BioLiP

>protein
TDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHT

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2gli:A	155	62	1.0000	0.4000	1.0000	7.61e-43	7t91:A, 7t91:B
2	2gli:A	155	41	0.2097	0.0839	0.3171	0.25	7t91:A, 7t91:B
3	2rpc:A	155	56	0.4032	0.1613	0.4464	5.58e-10	2ej4:A
4	2rpc:A	155	63	0.3387	0.1355	0.3333	0.004	2ej4:A
5	2rpc:A	155	43	0.2258	0.0903	0.3256	2.0	2ej4:A
6	5y0u:A	109	62	0.4032	0.2294	0.4032	1.91e-08
7	2dlk:A	79	60	0.3065	0.2405	0.3167	0.003
8	6a57:A	131	60	0.3065	0.1450	0.3167	0.011	6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
9	2ebt:A	100	59	0.3226	0.2000	0.3390	0.030
10	2ebt:A	100	60	0.2742	0.1700	0.2833	0.20
11	6wmi:A	146	56	0.2903	0.1233	0.3214	0.066	6wmi:D
12	6wmi:A	146	60	0.3065	0.1301	0.3167	0.085	6wmi:D
13	5ke9:A	88	60	0.2742	0.1932	0.2833	0.11	5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
14	5ke9:A	88	59	0.2903	0.2045	0.3051	0.13	5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
15	1ubd:C	114	43	0.1935	0.1053	0.2791	0.20
16	1tf6:D	182	60	0.3065	0.1044	0.3167	0.21	2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
17	1f2i:G	66	60	0.2903	0.2727	0.3000	0.33	1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
18	1p47:A	87	60	0.2903	0.2069	0.3000	0.39	1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
19	2epa:A	72	59	0.2903	0.2500	0.3051	0.79
20	2ee8:A	106	32	0.2097	0.1226	0.4062	0.90
21	2ytq:A	46	23	0.1452	0.1957	0.3913	1.3	2eog:A
22	6b0o:A	119	22	0.1452	0.0756	0.4091	1.5	6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
23	1pfk:A	320	30	0.1774	0.0344	0.3667	1.6	1pfk:B
24	8ffz:A	314	39	0.1774	0.0350	0.2821	2.2
25	1zw8:A	64	24	0.1452	0.1406	0.3750	2.3
26	1zw8:A	64	43	0.1774	0.1719	0.2558	7.3
27	2el4:A	46	23	0.1613	0.2174	0.4348	2.6
28	7c24:A	372	55	0.2742	0.0457	0.3091	3.0	7c25:A, 7c26:A, 7c27:A, 5z3a:A, 5z3b:A, 5z3c:A, 5z3d:A, 5z3e:A, 5z3f:A
29	4gl9:F	126	36	0.1935	0.0952	0.3333	3.0	4gl9:G, 4gl9:E, 4gl9:H, 2hmh:A
30	6xyw:AH	110	13	0.1290	0.0727	0.6154	4.2

[Back]