Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TKLEEHLEGIVNIFHQYSVRKGHFDTLSKGELKQLLTKELANTIKNIKDKAVIDEIFQGLDANQDEQVDFQEFISLVAIA
LKAAHY

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2wc8:D 93 86 1.0000 0.9247 1.0000 8.68e-58 1e8a:A, 1e8a:B, 1gqm:A, 1gqm:B, 1gqm:C, 1gqm:F, 1gqm:D, 1gqm:E, 1gqm:G, 1gqm:H, 1gqm:I, 1gqm:J, 1gqm:L, 1gqm:K, 1odb:B, 1odb:A, 1odb:C, 1odb:D, 1odb:E, 1odb:F, 2wc8:A, 2wc8:B, 2wc8:C, 2wcb:A, 2wcb:B
2 7ui5:A 114 86 0.4884 0.3684 0.4884 3.25e-22 6ds2:B, 6ds2:D, 6ds2:F, 6ds2:H, 4ggf:C, 4ggf:L, 4ggf:T, 4ggf:V, 1irj:A, 1irj:B, 1irj:C, 1irj:D, 1irj:E, 1irj:F, 1irj:G, 1irj:H, 7quv:B, 8sjb:C, 8sjb:D, 8sjc:C, 8sjc:D, 7ui5:B, 5w1f:B, 5w1f:D, 5w1f:H, 5w1f:F, 4xjk:B, 4xjk:D, 4xjk:F, 4xjk:H, 4xjk:J, 1xk4:C, 1xk4:D, 1xk4:G, 1xk4:H, 1xk4:K, 1xk4:L
3 5csn:A 94 85 0.3837 0.3511 0.3882 1.17e-18 3cr2:A, 3cr4:X, 3cr5:X, 5csf:A, 5csf:B, 5csi:A, 5csi:B, 5csj:A, 5csj:B, 5csn:B, 3czt:X, 3d0y:A, 3d0y:B, 3d10:A, 3d10:B, 5d7f:A, 5d7f:B, 5dkn:A, 5dkq:A, 5dkr:A, 5dkr:B, 1dt7:A, 1dt7:B, 5er4:X, 5er5:A, 8fj8:A, 4fqo:A, 3gk1:A, 3gk2:A, 3gk4:X, 2h61:A, 2h61:B, 2h61:C, 2h61:D, 2h61:E, 2h61:F, 2h61:G, 2h61:H, 3hcm:A, 3hcm:B, 3iqo:A, 3iqo:B, 3iqq:A, 2k7o:A, 2k7o:B, 3lk0:A, 3lk0:B, 3lk0:C, 3lk0:D, 3lk1:A, 3lle:A, 3lle:B, 1mho:A, 1mq1:A, 1mq1:B, 1mwn:A, 1mwn:B, 4pdz:A, 4pdz:B, 4pe0:X, 4pe0:A, 4pe1:A, 4pe1:B, 4pe4:X, 4pe4:A, 4pe7:A, 1psb:A, 1psb:B, 1qlk:A, 1qlk:B, 3rlz:A, 3rlz:B, 3rm1:A, 1xyd:A, 1xyd:B, 4xyn:A, 4xyn:B, 4xyn:C, 4xyn:D
4 7nmi:B 488 85 0.4535 0.0799 0.4588 3.29e-18 1j55:A
5 7nmi:B 488 85 0.4419 0.0779 0.4471 7.65e-16 1j55:A
6 2y5i:C 98 78 0.3953 0.3469 0.4359 9.38e-18 2y5i:A, 2y5i:B, 2y5i:D, 2y5i:E, 2y5i:F
7 6zdy:A 108 86 0.4070 0.3241 0.4070 1.11e-17 6zfe:A
8 2k2f:A 93 78 0.4070 0.3763 0.4487 1.78e-15 2k2f:B, 5k89:A, 5k89:C, 5k89:H, 2kbm:A, 2kbm:B, 2lp2:A, 2lp2:B, 2lp3:A, 2lp3:B, 2lux:A, 2lux:B, 8vk4:I, 8vk4:J, 8vk4:K, 8vk4:L, 8vk4:N, 8vk4:M, 8vk4:O, 8vk4:P, 1zfs:A, 1zfs:B
9 7psq:G 108 82 0.3837 0.3056 0.4024 4.11e-15 4cfr:B, 4eto:A, 3ko0:F, 3ko0:G, 3ko0:Q, 3m0w:J, 3m0w:B, 3m0w:C, 3m0w:D, 3m0w:F, 3m0w:G, 7psq:E, 3zwh:B
10 2kay:A 92 83 0.3837 0.3587 0.3976 6.19e-14 4dir:A, 4dir:B, 2kay:B, 6wn7:A, 6wn7:B, 6wn7:C, 6wn7:D, 6wn7:F, 6wn7:E
11 4duq:B 90 79 0.3721 0.3556 0.4051 9.63e-14 4duq:A
12 1qls:A 95 85 0.3488 0.3158 0.3529 8.57e-13
13 1k96:A 89 82 0.4186 0.4045 0.4390 1.17e-12 1k9k:A, 1k9k:B, 4p2y:B, 4ybh:B
14 5hlo:C 93 85 0.3953 0.3656 0.4000 1.50e-12 6ds2:A, 6ds2:C, 6ds2:E, 6ds2:G, 4ggf:A, 4ggf:K, 4ggf:S, 4ggf:U, 5hlo:A, 5hlo:B, 5hlo:D, 5hlv:A, 5hlv:D, 5hlv:B, 5hlv:H, 5hlv:C, 5hlv:E, 5hlv:F, 5hlv:G, 1mr8:A, 1mr8:B, 7quv:A, 8sjb:A, 8sjb:B, 8sjc:A, 8sjc:B, 5w1f:A, 5w1f:C, 5w1f:G, 5w1f:E, 4xjk:A, 4xjk:C, 4xjk:E, 4xjk:G, 4xjk:I, 1xk4:A, 1xk4:B, 1xk4:E, 1xk4:F, 1xk4:I, 1xk4:J
15 6t58:A 524 85 0.3953 0.0649 0.4000 1.57e-12 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
16 6t58:A 524 80 0.3837 0.0630 0.4125 1.94e-12 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
17 2kot:A 98 78 0.3140 0.2755 0.3462 1.13e-11 2egd:A, 2egd:B, 2h2k:A, 2h2k:B, 2kot:B, 1yut:A, 1yut:B, 1yuu:A, 1yuu:B
18 4hrg:A 114 78 0.3140 0.2368 0.3462 9.11e-11 1bt6:A, 1bt6:B, 4drw:A, 4drw:B, 4drw:C, 4drw:D, 4ftg:A, 4ftg:B, 4hre:E, 4hre:F, 4hre:I, 4hre:J, 4hrg:B, 4hrh:A, 4hrh:B
19 8s9w:A 98 87 0.3372 0.2959 0.3333 1.04e-10 8s9w:B
20 2l51:A 102 79 0.2558 0.2157 0.2785 1.20e-06 2l51:B
21 4pcw:C 91 86 0.3953 0.3736 0.3953 2.04e-06 4pcw:A, 4pcw:B, 4pcw:D
22 1qx2:A 76 70 0.2442 0.2763 0.3000 2.55e-04 1qx2:B
23 1ht9:A 76 76 0.3605 0.4079 0.4079 4.17e-04 1b1g:A, 1ht9:B, 3icb:A, 4icb:A, 1ig5:A, 1igv:A, 1n65:A
24 4aqi:A 96 80 0.2558 0.2292 0.2750 5.78e-04 4aqj:A, 2psr:A, 3psr:A, 3psr:B, 2wnd:A, 2wor:A, 2wos:A
25 4il1:A 529 65 0.2093 0.0340 0.2769 0.002 1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
26 4jwq:C 73 58 0.2326 0.2740 0.3448 0.006 4jwq:A
27 1uhn:A 189 67 0.2442 0.1111 0.3134 0.006 2zfd:A
28 7u0t:A 190 65 0.2093 0.0947 0.2769 0.006
29 3ox5:A 153 59 0.2326 0.1307 0.3390 0.007 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
30 7u0u:A 195 65 0.2093 0.0923 0.2769 0.018 6tz7:B
31 8bd3:B 504 27 0.1279 0.0218 0.4074 0.040 8bd3:b
32 6xu4:A 389 70 0.2093 0.0463 0.2571 0.059 6xu4:B, 6xu4:E
33 8b6q:A 466 65 0.1977 0.0365 0.2615 0.061 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
34 8b6q:A 466 51 0.1744 0.0322 0.2941 0.46 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
35 2r2i:A 184 42 0.1395 0.0652 0.2857 0.081
36 5mwc:D 275 27 0.1279 0.0400 0.4074 0.083
37 2lv7:A 100 44 0.1628 0.1400 0.3182 0.084
38 6tz8:B 174 59 0.1977 0.0977 0.2881 0.086 6tz8:E
39 7m2m:A 183 43 0.1395 0.0656 0.2791 0.15
40 3ox6:E 118 43 0.1744 0.1271 0.3488 0.17
41 3lij:A 465 39 0.1512 0.0280 0.3333 0.17 3l19:A, 3l19:B
42 4mvf:A 408 55 0.2093 0.0441 0.3273 0.23 3pm8:A, 3pm8:B
43 1osa:A 148 51 0.1744 0.1014 0.2941 0.25 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
44 2ggz:A 165 30 0.1395 0.0727 0.4000 0.27 2ggz:B
45 5b8i:B 171 64 0.1860 0.0936 0.2500 0.27
46 6u2m:A 464 51 0.1744 0.0323 0.2941 0.27 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
47 6u2m:A 464 65 0.1860 0.0345 0.2462 0.29 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
48 2m28:A 72 50 0.1512 0.1806 0.2600 0.34
49 6k67:B 83 78 0.2093 0.2169 0.2308 0.38 6k67:D
50 3o78:A 402 51 0.1512 0.0323 0.2549 0.38 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
51 3o78:A 402 52 0.1744 0.0373 0.2885 2.9 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
52 2n6a:A 162 58 0.2093 0.1111 0.3103 0.40
53 2n6a:A 162 51 0.1512 0.0802 0.2549 0.71
54 1bjf:A 181 28 0.1163 0.0552 0.3571 0.48 1bjf:B
55 1bjf:A 181 48 0.1512 0.0718 0.2708 2.6 1bjf:B
56 6hr1:A 406 51 0.1512 0.0320 0.2549 0.49 6hr1:B
57 6hr1:A 406 52 0.1744 0.0369 0.2885 2.8 6hr1:B
58 3q5i:A 470 69 0.2442 0.0447 0.3043 0.51
59 8c0t:A 281 25 0.1163 0.0356 0.4000 0.54
60 8osi:A 400 52 0.1512 0.0325 0.2500 0.54
61 1omr:A 201 35 0.1395 0.0597 0.3429 0.65 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
62 8aht:A 140 71 0.2209 0.1357 0.2676 0.71 8aht:B
63 3u0k:A 397 51 0.1744 0.0378 0.2941 0.90
64 3u0k:A 397 61 0.1860 0.0403 0.2623 1.4
65 6gez:B 532 25 0.1163 0.0188 0.4000 0.94 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
66 5ukg:A 393 61 0.1860 0.0407 0.2623 1.1 5ukg:B
67 5ukg:A 393 42 0.1279 0.0280 0.2619 7.6 5ukg:B
68 2f2p:A 169 51 0.1512 0.0769 0.2549 1.1 2f2o:B, 2f2p:B
69 2f2p:A 169 54 0.1860 0.0947 0.2963 1.5 2f2o:B, 2f2p:B
70 2lhi:A 176 63 0.1744 0.0852 0.2381 1.1 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
71 1rfj:A 148 51 0.1628 0.0946 0.2745 1.2 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
72 5g4p:A 184 28 0.1047 0.0489 0.3214 1.2 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
73 5g4p:A 184 48 0.1512 0.0707 0.2708 6.1 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
74 7n7b:B 271 57 0.1744 0.0554 0.2632 1.3 7n7b:A, 7n7c:A, 7n7c:B
75 6xyr:A 348 65 0.1860 0.0460 0.2462 1.5
76 6xyr:A 348 51 0.1744 0.0431 0.2941 2.0
77 4hb9:A 376 20 0.1279 0.0293 0.5500 1.7
78 2pmy:A 73 18 0.1163 0.1370 0.5556 1.8 2pmy:B
79 4i2y:A 381 61 0.1860 0.0420 0.2623 1.8 4i2y:B
80 1rm6:A 761 45 0.1977 0.0223 0.3778 1.9 1rm6:D, 1sb3:A, 1sb3:D
81 5h7d:E 113 68 0.1860 0.1416 0.2353 1.9 5h7d:F, 5h7d:G, 5h7d:H, 5h7d:K, 5h7d:L, 5h7d:O, 5h7d:P
82 1jba:A 189 32 0.0930 0.0423 0.2500 2.2
83 2bl0:C 142 34 0.1163 0.0704 0.2941 2.3
84 6dmw:E 113 77 0.2326 0.1770 0.2597 2.4
85 2kz2:A 93 52 0.1744 0.1613 0.2885 2.5
86 3khe:B 191 29 0.1163 0.0524 0.3448 2.7 3khe:A
87 5coc:A 124 47 0.1395 0.0968 0.2553 3.0
88 1ggz:A 144 51 0.1512 0.0903 0.2549 3.2
89 1ggz:A 144 51 0.1395 0.0833 0.2353 4.8
90 8phi:F 453 67 0.2442 0.0464 0.3134 3.4 9bjm:A, 5ea3:F, 5ea4:F, 5ea5:F, 5ea6:F, 6eag:F, 6eah:C, 6eak:F, 8kg5:A, 8kg5:C, 8kg5:B, 3kpe:A, 7kqd:F, 5kww:F, 6ntx:B, 6vkc:F, 6vkd:F, 6vke:F
91 6xw2:A 387 65 0.1977 0.0439 0.2615 3.9
92 2ccm:A 190 38 0.1512 0.0684 0.3421 4.0 2ccm:B, 5f6t:A, 4ndb:A, 4ndb:B, 4ndc:A, 4ndc:B, 4ndd:A, 4ndd:B
93 7ukh:I 181 29 0.0930 0.0442 0.2759 4.3 7ukh:J, 7ukh:K, 7ukh:L
94 6k4k:D 95 48 0.1512 0.1368 0.2708 4.6
95 3o4y:A 172 60 0.2093 0.1047 0.3000 5.4
96 4v2k:A 235 48 0.1628 0.0596 0.2917 5.8 4wq7:A, 4wq8:A, 4wq9:A, 4wqa:A, 4wqb:A, 4wqc:A, 4wqd:A, 4wqe:A
97 1m46:A 148 48 0.1512 0.0878 0.2708 7.0 1m45:A
98 6slo:A 214 55 0.1860 0.0748 0.2909 7.2 6lur:B, 6lur:C, 6lur:D, 6lur:A, 6lur:E, 6slo:C, 6slo:D
99 5g5l:A 1480 27 0.1395 0.0081 0.4444 7.2 6h67:A, 6h68:A, 5m3m:A, 5m5y:A, 5m64:A, 5n5y:A, 5n5z:A, 5n60:A, 6rqt:A, 6rrd:A, 6rui:A, 6ruo:A, 6rwe:A, 6tps:A
100 5aan:A 183 28 0.1047 0.0492 0.3214 7.5 4by4:A, 4by4:B, 4by5:A, 4by5:B, 4by5:C, 4by5:D, 6epa:A, 5fyx:A, 5g08:A
101 1qx7:M 115 47 0.1279 0.0957 0.2340 7.8
102 6mjp:A 240 59 0.1860 0.0667 0.2712 8.1
103 6agi:B 322 26 0.0814 0.0217 0.2692 8.6 6agi:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218