Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SMHKPKLCRLAKGENGYGFHLNAIRGLPGSFIKEVQKGGPADLAGLEDEDVIIEVNGVNVLDEPYEKVVDRIQSSGKNVT
LLVCGK

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ezi:A 86 86 1.0000 1.0000 1.0000 4.76e-59 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
2 2m0u:A 117 79 0.4535 0.3333 0.4937 3.91e-19
3 2m0v:A 128 83 0.3953 0.2656 0.4096 2.22e-17
4 6x23:A 89 75 0.3023 0.2921 0.3467 2.08e-10
5 7pcb:A 415 94 0.3953 0.0819 0.3617 4.83e-09 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
6 5heb:A 119 82 0.3023 0.2185 0.3171 2.04e-08 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
7 2egn:A 83 75 0.3256 0.3373 0.3733 9.43e-08
8 5wou:A 95 55 0.2674 0.2421 0.4182 1.33e-07
9 3jxt:A 96 83 0.3140 0.2812 0.3253 4.21e-07 3jxt:B
10 2kqf:A 96 89 0.3721 0.3333 0.3596 5.17e-06 2kyl:A
11 2i0i:A 81 80 0.3140 0.3333 0.3375 5.22e-06 2i0i:B, 2i0i:C
12 2os6:A 89 77 0.3140 0.3034 0.3506 1.63e-04
13 4xh7:A 110 73 0.2907 0.2273 0.3425 1.81e-04
14 2l4t:A 124 58 0.1977 0.1371 0.2931 3.55e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
15 6yx0:B 112 55 0.2326 0.1786 0.3636 4.09e-04 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
16 8b82:A 108 56 0.2209 0.1759 0.3393 6.98e-04 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
17 3bpu:A 86 79 0.3256 0.3256 0.3544 0.001
18 1rzx:A 98 57 0.2326 0.2041 0.3509 0.002 5i7z:A, 1x8s:A
19 3vqg:A 85 58 0.2558 0.2588 0.3793 0.002
20 2r4h:C 98 76 0.2326 0.2041 0.2632 0.003
21 2exg:A 101 78 0.2791 0.2376 0.3077 0.004 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
22 7x2e:A 163 58 0.2326 0.1227 0.3448 0.005 2kbs:A
23 7qqn:C 414 53 0.2209 0.0459 0.3585 0.006 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
24 7d6f:A 87 53 0.2209 0.2184 0.3585 0.009
25 2joa:A 105 35 0.1744 0.1429 0.4286 0.012
26 4wyu:A 201 56 0.2326 0.0995 0.3571 0.016 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
27 4wyu:A 201 57 0.2209 0.0945 0.3333 2.8 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
28 8tua:A 1329 51 0.1977 0.0128 0.3333 0.016 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
29 8tua:A 1329 76 0.2558 0.0166 0.2895 1.0 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
30 4ynn:A 400 32 0.1395 0.0300 0.3750 0.019 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
31 8blu:B 195 76 0.2674 0.1179 0.3026 0.024 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
32 8blu:B 195 52 0.1977 0.0872 0.3269 0.33 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
33 3pv3:A 392 55 0.1744 0.0383 0.2727 0.031 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
34 4e34:A 87 67 0.2674 0.2644 0.3433 0.039 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
35 2qt5:A 194 89 0.2791 0.1237 0.2697 0.21 2qt5:B
36 5f67:A 98 57 0.1744 0.1531 0.2632 0.21 5f67:B
37 8bp4:A 93 58 0.1628 0.1505 0.2414 0.23 8bp4:C, 8bp4:B
38 6gbe:A 119 85 0.2907 0.2101 0.2941 0.31
39 7qct:A 90 58 0.2209 0.2111 0.3276 0.33 7qct:B
40 7xft:A 86 55 0.2093 0.2093 0.3273 0.38
41 7p70:A 407 54 0.2093 0.0442 0.3333 0.46 7pc4:A, 7qql:A
42 7xs0:A 376 58 0.2442 0.0559 0.3621 0.66
43 7qqm:A 413 55 0.2093 0.0436 0.3273 0.86
44 8bv7:A 95 56 0.1977 0.1789 0.3036 0.97 8buw:A, 8buw:B
45 5t63:A 283 34 0.1512 0.0459 0.3824 1.2 5b6l:A, 5gnd:A
46 4gvc:A 94 56 0.1744 0.1596 0.2679 1.2 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
47 5oak:A 90 55 0.1512 0.1444 0.2364 1.6 5oak:C
48 3tsz:A 341 79 0.2907 0.0733 0.3165 1.7 3shw:A
49 2sqc:A 623 39 0.1628 0.0225 0.3590 2.2 1gsz:A, 1gsz:B, 1gsz:C, 1h35:A, 1h35:B, 1h35:C, 1h36:A, 1h36:B, 1h36:C, 1h37:A, 1h37:B, 1h37:C, 1h39:A, 1h39:B, 1h39:C, 1h3a:A, 1h3a:B, 1h3a:C, 1h3b:A, 1h3b:B, 1h3b:C, 1h3c:A, 1h3c:B, 1h3c:C, 1o6h:A, 1o6h:B, 1o6h:C, 1o6q:A, 1o6q:B, 1o6q:C, 1o6r:A, 1o6r:B, 1o6r:C, 1o79:A, 1o79:B, 1o79:C, 2sqc:B, 1ump:A, 1ump:B, 1ump:C
50 9fp6:A 732 54 0.1860 0.0219 0.2963 2.3 9fp6:B, 9fp6:C, 9fp6:D, 9fp6:E, 9fp6:F
51 1zub:A 109 30 0.1628 0.1284 0.4667 2.4
52 6ew9:A 305 34 0.1628 0.0459 0.4118 2.5 6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
53 3gdv:B 284 48 0.1977 0.0599 0.3542 3.0 3gdu:B, 2r3y:A, 4rqz:A, 4rqz:B, 4rqz:C
54 6h2t:A 288 23 0.1163 0.0347 0.4348 5.5 6h1u:A, 6h20:A
55 8kic:A 300 39 0.1628 0.0467 0.3590 6.0 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
56 2pdz:A 86 54 0.1977 0.1977 0.3148 6.1
57 5ur2:B 959 24 0.1163 0.0104 0.4167 6.5 5ur2:A, 5ur2:C, 5ur2:D
58 2vp1:A 313 21 0.1047 0.0288 0.4286 7.0 2vp1:B
59 6zhh:A 883 40 0.1860 0.0181 0.4000 8.3 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
60 2mjp:A 184 35 0.1628 0.0761 0.4000 8.6
61 7w6z:A 414 50 0.1860 0.0386 0.3200 9.5 7w6y:A
62 8ori:D 341 64 0.1977 0.0499 0.2656 9.7 8cly:AAA, 8cly:BBB, 8clz:BBB, 8clz:AAA, 8col:AAA, 8col:BBB, 8col:CCC, 8col:DDD, 8ori:A, 8ori:B, 8ori:C, 8osw:A, 8osw:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417