BioLiP

>protein
SYMVARMQKMKAGNLGGAFKHNERVFETHSNKDINPSRSHLNYELTDRDRSVSYEKQIKDYVNENKVSNRAIRKDAVLCD
EWIITSDKDFFEKLDEEQTRTFFETAKNYFAENYGESNIAYASVHLDESTPHMHMGVVPFENGKLSSKAMFDREELKHIQ
EDLPRYMSDHGFELERGKLNSEAKHKTVAEFKRAMA

The query sequence (length=196) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4lvl:A	196	196	1.0000	1.0000	1.0000	1.14e-148	4lvi:A, 4lvj:A, 4lvk:A, 4lvm:A, 4lvm:C, 5n2q:A
2	5lm1:A	339	87	0.1071	0.0619	0.2414	0.53
3	5b5m:C	317	23	0.0510	0.0315	0.4348	3.6	5b5m:o, 5b5n:C, 5b5n:o, 7c52:C, 1eys:C, 4v8k:AC, 4v8k:BC, 3wmm:C, 5y5s:C
4	1kht:B	191	56	0.0867	0.0890	0.3036	3.8	1kht:C
5	6ywe:G	74	41	0.0663	0.1757	0.3171	4.1	6yws:G, 6ywx:G, 6ywy:G
6	7o81:AU	110	73	0.0969	0.1727	0.2603	4.5	6zvh:i
7	7uch:A	636	33	0.0612	0.0189	0.3636	5.2	6b39:A, 6b3a:A, 6b3b:A
8	2vl4:B	841	43	0.0663	0.0155	0.3023	5.3	7op6:A, 7op6:B, 7op7:A, 7op7:B, 2vjx:A, 2vjx:B, 2vl4:A, 2vmf:A, 2vmf:B, 2vo5:A, 2vo5:B, 2vot:A, 2vot:B, 2vqt:A, 2vqt:B, 2vqu:A, 2vqu:B, 2vr4:A, 2vr4:B, 2wbk:A, 2wbk:B
9	8z8x:B	710	106	0.1276	0.0352	0.2358	6.4	8z90:B
10	3h86:B	191	62	0.0918	0.0942	0.2903	7.1	3h86:A, 3h86:C, 3h86:G
11	4luj:A	214	32	0.0561	0.0514	0.3438	7.6	4luj:B
12	3tr5:A	518	26	0.0459	0.0174	0.3462	8.6	3tr5:B, 3tr5:C, 3tr5:D
13	4ii3:A	986	79	0.1224	0.0243	0.3038	10.0	9b5c:A, 9b5d:A, 9b5e:A, 9b5f:A, 9b5g:A, 9b5h:A, 9b5i:A, 9b5j:A, 9b5k:A, 9b5l:A, 9b5m:A, 9b5n:A, 9b5o:A, 9b5p:A, 9b5q:A, 9b5r:A, 9b5s:A, 9b5t:A, 9b5u:A, 9b5v:A, 9b5w:A, 9b5x:A, 4ii2:A, 4ii3:C, 6o82:A, 6o82:C, 6o83:A, 6o83:C, 5um6:A

[Back]