Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SMEASCLELALEGERLCKSGDCRAGVSFFEAAVQVGTEDLKTLSAIYSQLGNAYFYLHDYAKALEYHHHDLTLARTIGDQ
LGEAKASGNLGNTLKVLGNFDEAIVCCQRHLDISRELNDKVGEARALYNLGNVYHAKGKSFFPEEVRDALQAAVDFYEEN
LSLVTALGDRAAQGRAFGNLGNTHYLLGNFRDAVIAHEQRLLIAKEFGDKAAERRAYSNLGNAYIFLGEFETASEYYKKT
LLLARQLKDRAVEAQSCYSLGNTYTLLQDYEKAIDYHLKHLAIAQELNDRIGEGRACWSLGNAYTALGNHDQAMHFAEKH
LEISRE

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4wng:A 330 329 1.0000 0.9879 0.9909 0.0 7ep7:A, 4g2v:A, 3ro2:A, 3ro3:A, 4wnd:A, 4wne:A, 4wnf:A
2 4a1s:B 342 325 0.6779 0.6462 0.6800 2.39e-165
3 8chy:A 272 313 0.3344 0.4007 0.3482 7.78e-39 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
4 8chy:A 272 276 0.3098 0.3713 0.3659 7.17e-35 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
5 8chy:A 272 241 0.2699 0.3235 0.3651 2.92e-30 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
6 1na0:B 119 110 0.1319 0.3613 0.3909 9.11e-14 1na3:A, 1na3:B
7 1na0:B 119 140 0.1319 0.3613 0.3071 6.52e-09 1na3:A, 1na3:B
8 1na0:B 119 89 0.1043 0.2857 0.3820 7.26e-09 1na3:A, 1na3:B
9 1na0:B 119 71 0.0859 0.2353 0.3944 6.50e-07 1na3:A, 1na3:B
10 3kd7:A 102 108 0.1196 0.3824 0.3611 1.27e-11 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
11 3kd7:A 102 92 0.0951 0.3039 0.3370 7.31e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
12 3kd7:A 102 101 0.0982 0.3137 0.3168 7.82e-07 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
13 3kd7:A 102 120 0.1196 0.3824 0.3250 3.34e-06 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
14 3kd7:A 102 70 0.0736 0.2353 0.3429 4.25e-05 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
15 7t7t:A 466 233 0.1656 0.1159 0.2318 7.48e-09 7t7t:B
16 7t7t:A 466 263 0.1994 0.1395 0.2471 9.12e-09 7t7t:B
17 7t7t:A 466 318 0.2209 0.1545 0.2264 8.98e-07 7t7t:B
18 7t7t:A 466 101 0.0890 0.0622 0.2871 5.18e-06 7t7t:B
19 7t7t:A 466 154 0.1350 0.0944 0.2857 1.21e-05 7t7t:B
20 7t7t:A 466 92 0.0798 0.0558 0.2826 0.012 7t7t:B
21 6mfv:A 641 178 0.1319 0.0671 0.2416 1.10e-04 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
22 6mfv:A 641 129 0.0982 0.0499 0.2481 0.001 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
23 6mfv:A 641 148 0.1012 0.0515 0.2230 0.038 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
24 6mfv:A 641 89 0.0583 0.0296 0.2135 7.8 6mfv:B, 6mfv:C, 6mfv:D
25 7yeh:A 1020 266 0.1933 0.0618 0.2368 3.53e-04 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
26 7yeh:A 1020 294 0.2117 0.0676 0.2347 0.001 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
27 7yeh:A 1020 126 0.1104 0.0353 0.2857 0.010 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
28 7yeh:A 1020 142 0.1074 0.0343 0.2465 0.25 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
29 5lwv:A 711 189 0.1411 0.0647 0.2434 5.19e-04 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
30 5lwv:A 711 144 0.1074 0.0492 0.2431 0.22 5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
31 7y4i:A 822 191 0.1656 0.0657 0.2827 0.001 8dti:A, 8dti:B
32 7y4i:A 822 266 0.2147 0.0852 0.2632 0.043 8dti:A, 8dti:B
33 3uq3:A 258 60 0.0675 0.0853 0.3667 0.001 3upv:A
34 3uq3:A 258 55 0.0583 0.0736 0.3455 2.2 3upv:A
35 3uq3:A 258 27 0.0337 0.0426 0.4074 5.9 3upv:A
36 1elr:A 128 61 0.0552 0.1406 0.2951 0.035 3esk:A, 3fwv:A, 3fwv:B
37 8gl8:I 624 82 0.0644 0.0337 0.2561 0.51
38 5a01:A 681 76 0.0767 0.0367 0.3289 1.1 5a01:B, 5a01:C
39 5a01:A 681 152 0.1135 0.0543 0.2434 3.4 5a01:B, 5a01:C
40 5a01:A 681 104 0.0798 0.0382 0.2500 7.4 5a01:B, 5a01:C
41 8h4q:N 488 77 0.0706 0.0471 0.2987 1.2 8h4h:N, 8h4h:A, 8h4q:A
42 8fmw:AC 221 33 0.0460 0.0679 0.4545 1.3
43 4gpk:J 347 79 0.0706 0.0663 0.2911 1.9 4gpk:A, 4gpk:B, 4gpk:C, 4gpk:D, 4gpk:E, 4gpk:F, 4gpk:G, 4gpk:H, 4gpk:I, 4gpk:K, 4gpk:L
44 4am2:A 159 51 0.0644 0.1321 0.4118 2.1 4am2:B, 4am4:A, 4am4:B, 4am5:A, 4am5:B
45 7qe7:K 531 98 0.0706 0.0433 0.2347 2.4 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
46 8fiq:A 172 67 0.0613 0.1163 0.2985 2.6
47 3juc:A 149 28 0.0368 0.0805 0.4286 3.2
48 6lxn:A 110 32 0.0399 0.1182 0.4062 3.4 6lxn:B
49 3ge6:A 210 78 0.0736 0.1143 0.3077 4.5 3ge6:B
50 4gyo:B 359 71 0.0706 0.0641 0.3239 5.4 4gyo:A
51 1gmw:A 138 33 0.0368 0.0870 0.3636 5.8 1gmw:B, 1gmw:C, 1gmw:D
52 5ze8:A 385 95 0.0767 0.0649 0.2632 6.1

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218