BioLiP

>protein
SVCAAQNCQRPCKDKVDWVQCDGGCDEWFHQVCVGVSPEMAENEDYICINCA

The query sequence (length=52) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5c11:A	52	52	1.0000	1.0000	1.0000	1.46e-33	3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
2	2ma5:A	61	51	0.6731	0.5738	0.6863	7.22e-22
3	8f8y:B	433	45	0.3654	0.0439	0.4222	2.11e-04	8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
4	3kv6:D	448	46	0.3654	0.0424	0.4130	3.45e-04	3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
5	3kv4:A	432	45	0.3654	0.0440	0.4222	3.48e-04	4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
6	1wem:A	76	50	0.3654	0.2500	0.3800	0.001	4l7x:A, 2m3h:A
7	5z8l:A	204	47	0.3269	0.0833	0.3617	0.003	5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
8	5znp:B	186	46	0.3462	0.0968	0.3913	0.006	5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
9	5yc3:A	60	36	0.2885	0.2500	0.4167	0.010	5yc4:A
10	3lqi:C	181	40	0.3077	0.0884	0.4000	0.012	2kyu:A, 3lqh:A, 3lqi:A, 3lqi:B, 3lqj:A, 3lqj:B, 7zey:B, 7zez:B
11	3zpv:1	62	30	0.2115	0.1774	0.3667	0.013	3zpv:3, 3zpv:5, 3zpv:7, 3zpv:9, 3zpv:A, 3zpv:C, 3zpv:E, 3zpv:G, 3zpv:I, 3zpv:K, 3zpv:M, 3zpv:O, 3zpv:Q, 3zpv:S, 3zpv:U, 3zpv:W, 3zpv:Y
12	9c0o:A	63	52	0.3077	0.2540	0.3077	0.017
13	1we9:A	64	36	0.2885	0.2344	0.4167	0.018
14	2xb1:C	97	30	0.1923	0.1031	0.3333	0.026	4up0:A, 4up5:A, 2xb1:A
15	2f6j:A	168	45	0.2885	0.0893	0.3333	0.027	8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
16	3bsg:A	404	34	0.2692	0.0347	0.4118	0.036	3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
17	2k16:A	75	28	0.2115	0.1467	0.3929	0.058	5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
18	5y20:A	52	35	0.2692	0.2692	0.4000	0.059
19	3n9m:A	503	35	0.2308	0.0239	0.3429	0.070	3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
20	2vp7:A	66	30	0.1731	0.1364	0.3000	0.072	2dx8:A, 2dx8:B, 2vpb:A, 2vpd:A, 2vpd:C, 2vpe:C, 2vpe:A, 2vpg:A, 2vpg:C, 2yyr:A, 2yyr:B
21	1wep:A	79	45	0.3269	0.2152	0.3778	0.13
22	5tdr:A	70	33	0.2308	0.1714	0.3636	0.23	5tdw:A
23	5wlf:A	60	21	0.1731	0.1500	0.4286	0.26	5wle:A
24	1wee:A	72	33	0.2115	0.1528	0.3333	0.63
25	6j2p:A	98	35	0.2500	0.1327	0.3714	0.72	6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
26	3wn6:A	404	37	0.2308	0.0297	0.3243	2.1	3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
27	4rh7:A	3005	30	0.1923	0.0033	0.3333	6.4
28	6sc2:B	3930	30	0.1923	0.0025	0.3333	6.4	6rla:A, 6rla:B, 6sc2:A
29	7s3d:L	170	15	0.1538	0.0471	0.5333	7.7	7s3d:l, 7s3d:U
30	3dan:A	473	20	0.1538	0.0169	0.4000	8.8	3dam:A, 3dbm:A
31	6yuf:C	456	47	0.2115	0.0241	0.2340	9.8

[Back]