BioLiP

>protein
STNTFNYATYHTLDEIYDFMDLLVAEHPQLVSKLQIGRSYEGRPIYVLKFSTGGSNRPAIWIDLGIHSREWITQATGVWF
AKKFTEDYGQDPSFTAILDSMDIFLEIVTNPDGFAFTHSQNRLWRKTRSVTSSSLCVGVDANRNWDAGFGKAGASSSPCS
ETYHGKYANSEVEVKSIVDFVKDHGNFKAFLSIHSYSQLLLYPYGYTTQSIPDKTELNQVAKSAVAALKSLYGTSYKYGS
IITTIYQASGGSIDWSYNQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAQETWLGVLTIMEHTV

The query sequence (length=303) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1pyt:B	309	303	0.9934	0.9741	0.9934	0.0	2abz:A, 2abz:B, 1arm:A, 1bav:A, 1bav:B, 1bav:C, 1bav:D, 1cbx:A, 1cps:A, 1cpx:A, 3cpa:A, 4cpa:A, 4cpa:B, 5cpa:A, 6cpa:A, 7cpa:A, 8cpa:A, 2ctb:A, 2ctc:A, 1ee3:P, 1ell:P, 1elm:P, 1f57:A, 3fvl:A, 3fvl:C, 3fvl:E, 3fx6:A, 3fx6:C, 3fx6:E, 1hdq:A, 1hdu:A, 1hdu:B, 1hdu:D, 1hdu:E, 1hee:A, 1hee:B, 1hee:D, 1hee:E, 3hlp:A, 3hlp:B, 3huv:A, 3i1u:A, 1iy7:A, 3kgq:A, 1m4l:A, 2rfh:A, 1yme:A, 1zlh:A
2	1pca:A	402	303	0.8713	0.6567	0.8713	0.0
3	5om9:A	396	303	0.8119	0.6212	0.8119	0.0	3fju:A, 6i6z:A, 6i6z:B, 5om9:B, 4uee:A, 4uee:B, 4uez:A, 4uez:B, 2v77:A, 2v77:B
4	1aye:A	401	301	0.6634	0.5012	0.6678	1.39e-154	1dtd:A
5	2boa:A	404	303	0.6139	0.4604	0.6139	7.63e-147	4a94:A, 4a94:B, 4bd9:A, 2bo9:A, 2bo9:C, 2boa:B, 2pcu:A
6	1kwm:A	402	291	0.4620	0.3483	0.4811	1.50e-99	1kwm:B, 1zli:A
7	3glj:A	395	290	0.4587	0.3519	0.4793	1.86e-98	5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
8	3dgv:A	401	301	0.4488	0.3392	0.4518	5.71e-89	3d4u:A, 3dgv:B, 3dgv:C, 3osl:A, 3osl:C
9	4p10:A	402	301	0.4488	0.3383	0.4518	1.68e-85	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
10	5mrv:A	307	299	0.3927	0.3876	0.3980	1.01e-78	5mrv:B
11	5hvf:A	372	300	0.4224	0.3441	0.4267	1.24e-78
12	7eqx:C	299	290	0.3498	0.3545	0.3655	2.53e-55	7eqx:D, 7eqz:A
13	2c1c:A	312	304	0.3300	0.3205	0.3289	1.24e-52	2c1c:B
14	1jqg:A	409	305	0.3168	0.2347	0.3148	5.38e-42
15	7aqp:A	323	289	0.2904	0.2724	0.3045	1.51e-33	7aru:A, 4djl:A, 4duk:A, 6f6q:A, 6f75:A, 6f79:A, 4f8z:A, 4gm5:A, 6go2:A, 4iav:A, 4ihm:A, 4ik2:A, 1obr:A, 3prt:A, 7q87:A, 3qnv:A, 8qvo:A, 6sn6:A, 6t9y:A, 6tnk:A, 3v38:A, 3v7z:A, 6z28:A
16	1h8l:A	380	281	0.2013	0.1605	0.2171	7.30e-09	1qmu:A
17	3mn8:B	386	116	0.0924	0.0725	0.2414	1.59e-05	3mn8:A, 3mn8:C, 3mn8:D
18	3l2n:A	376	130	0.1056	0.0851	0.2462	0.003	3l2n:B
19	4b6z:B	382	99	0.0891	0.0707	0.2727	0.003	4b6z:A, 4b6z:C, 4b6z:D
20	1uwy:A	393	154	0.1056	0.0814	0.2078	0.011
21	4a37:B	376	117	0.1023	0.0824	0.2650	0.015	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B
22	3qgv:A	435	68	0.0594	0.0414	0.2647	4.1
23	3jru:B	490	50	0.0528	0.0327	0.3200	8.2	3jru:A
24	1f0p:A	284	40	0.0462	0.0493	0.3500	9.5

[Back]