BioLiP

>protein
TLSITSNFDAGAIDVVSCDSPDAIRLRVRGDNRSEFAQWFYYRLTGARGERCVMTFENAAECAYPSGWRNYSAVASYDRV
DWFRVPTTFDGKTMTIDHTPEFDSIYYAYFEPYSEERHAAFLGAVQQLPQASVVELGRTVEGRPMSLLTLGTPETAPKKK
VWIIARQHPGESMAEWFVEGLVKRLAGWGDWAGDPVARKLYDRVTFHIVPNMNPDGSVHGNLRTNAAGANLNREWMAPDA
ERSPEVLAVRDAIHAIGCDMFFDIHGDEDLPYVFVAGSEMLPSFTEQQGKEQTAFIEAFKVASPDFQTEHGYAASKYKED
ALKLASKYIGHQFGCLSLTLEMPFKDNANLPDERVGWNGERSAALGAAMLAAILVHVDTF

The query sequence (length=380) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4b6z:B	382	382	0.9974	0.9921	0.9921	0.0	4b6z:A, 4b6z:C, 4b6z:D
2	3l2n:A	376	377	0.4684	0.4734	0.4721	9.90e-124	3l2n:B
3	4a37:B	376	381	0.4211	0.4255	0.4199	3.60e-104	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B
4	8v3o:A	471	179	0.1263	0.1019	0.2682	9.30e-13	8v3p:A
5	8v3q:A	501	178	0.1211	0.0918	0.2584	7.09e-12	8v3m:A, 8v3n:A, 8v3r:A, 8v3s:A, 8v4k:E, 8v4l:E, 8v4m:E
6	2boa:A	404	176	0.1158	0.1089	0.2500	1.05e-05	4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
7	3mn8:B	386	172	0.1289	0.1269	0.2849	1.84e-05	3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
8	5mrv:A	307	84	0.0658	0.0814	0.2976	2.82e-05	5mrv:B
9	1uwy:A	393	180	0.1316	0.1272	0.2778	2.13e-04
10	1aye:A	401	135	0.0921	0.0873	0.2593	6.43e-04	1dtd:A
11	1h8l:A	380	148	0.0974	0.0974	0.2500	0.010	1qmu:A
12	1pyt:B	309	214	0.1368	0.1683	0.2430	0.014	2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
13	1jqg:A	409	222	0.1474	0.1369	0.2523	0.11
14	5om9:A	396	118	0.0711	0.0682	0.2288	0.40	3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
15	2yev:B	319	144	0.0974	0.1160	0.2569	0.82	2yev:E
16	5hxd:A	237	31	0.0421	0.0675	0.5161	1.9	5hxd:B
17	3ild:A	148	50	0.0447	0.1149	0.3400	2.5
18	1r5o:A	409	32	0.0342	0.0318	0.4062	3.6	1r5n:A
19	3ieh:A	268	76	0.0605	0.0858	0.3026	5.3
20	6ut3:B	365	99	0.0711	0.0740	0.2727	5.9
21	6ut5:A	395	99	0.0711	0.0684	0.2727	6.5	6ut3:C, 6ut3:D, 6ut3:E, 6ut3:F, 6ut4:A, 6ut4:B, 6ut4:C, 6ut4:D, 6ut4:E, 6ut4:F, 6ut5:B, 6ut5:C, 6ut5:D, 6ut5:E, 6ut5:F, 6ut7:A, 6ut7:B, 6ut7:C, 6ut7:D, 6ut7:E, 6ut7:F, 6ut7:H, 6ut7:I, 6ut7:J, 6ut7:K, 6ut7:L, 6ut7:M, 6ut8:A, 6ut8:B, 6ut8:C, 6ut8:D, 6ut8:E, 6ut8:F

[Back]