BioLiP

>protein
TQRAEAVMEAEYERSEALLANMLPGSIAERLKSSSRSVIADKYDEVSVLFADIVGFTERASTTTPADLVRFLNRLYGAFD
ELVDKHGLEKIKVSGDSYMVVSGVPRARPDHAFALADFALDMANVAAALKDPHGDPVPLRMGMACGPVVAGVVGSRRFFY
DVWGDAVNVASRMESTDSVGRIQVPEAMYERLKNEFVLQERGRIEVKGKGVMRTWYLIGRKADE

The query sequence (length=224) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5o5l:A	224	224	1.0000	1.0000	1.0000	1.06e-165	5o5k:A, 5o5k:B, 5o5k:D, 5o5k:C, 5o5k:E, 5o5k:F, 5o5k:I, 5o5k:J, 5o5k:H, 5o5k:G, 5o5k:K, 5o5l:B, 5o5l:C, 5o5l:D, 5o5l:E, 5o5l:F, 5o5l:G, 5o5l:H, 5o5l:I, 5o5l:J, 5o5l:K
2	7yzi:A	378	221	0.7991	0.4735	0.8100	1.75e-126	4p2x:A, 7yz9:A, 7yzi:B, 7yzk:A, 7yzk:B
3	5oyh:D	185	182	0.3259	0.3946	0.4011	2.82e-47	6aob:B, 5oyh:A, 5oyh:B, 5oyh:C, 5oyh:E, 5oyh:F, 5oyh:G, 5oyh:H, 5oyh:I, 5oyh:J, 5oyh:K, 5oyh:L, 5oyh:M, 5oyh:N, 5oyh:O, 5oyh:P, 6sir:A, 6sir:B, 6sir:D, 6sir:C
4	8bv5:A	437	207	0.3661	0.1876	0.3961	3.70e-39
5	8bv5:A	437	198	0.2946	0.1510	0.3333	5.48e-35
6	8buz:A	890	212	0.3705	0.0933	0.3915	6.96e-38
7	8buz:A	890	205	0.2991	0.0753	0.3268	7.03e-34
8	1azs:A	190	161	0.2723	0.3211	0.3789	8.68e-37	3c14:A, 3c15:A, 3c16:A, 1cjk:A, 1cjt:A, 1cju:A, 1cjv:A, 1cs4:A, 1cul:A, 3g82:A, 2gvd:A, 2gvz:A, 3maa:A, 1tl7:A, 1u0h:A
9	8hbh:B	577	224	0.3661	0.1421	0.3661	2.64e-36	7d9r:B, 7d9s:B, 7d9t:B, 7d9u:B, 8hbe:B, 8hbf:B, 6jt0:B, 6jt1:B, 6jt2:B, 5mnw:A
10	6pas:B	576	224	0.3750	0.1458	0.3750	2.24e-35	6pat:B
11	8hbf:A	522	207	0.3036	0.1303	0.3285	4.63e-33	7d9r:A, 7d9s:A, 7d9u:A, 8hbh:A, 6jt2:A
12	6r4o:A	841	212	0.3080	0.0820	0.3255	6.45e-33
13	6r4o:A	841	225	0.3616	0.0963	0.3600	2.98e-32
14	1cjk:B	190	183	0.2991	0.3526	0.3661	7.61e-32	1ab8:A, 1ab8:B, 3c14:B, 3c15:B, 3c16:B, 1cjt:B, 1cju:B, 1cjv:B, 1cs4:B, 1cul:B, 3g82:B, 2gvd:B, 2gvz:B, 3maa:B, 1tl7:B, 1u0h:B
15	6fht:B	735	171	0.2188	0.0667	0.2865	6.98e-12	5ajg:A, 8avv:A, 8avv:B, 8avx:A, 8avx:B, 8bor:A, 8bor:B, 8bor:C, 8bor:D, 8c3i:B, 8c3i:A, 5c5k:A, 5c5k:B, 5c5k:C, 5c5k:D, 4cqh:A, 6fht:A, 6ftd:A, 6ftd:B, 4ijg:A, 5k5b:A, 5l8m:A, 5lbr:A, 5mg0:A, 5mg1:A, 5nfx:A, 5nm3:A, 5nm3:B, 5nm3:C, 5nm3:D, 5nwn:A, 5nwn:B, 5nwn:C, 5nwn:D, 4o01:A, 4o01:B, 4o01:C, 4o01:D, 4o0p:A, 4o0p:B, 4o8g:A, 2o9b:A, 2o9c:A, 4q0h:A, 4q0i:A, 4q0j:A, 3s7n:A, 3s7o:A, 3s7p:A, 3s7q:A, 8sgk:A, 8sgk:B, 6t3l:B, 6t3l:A, 6t3u:B, 6t3u:A, 4y3i:A, 4y5f:A, 4z1w:A, 7z9d:A, 7z9e:A, 4zrr:A, 1ztu:A
16	1wc4:A	199	176	0.2098	0.2362	0.2670	5.59e-07	2bw7:A, 2bw7:B, 2bw7:C, 2bw7:D, 1wc0:A, 1wc0:B, 1wc1:A, 1wc1:C, 1wc1:B, 1wc3:A, 1wc3:B, 1wc4:B, 1wc5:A, 1wc5:D, 1wc5:B, 1wc5:C, 1wc6:A, 1wc6:C, 1wc6:B
17	5m2a:A	346	147	0.1696	0.1098	0.2585	4.01e-06	5m27:A, 5m27:B, 5m2a:B, 5mbb:A, 5mbb:B, 5mbc:A, 5mbc:B, 5mbd:A, 5mbd:B, 5mbe:A, 5mbe:B, 5mbh:A, 5mbj:A, 5mbk:A, 5nby:A
18	4yut:A	351	134	0.1786	0.1140	0.2985	2.17e-05	8qfe:A, 8qff:A, 8qfg:A, 8qfh:A, 8qfi:A, 8qfj:A, 5x4t:A, 5x4u:A, 5x4v:A, 4yus:A, 4yut:B
19	1y10:C	363	150	0.2054	0.1267	0.3067	1.00e-04	2ev1:A, 2ev1:B, 2ev2:A, 2ev2:B, 2ev3:A, 2ev3:B, 2ev4:A, 2ev4:B, 1y10:A, 1y10:B, 1y10:D
20	1ybu:A	166	163	0.1741	0.2349	0.2393	0.17	1ybu:D
21	7sn8:D	399	136	0.1741	0.0977	0.2868	0.31
22	8jsz:A	259	49	0.0625	0.0541	0.2857	0.70	8jsz:B
23	4cn1:A	649	92	0.1071	0.0370	0.2609	0.75	4cn1:B, 4cn4:A, 4cn4:B, 4cn6:A, 4cn6:B, 5cvs:A, 5cvs:B, 8d6k:B, 8d6k:A, 5lgv:A, 5lgv:B, 5lgw:A, 5lgw:B, 7mel:A, 7mel:B, 7mgy:A, 7mgy:B, 4u2y:A, 4u2y:B, 4u2z:A, 4u2z:B, 4u31:A, 4u31:B, 7uvd:B, 7uvd:A, 5vsj:A, 5vsj:B, 5vt4:A, 5vt4:B, 5vt4:C, 5vt4:D, 3zst:A, 3zst:B, 3zt5:A, 3zt5:B, 3zt5:C, 3zt5:D, 3zt6:A, 3zt6:B, 3zt6:C, 3zt6:D, 3zt7:B, 3zt7:A, 3zt7:D, 3zt7:C
24	7cn8:A	1125	36	0.0670	0.0133	0.4167	0.98	7cn8:B, 7cn8:C, 7ek6:A, 7xu0:A, 7xu1:C, 7xu1:B, 7xu2:A, 7xu2:C, 7xu2:B, 7xu4:A, 7xu4:C, 7xu4:B
25	3ahc:A	802	18	0.0491	0.0137	0.6111	2.3	3ahd:A, 3ahe:A, 3ahf:A, 3ahg:A, 3ahh:A, 3ahi:A, 3ahj:A
26	1fx4:A	231	56	0.0804	0.0779	0.3214	3.3
27	7nfc:A	3562	43	0.0625	0.0039	0.3256	4.3	8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
28	3ai7:A	813	33	0.0625	0.0172	0.4242	5.6	3ai7:B, 3ai7:C, 3ai7:D, 3ai7:E, 3ai7:F, 3ai7:G, 3ai7:H, 7c8h:A, 7c8h:B, 7c8h:C, 7c8h:D, 7c8h:E, 7c8h:F, 7c8h:G, 7c8h:H, 7c8i:A, 7c8i:B, 7c8i:C, 7c8i:D, 7c8i:E, 7c8i:F, 7c8i:G, 7c8i:H, 8io6:A, 8io6:B, 8io6:C, 8io6:D, 8io6:E, 8io6:F, 8io6:G, 8io6:H, 8io7:A, 8io7:B, 6lxv:A, 6lxv:B, 6lxv:C, 6lxv:D, 6lxv:E, 6lxv:F, 6lxv:G, 6lxv:H
29	2z8d:A	401	62	0.0893	0.0499	0.3226	6.9	2z8d:B, 2z8e:A, 2z8e:B, 2z8f:A, 2z8f:B

[Back]