BioLiP

>protein
SYTASRKHLYVDKNTKVICQGFTGKQGTFHSQQALEYGTNLVGGTTPGKGGKTHLGLPVFNTVKEAKEQTGATASVIYVP
PPFAAAAINEAIDAEVPLVVCITEGIPQQDMVRVKHRLLRQGKTRLIGPNCPGVINPGECKIGIMPGHIHKKGRIGIVSR
SGTLTYEAVHQTTQVGLGQSLCVGIGGDPFNGTDFTDCLEIFLNDPATEGIILIGEIGGNAEENAAEFLKQHNSGPKSKP
VVSFIAGLTAPPGRRMGHAGAIIAGGKGGAKEKITALQSAGVVVSMSPAQLGTTIYKEFEKRKML

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6xru:A	309	305	1.0000	0.9871	1.0000	0.0	5cae:A, 1euc:A, 2fpg:A, 7msr:A, 7mss:A, 7mst:A, 6wcv:A, 4xx0:A
2	1scu:A	288	284	0.6295	0.6667	0.6761	6.18e-135	1cqi:A, 1cqi:D, 1cqj:A, 1cqj:D, 1jkj:A, 1jkj:D, 1jll:A, 1jll:D, 2nu6:A, 2nu6:D, 2nu7:A, 2nu7:D, 2nu8:A, 2nu8:D, 2nu9:A, 2nu9:D, 2nu9:F, 2nu9:H, 2nua:A, 2nua:D, 1scu:D, 2scu:A, 2scu:D
3	6mgg:C	295	284	0.6000	0.6203	0.6444	1.25e-128	6mgg:A, 6pfn:A, 6pfn:C
4	6hxq:A	342	288	0.3410	0.3041	0.3611	3.27e-46	6hxq:C
5	6hxj:D	591	253	0.2721	0.1404	0.3281	2.55e-29	6hxj:B, 6hxj:F, 6hxj:H, 6hxn:A, 6hxn:B, 6hxo:A, 6hxo:B, 6hxo:F, 6hxo:G, 6hxo:H, 6nzy:A, 6nzy:D, 6qcl:B, 6qcl:E, 6qcl:F, 6qcl:G, 6qcl:H
6	8g1e:A	1037	263	0.2492	0.0733	0.2890	3.74e-18	8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
7	6hxi:B	616	322	0.2689	0.1331	0.2547	1.13e-15	6hxi:D, 6znw:B
8	6qfb:C	1011	260	0.2361	0.0712	0.2769	3.66e-15
9	7cm9:A	693	146	0.1344	0.0592	0.2808	5.19e-04	7cm9:B, 7cm9:C, 7cm9:D
10	3ufx:B	378	112	0.0918	0.0741	0.2500	0.24	3ufx:E, 3ufx:G, 3ufx:I
11	1reo:A	484	32	0.0459	0.0289	0.4375	0.84	1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
12	1f8r:A	483	44	0.0557	0.0352	0.3864	1.2	1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
13	5ts5:A	483	32	0.0459	0.0290	0.4375	2.4	4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
14	6sjy:B	175	35	0.0393	0.0686	0.3429	3.2	6sjy:A, 6sjy:C, 6sk1:A, 6sl8:A, 6sll:A, 6sll:B
15	6mfb:D	386	53	0.0426	0.0337	0.2453	6.1	6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
16	2b9w:A	423	54	0.0557	0.0402	0.3148	7.1	2b9x:A, 2b9y:A, 2ba9:A, 2bab:A, 2bac:A
17	8brh:A	632	56	0.0557	0.0269	0.3036	7.5
18	7s6c:B	891	80	0.0787	0.0269	0.3000	8.5

[Back]