Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SMYVIRDEWGNQIWICPGCNKPDDGSPMIGCDDCDDWYHWPCVGIMTAPPEEMQWFCPKCA

The query sequence (length=61) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2k16:A 75 59 0.9508 0.7733 0.9831 1.13e-39 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
2 9c0o:A 63 44 0.2787 0.2698 0.3864 4.14e-07
3 6j2p:A 98 47 0.3279 0.2041 0.4255 4.24e-07 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
4 5wlf:A 60 56 0.3607 0.3667 0.3929 5.70e-07 5wle:A
5 2f6j:A 168 44 0.3279 0.1190 0.4545 3.20e-06 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
6 1wee:A 72 41 0.2623 0.2222 0.3902 7.16e-06
7 1weu:A 91 37 0.2951 0.1978 0.4865 8.79e-06 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
8 1x4i:A 70 46 0.3115 0.2714 0.4130 1.38e-05 7zmx:A, 7zmx:B
9 2miq:A 94 48 0.2951 0.1915 0.3750 2.47e-05
10 1wem:A 76 48 0.2787 0.2237 0.3542 2.82e-05 4l7x:A, 2m3h:A
11 3o70:A 55 42 0.2787 0.3091 0.4048 6.99e-05 3o7a:A
12 8ge0:A 188 49 0.3279 0.1064 0.4082 7.42e-05 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
13 3kv4:A 432 44 0.2787 0.0394 0.3864 2.17e-04 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
14 8f8y:B 433 44 0.2787 0.0393 0.3864 2.33e-04 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
15 2qic:A 51 45 0.3115 0.3725 0.4222 3.62e-04
16 6wxk:B 51 42 0.2623 0.3137 0.3810 0.001 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
17 3kv6:D 448 45 0.2951 0.0402 0.4000 0.001 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
18 2mny:A 55 48 0.2623 0.2909 0.3333 0.001 2mnz:A
19 2e6r:A 92 47 0.2787 0.1848 0.3617 0.002
20 1wes:A 71 45 0.2951 0.2535 0.4000 0.002 2g6q:A
21 6ryr:W 708 42 0.2131 0.0184 0.3095 0.002 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
22 7klo:A 59 49 0.2459 0.2542 0.3061 0.002 7klr:A
23 3n9m:A 503 34 0.2459 0.0298 0.4412 0.002 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
24 5yc3:A 60 49 0.2951 0.3000 0.3673 0.002 5yc4:A
25 5vab:A 54 46 0.2459 0.2778 0.3261 0.003
26 5z8l:A 204 41 0.2623 0.0784 0.3902 0.003 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
27 5y20:A 52 33 0.2623 0.3077 0.4848 0.003
28 9atn:A 98 49 0.2951 0.1837 0.3673 0.004
29 9atn:A 98 45 0.1967 0.1224 0.2667 0.30
30 5szb:A 115 45 0.2623 0.1391 0.3556 0.006 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
31 2ysm:A 111 51 0.2623 0.1441 0.3137 0.009
32 2ysm:A 111 46 0.2295 0.1261 0.3043 0.038
33 4gy5:A 215 50 0.2459 0.0698 0.3000 0.010 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
34 5b79:A 118 45 0.2459 0.1271 0.3333 0.010 5vdc:A
35 2jmi:A 60 36 0.2295 0.2333 0.3889 0.012 2jmj:A
36 1we9:A 64 34 0.2459 0.2344 0.4412 0.018
37 7xga:A 126 47 0.2623 0.1270 0.3404 0.021 6vfo:A
38 1f62:A 51 45 0.2131 0.2549 0.2889 0.036
39 5c11:A 52 46 0.2623 0.3077 0.3478 0.052 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
40 6fhq:A 58 45 0.2459 0.2586 0.3333 0.076 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
41 1wep:A 79 34 0.2295 0.1772 0.4118 0.086
42 5tab:A 53 38 0.1803 0.2075 0.2895 0.090
43 4tvr:A 222 46 0.2459 0.0676 0.3261 0.11
44 5znp:B 186 40 0.2131 0.0699 0.3250 0.13 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
45 5tdr:A 70 42 0.2295 0.2000 0.3333 0.14 5tdw:A
46 2e6s:A 77 48 0.2623 0.2078 0.3333 0.17
47 1mm3:A 61 43 0.2131 0.2131 0.3023 0.18
48 8qkh:A 268 41 0.2295 0.0522 0.3415 0.22 8q01:S, 8qek:S, 8qgr:B
49 2ma5:A 61 34 0.1803 0.1803 0.3235 0.25
50 8bpb:C 126 47 0.2623 0.1270 0.3404 0.32 8bpc:C
51 4q6f:A 56 45 0.2459 0.2679 0.3333 0.40 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
52 8bpa:C 213 44 0.2131 0.0610 0.2955 0.45 8c60:C
53 5b73:A 313 30 0.1967 0.0383 0.4000 0.62 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
54 3lqi:C 181 43 0.2131 0.0718 0.3023 0.71 2kyu:A, 3lqh:A, 3lqi:A, 3lqi:B, 3lqj:A, 3lqj:B, 7zey:B, 7zez:B
55 6guu:B 204 43 0.2131 0.0637 0.3023 0.73 6guu:A
56 2l5u:A 61 42 0.2295 0.2295 0.3333 0.74
57 6q3m:C 219 38 0.1967 0.0548 0.3158 0.79 6q3m:A, 6q3m:B
58 5tbn:A 57 28 0.1475 0.1579 0.3214 0.80
59 5hh7:A 192 60 0.3443 0.1094 0.3500 0.81
60 2mum:A 50 37 0.2131 0.2600 0.3514 0.84
61 7d87:A 202 60 0.3115 0.0941 0.3167 0.91 7d86:A, 7d8a:A
62 1wev:A 88 42 0.1639 0.1136 0.2381 1.0
63 7y0i:A 56 42 0.2295 0.2500 0.3333 1.1
64 8joj:A 523 21 0.1475 0.0172 0.4286 1.2 4c3x:A, 4c3x:B, 4c3x:C, 4c3x:D, 4c3x:E, 4c3x:F, 4c3x:G, 4c3x:H, 4c3y:A, 4c3y:B, 4c3y:C, 4c3y:D, 4c3y:E, 4c3y:F, 4c3y:G, 4c3y:H, 8jbz:AAA, 8ju4:A, 8kcz:A
65 2m85:A 65 37 0.1803 0.1692 0.2973 1.2
66 2lv9:A 80 52 0.2623 0.2000 0.3077 1.3 4l58:A
67 8hxx:N 375 60 0.2459 0.0400 0.2500 1.7 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
68 2puy:B 60 46 0.2131 0.2167 0.2826 1.7 2puy:A
69 8ihn:M 357 60 0.2459 0.0420 0.2500 1.8 8kd4:E
70 2yql:A 56 33 0.1639 0.1786 0.3030 2.2
71 6f92:A 760 51 0.2295 0.0184 0.2745 2.3 6f91:A, 6f91:B, 6f91:C, 6f91:D, 6f91:E, 6f91:F, 6f91:G, 6f91:H, 6f92:B, 6f92:C, 6f92:D
72 8kd6:E 301 60 0.2459 0.0498 0.2500 2.8 8kd2:E
73 8i02:G 284 59 0.2623 0.0563 0.2712 3.2 8ifg:P
74 7yi2:D 321 60 0.2459 0.0467 0.2500 3.5 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
75 6o7g:B 60 36 0.1803 0.1833 0.3056 4.2 8u2y:B
76 5vkt:A 353 18 0.1311 0.0227 0.4444 4.9 5vkt:B
77 6t58:A 524 14 0.1148 0.0134 0.5000 6.2 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
78 3fbs:B 295 16 0.0984 0.0203 0.3750 6.5 3fbs:A
79 7zus:CCC 650 11 0.1311 0.0123 0.7273 7.5 8e23:A, 8e24:A, 8e24:D, 8gd7:A, 4x0p:A, 4x0p:B, 4x0p:C, 4x0p:D, 4x0q:A, 4x0q:B, 7zus:AAA, 7zus:BBB, 7zx0:AAA, 7zx0:BBB, 7zx0:CCC, 7zx0:DDD, 7zx0:EEE, 7zx0:FFF, 7zx1:AAA, 7zx1:BBB, 7zx1:CCC, 7zx1:DDD, 7zx1:EEE, 7zx1:FFF
80 7e0l:A 491 49 0.2131 0.0265 0.2653 7.7 7e0l:B, 7e0l:K, 7e0l:M, 7wsx:A, 7wsx:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218