Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TKEEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLDSLHETHDHLARASESEDEVD
PLGCMRKLLLQVFNELVLDARTRRINEILHHKCEFTDDMCEIRQQRQSAVLDCHKGITLALANAVRRGQLPGELDAERAA
VAMFAYVDGLIRRWLLLPDSVDLLGDVEKWVDTGLDMLRLSPALRK

The query sequence (length=206) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7k1c:B 208 206 1.0000 0.9904 1.0000 1.01e-151 7k1a:A, 7k1a:B, 7k1c:A, 7kd8:A, 7kd8:B, 7kd8:D, 7kd8:C, 2uxh:A, 2uxh:B, 2uxi:A, 2uxi:B, 2uxo:B, 2uxp:A, 2uxp:B, 2uxu:A, 2uxu:B
2 7ju3:B 203 203 0.3204 0.3251 0.3251 1.96e-28 8fw0:A, 8fw0:B, 8fw0:C, 8fw0:D, 8fw3:C, 8fw3:D, 8fw3:A, 8fw3:B, 8fw8:B, 8fw8:C, 8fw8:D, 7jnp:A, 7jnp:B, 7ju3:A, 8ssh:C, 8ssh:D, 8ssh:A, 8ssh:B
3 3p9t:A 213 186 0.3107 0.3005 0.3441 4.98e-23
4 5h58:B 204 67 0.1505 0.1520 0.4627 2.03e-10 5h58:A, 5h58:C, 5h58:D, 4pxi:A, 4pxi:B, 4pxi:C, 4pxi:D
5 6srn:A 187 131 0.1990 0.2193 0.3130 4.82e-10
6 6wp9:E 218 58 0.1214 0.1147 0.4310 4.16e-08 6wp9:A, 6wp9:B, 6wp9:C, 6wp9:D, 6wp9:F, 6wp9:G, 6wp9:H, 6wpa:A, 6wpa:B
7 2eh3:A 171 74 0.1019 0.1228 0.2838 5.51e-08
8 3qbm:A 199 171 0.2282 0.2362 0.2749 1.29e-07 3qbm:B
9 8svd:T 197 54 0.1068 0.1117 0.4074 1.37e-07 8sua:A, 8svd:A, 8svd:G, 8svd:F, 8svd:E, 8svd:I, 8svd:J, 8svd:K
10 8sva:A 200 55 0.1068 0.1100 0.4000 2.12e-07 8suk:D, 8suk:C, 8sva:F, 8sva:G, 8sva:T, 8t5y:A
11 5gpc:A 190 178 0.1942 0.2105 0.2247 4.47e-06 5gpc:B, 5gpc:C, 5gpc:D
12 7eqf:A 184 62 0.1117 0.1250 0.3710 4.74e-06 7eqf:B, 7eqf:C, 7eqf:D
13 6yl2:B 192 54 0.1214 0.1302 0.4630 5.90e-06 6yl2:A
14 4w97:A 196 51 0.1068 0.1122 0.4314 7.62e-06
15 3whc:A 190 177 0.2184 0.2368 0.2542 1.26e-05 1vi0:A, 1vi0:B, 3whb:A, 3whb:B, 3whc:B, 3whc:C, 3whc:D, 3whc:E, 3whc:F
16 4i6z:B 200 46 0.1068 0.1100 0.4783 1.81e-05 4i76:A
17 5dy0:A 220 66 0.1019 0.0955 0.3182 3.28e-05 5dy0:B, 5dy0:C, 5dy0:D, 5dy1:A, 5dy1:B, 6gy3:A, 6gy3:B
18 7xxn:A 198 60 0.1019 0.1061 0.3500 4.41e-05 7xxt:A
19 7e1n:A 210 63 0.1117 0.1095 0.3651 4.47e-05 7e1n:B
20 5yej:C 169 60 0.1068 0.1302 0.3667 6.93e-05 5yej:B, 5yej:A
21 4aci:B 177 82 0.1311 0.1525 0.3293 8.80e-05 4aci:A, 4af5:A
22 6ayi:A 183 183 0.2039 0.2295 0.2295 1.74e-04 6ayi:B, 6ayi:C, 6ayi:D
23 6o6n:A 195 53 0.0971 0.1026 0.3774 2.55e-04 6o6p:A, 6o6p:B
24 3aqt:B 196 60 0.0922 0.0969 0.3167 3.78e-04 3aqt:A
25 5k7z:A 185 124 0.1553 0.1730 0.2581 4.49e-04 5k7h:A, 5k7h:B, 5k7z:B, 5k7z:C, 5k7z:D
26 4l62:A 190 60 0.0825 0.0895 0.2833 6.54e-04 4l62:B, 4l62:C, 4l62:D, 4l62:E, 4l62:F, 4l62:G, 4l62:H, 4l62:I, 4l62:J, 4l62:K, 4l62:L, 4l62:M, 4l62:N, 4l62:O, 4l62:P
27 6hs0:B 201 53 0.1068 0.1095 0.4151 6.55e-04 6c31:E, 6c31:F, 6c31:G, 6c31:H, 6c31:A, 6c31:B, 6c31:C, 6c31:D, 6hrw:A, 6hrx:A, 6hrx:B, 6hry:A, 6hry:B, 6hrz:A, 6hs0:A, 6hs1:B, 6hs2:B, 5icj:A, 5icj:B, 5n7o:A, 5n7o:B
28 5x3r:A 203 52 0.0874 0.0887 0.3462 0.001 7amn:B, 7amn:A, 7amt:B, 7amt:A, 5x3r:B, 5x3r:C, 5x3r:D
29 2np5:A 187 152 0.2087 0.2299 0.2829 0.001
30 4gct:C 190 64 0.0922 0.1000 0.2969 0.001 4gct:A, 4gct:B, 4gct:D, 5haw:A, 5haw:B
31 2vpr:A 197 60 0.0874 0.0914 0.3000 0.004
32 3hgy:A 202 83 0.1117 0.1139 0.2771 0.005 2qco:A, 3qqa:A
33 5vl9:C 191 63 0.1068 0.1152 0.3492 0.005 5vl9:B, 5vl9:A, 5vl9:D, 5vlg:A, 5vlg:B, 5vlg:C, 5vlg:D, 5vlg:E, 5vlg:F, 5vlg:G, 5vlg:H, 5vlm:A, 5vlm:B, 5vlm:C, 5vlm:D, 5vlm:E, 5vlm:F, 5vlm:G, 5vlm:H
34 7xaq:B 201 49 0.0825 0.0846 0.3469 0.005 8hjb:A, 7xaq:D, 7xaq:H, 7xaq:A, 7xaq:G, 7xaq:C
35 1jt0:A 188 149 0.1602 0.1755 0.2215 0.005 3bqz:A, 3br0:A, 3br1:A, 3br2:B, 3br2:A, 3br3:A, 3br5:A, 3br6:A, 3bt9:B, 3bt9:A, 3btc:A, 3bti:A, 3btj:B, 3btj:A, 3btl:A, 2g0e:D, 2gby:A, 1jt0:B, 1jt0:C, 1jt0:D, 1jt6:B, 1jt6:A, 1jtx:A, 1jty:A, 1jum:A, 1jup:A, 1jus:A, 3pm1:A, 1qvt:A, 1qvu:B, 1qvu:A, 1rkw:A, 1rpw:B
36 6ko7:C 186 63 0.1068 0.1183 0.3492 0.017 6ie8:A, 6ie9:A, 6ko7:A, 6ko7:B, 6ko7:D, 6ko9:A, 6ko9:B, 6ko9:C, 6ko9:D, 7n4w:A, 7n4z:A, 7n4z:C, 7n4z:B, 7n4z:D, 7n53:A, 7n53:B, 7n54:A, 7n54:B, 7n54:C, 7n54:D, 3vvy:A, 3vvy:B, 3vvy:C, 3vvy:D, 3vvz:A, 3vvz:B, 3vvz:C, 3vvz:D, 3vw0:B, 3vw0:D, 3vw1:B, 3vw1:D, 3vw2:A, 3vw2:B, 3vw2:C, 3vw2:D
37 4aux:A 207 73 0.1165 0.1159 0.3288 0.017 4abz:AAA, 4b1r:A, 4b3a:A, 4d7m:A, 4d7n:A, 2fj1:A, 3fk7:A, 3fk7:B, 5fkk:A, 5fkk:B, 5fkl:A, 5fkm:A, 5fkn:A, 5fkn:B, 5fko:A, 6fpl:A, 6fpm:A, 2o7o:A, 1ork:A, 6qjw:A, 6qjx:A, 1qpi:A, 6rbl:A, 6rbm:A, 6rcr:A, 6rgx:B, 2tct:A, 2trt:A, 4v2g:A, 4v2g:B, 2vke:A, 2vkv:A, 2x6o:A, 2x9d:A, 2xb5:A, 2xpu:A, 2xpv:A, 2xpw:A, 2xrl:A, 6yr1:AAA, 6yr2:AAA, 6yr2:BBB
38 6rxb:B 200 54 0.0874 0.0900 0.3333 0.032 6rxb:D, 6rxb:A, 6rxb:C
39 3zqg:A 208 63 0.0874 0.0865 0.2857 0.035 4ac0:A, 2ns8:A, 2ns8:B, 2ns8:C, 2ns8:D, 6sy4:A, 6sy6:A, 3zqh:A, 3zqi:A, 3zqi:B
40 6z1b:B 202 78 0.1117 0.1139 0.2949 0.037 4jyk:A, 4jyk:B, 3loc:A, 3loc:B, 3loc:C, 3loc:D, 4xk4:A, 4xk4:B, 4xk4:C, 4xk4:D, 6z1b:A
41 3zqf:A 183 62 0.0874 0.0984 0.2903 0.050 6sy4:B, 6sy6:B
42 3lsj:A 205 64 0.0922 0.0927 0.2969 0.073 3lsj:B, 3lsp:A, 3lsr:A
43 5mym:C 205 49 0.0777 0.0780 0.3265 0.10 4dw6:A, 5eyr:A, 5ezg:A, 5ezh:A, 5f04:A, 5f08:A, 5f0c:A, 5f0f:A, 5f0h:A, 5f1j:A, 5f27:A, 3g1l:A, 3g1m:A, 3g1o:A, 6hnx:A, 6hnz:A, 6ho0:A, 6ho1:A, 6ho2:A, 6ho3:A, 6ho4:A, 6ho5:A, 6ho6:A, 6ho7:A, 6ho8:A, 6ho9:A, 6hoa:A, 6hob:A, 6hoc:A, 6hod:A, 6hoe:A, 6hof:A, 5ioy:A, 5ioz:A, 5ip6:A, 5ipa:A, 5j1r:A, 5j1u:A, 5j1y:A, 5j3l:A, 4m3b:A, 4m3d:A, 4m3e:A, 4m3f:A, 4m3g:A, 5mwo:A, 5mxk:A, 5mxv:A, 5myl:A, 5mym:B, 5myn:A, 5myr:A, 5mys:A, 5myt:A, 5myw:A, 7ngd:A, 7ngg:C, 7ngi:A, 7ngj:A, 7ngk:A, 7ngm:A, 7ngn:A, 7ngo:A, 7ngr:A, 7ngs:A, 7ngt:A, 7ngu:A, 7ngw:A, 7ngx:A, 7ngy:A, 5nim:A, 5nio:A, 5niz:A, 5nj0:A, 5nz0:A, 5nz1:A, 5nz1:C, 5nz1:D, 3o8g:A, 3o8h:A, 3q0u:A, 3q0v:A, 3q0v:B, 3q0w:A, 3q3s:A, 6r1p:A, 6r1s:A, 3sdg:A, 3sfi:A, 3tp0:A, 1u9n:A, 1u9o:A, 1u9o:B
44 4gcl:B 196 64 0.0825 0.0867 0.2656 0.12 4gck:A, 4gck:B, 4gck:C, 4gck:D, 4gcl:A, 4gcl:C, 4gcl:D, 4gcl:E, 4gcl:G, 4gcl:H, 4gcl:F, 5hbu:A, 5hbu:B, 5hbu:C, 5hbu:D, 5hbu:E, 5hbu:G, 5hbu:H, 5hbu:F, 5hsz:A, 5k58:E, 5k58:F, 5k58:A, 5k58:B
45 3frq:A 185 173 0.1845 0.2054 0.2197 0.12 3frq:B, 6u18:A, 6u18:B
46 3ang:C 201 48 0.0777 0.0796 0.3333 0.16 3ang:D, 3ang:A, 3ang:B, 3anp:C, 3anp:D, 3anp:A, 3anp:B
47 5d1w:D 196 67 0.0922 0.0969 0.2836 0.20 5d1w:A, 5d1w:B, 5d1w:C
48 5mru:A 173 26 0.0680 0.0809 0.5385 0.24
49 5ojy:A 222 55 0.0728 0.0676 0.2727 0.42
50 3hth:B 173 85 0.1214 0.1445 0.2941 0.53 3hth:A, 3hti:A, 3htj:A, 3htj:B
51 7qej:A 204 118 0.1602 0.1618 0.2797 0.67 7qej:B, 7qek:A, 7qek:B
52 5d1r:A 227 70 0.0971 0.0881 0.2857 0.70 5d1r:B
53 3v78:B 173 56 0.0874 0.1040 0.3214 1.9 3v78:A
54 8oo2:A 177 41 0.0728 0.0847 0.3659 2.1 8oo2:B
55 6fux:A 267 111 0.1311 0.1011 0.2432 2.6
56 8p5d:LHH 119 39 0.0631 0.1092 0.3333 3.2 8p60:LHH, 8p60:KHH, 7qca:LHH
57 8a22:Ax 176 49 0.0777 0.0909 0.3265 3.2 8apn:Ax, 8apo:Ax
58 7r6r:A 167 26 0.0631 0.0778 0.5000 3.9 7tz1:A
59 8r4b:A 808 64 0.0971 0.0248 0.3125 4.3 8r4d:A
60 4jl3:C 182 73 0.0971 0.1099 0.2740 4.4 4jl3:A, 4jl3:B, 4jl3:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218