 4z2g:A, 4z2h:A, 4z2i:A, 4z2j:A, 4z2k:A, 4z2l:A
2	6bt9:B	626	348	0.2555	0.2029	0.3649	7.94e-57	6bt9:A
3	6kst:B	372	385	0.2354	0.3145	0.3039	2.36e-52	6kxl:A, 6kxl:B, 6kxm:A, 6kxm:B, 6kxn:A, 6kxn:B
4	3g6m:A	388	426	0.2696	0.3454	0.3146	2.71e-44
5	8c6z:A	573	411	0.2394	0.2077	0.2895	1.02e-43	8ovr:A
6	5nr8:A	377	376	0.2233	0.2944	0.2952	5.54e-41	1hki:A, 1hkj:A, 1hkk:A, 1hkm:A, 6jjr:A, 6jk6:A, 5nra:A, 5nrf:A, 1waw:A, 1wb0:A, 6ze8:A, 6ze8:B, 6ze8:C, 6ze8:D, 6ze8:E, 6ze8:F
7	7akq:A	389	430	0.2535	0.3239	0.2930	7.57e-38	6epb:A, 6ylj:A, 6yn4:A
8	1ll4:A	392	400	0.2314	0.2934	0.2875	2.29e-36	1ll4:B, 1ll4:C, 1ll4:D
9	2a3c:A	395	390	0.2254	0.2835	0.2872	1.05e-34	2a3a:A, 2a3a:B, 2a3b:A, 2a3b:B, 2a3c:B, 2a3e:A, 2a3e:B, 3ch9:A, 3ch9:B, 3chc:A, 3chc:B, 3chd:A, 3chd:B, 3che:A, 3che:B, 3chf:A, 3chf:B, 2iuz:A, 2iuz:B, 1w9u:A, 1w9u:B, 1w9v:A, 1w9v:B
10	6le7:A	381	372	0.2032	0.2651	0.2715	6.85e-34	6le8:A
11	2aos:A	361	398	0.2193	0.3019	0.2739	1.97e-33	2fdm:A, 4mav:A, 4ml4:A, 4nsb:A, 2olh:A, 4q7n:A, 5z05:A, 5z3s:A, 5z4w:A, 1zbc:A, 1zbk:A, 1zbv:A, 1zbw:A, 1zl1:A
12	8r42:B	362	405	0.2193	0.3011	0.2691	3.37e-32	8r41:A, 8r41:B, 8r42:A, 8r4x:A, 8r4x:B, 8r4x:C, 8r4x:D
13	3wqv:A	383	377	0.2012	0.2611	0.2653	3.45e-32	3wqw:A
14	6jmb:A	374	388	0.2173	0.2888	0.2784	6.45e-32
15	8fr9:B	374	404	0.2113	0.2807	0.2599	6.82e-30	8frb:D
16	1ffq:A	540	433	0.2495	0.2296	0.2864	2.22e-29	7fd6:A, 2wk2:A, 2wly:A, 2wlz:A, 2wm0:A, 1x6n:A
17	3arq:A	575	364	0.2113	0.1826	0.2885	9.90e-29	3arp:A, 3arr:A, 3art:A, 3aru:A, 3arv:A, 3arw:A, 3arx:A, 3ary:A, 3arz:A, 3as0:A, 3as1:A, 3as2:A, 3as3:A, 8hrf:A, 8hrf:B
18	1e9l:A	372	390	0.2032	0.2715	0.2590	1.18e-28
19	6jav:A	377	342	0.2012	0.2653	0.2924	1.19e-28	6jaw:A, 6jax:A, 6jay:A
20	3fy1:A	377	376	0.2052	0.2706	0.2713	1.34e-28	3fy1:B, 3rm4:A, 3rm4:B, 3rm8:A, 3rm8:B, 3rm9:A, 3rm9:B, 3rme:A, 3rme:B, 2ybt:A, 2ybt:B, 2ybt:C, 2ybt:D, 2ybt:E, 2ybt:F, 2ybu:A, 2ybu:B, 2ybu:C, 2ybu:D, 2ybu:E, 2ybu:F
21	8ose:A	563	425	0.2153	0.1901	0.2518	3.68e-28	8owf:A
22	7vrg:A	540	357	0.2072	0.1907	0.2885	4.86e-28	5gqb:A, 6jmn:A, 7vrg:B
23	4r5e:A	343	396	0.1932	0.2799	0.2424	5.57e-28
24	6t9m:AAA	350	415	0.2113	0.3000	0.2530	2.19e-26
25	5df0:A	528	364	0.2093	0.1970	0.2857	1.97e-25	5df0:B
26	6hm1:A	386	413	0.2193	0.2824	0.2639	4.97e-25
27	8hw8:A	326	401	0.2113	0.3221	0.2618	9.48e-25
28	1jne:A	400	354	0.1871	0.2325	0.2627	9.33e-17
29	3co4:A	311	258	0.1227	0.1961	0.2364	4.90e-06
30	3co4:A	311	29	0.0302	0.0482	0.5172	3.7
31	4wiw:D	349	253	0.1167	0.1662	0.2292	2.09e-04	4wiw:A, 4wiw:B, 4wiw:C, 4wiw:E, 4wiw:F
32	5jh8:A	317	306	0.1429	0.2240	0.2320	0.027
33	6ve1:C	268	130	0.0644	0.1194	0.2462	0.12	1c8y:A, 6ve1:B, 6ve1:D
34	5kz6:A	327	42	0.0302	0.0459	0.3571	0.34	3n13:A, 3n15:A, 3n17:A, 3n18:A, 3n1a:A
35	8aan:A	228	44	0.0362	0.0789	0.4091	0.76	8ac8:A, 8ac8:C, 8d86:C, 8d8m:C, 1rep:C, 7rva:C, 7sdp:C, 7sgc:C, 7soz:C, 7spm:C, 8tip:C, 8tiq:C, 8tir:C, 8tis:C, 8tit:C, 8tiu:C, 8tiv:C, 8tiw:C, 8tix:C, 8tiy:C, 8tiz:C, 8tj0:C, 8tj1:C, 7u6k:C, 7u7o:C, 7ufx:C, 7uog:C, 7ur0:C, 7uv6:C, 7uv7:C, 7uxy:C, 2z9o:A, 2z9o:B
36	4tx8:A	374	166	0.0805	0.1070	0.2410	0.77
37	6kpm:A	295	29	0.0262	0.0441	0.4483	1.9	6kpn:A, 6kpo:A
38	3vlm:A	663	139	0.0664	0.0498	0.2374	2.0	3vlm:B
39	4y60:C	76	39	0.0282	0.1842	0.3590	2.2
40	4axn:A	316	23	0.0221	0.0348	0.4783	2.6	4axn:B
41	1itk:B	714	139	0.0664	0.0462	0.2374	3.1	1itk:A, 3uw8:A, 3uw8:B, 3vlh:A, 3vlh:B, 3vli:A, 3vli:B, 3vlj:A, 3vlj:B, 3vlk:A, 3vlk:B, 3vll:A, 3vll:B
42	6ldo:A	381	85	0.0503	0.0656	0.2941	9.8	6ldo:B, 6ldo:C, 6ldo:D, 6ldo:E, 6ldo:F, 6le4:A, 6le4:B, 6le4:C, 6le4:D, 6le4:E, 6le4:F

[Back]