BioLiP

>protein
SLPVLQKESVFQSGAHAYRIPALLYLPGQQSLLAFAEQRAAELIVLRRGDYDAPTHQVQWQAQEVVAQARLDGHRSMNPC
PLYDAQTGTLFLFFIAIPGQVTEQQQLQTRANVTRLCQVTSTDHGRTWSSPRDLTDAAIGPAYREWSTFAVGPGHCLQLN
DRARSLVVPAYAYRKLHIQRPIPSAFCFLSHDHGRTWARGHFVAQDTLECQVAEVEQRVVTLNARSHLRARVQAQSTNDG
LDFQESQLVKKLVEPPPQGCQGSVISFPSPRAQWLLYTHPTHSWQRADLGAYLNPRPPAPEAWSEPVLLAKGSCAYSDLQ
SMGTGPDGSPLFGCLYEANDYEEIVFLMFTLKQAFPAEY

The query sequence (length=359) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2f25:A	373	371	0.9972	0.9598	0.9650	0.0	2f0z:A, 2f10:A, 2f11:A, 2f12:A, 2f13:A, 2f25:B, 2f27:A, 2f27:B, 2f29:A, 2f29:B, 4nc5:A, 4ncs:A, 1vcu:A, 1vcu:B
2	8t26:A	504	361	0.2535	0.1806	0.2521	1.18e-18	8t1y:A, 8t1z:A, 8t24:A, 8t27:A
3	2ber:A	601	340	0.2674	0.1597	0.2824	1.50e-12	2bzd:A, 2bzd:B, 2bzd:C, 1eus:A, 1euu:A, 1w8n:A, 1w8o:A, 1wcq:A, 1wcq:B, 1wcq:C
4	6myv:C	526	214	0.1588	0.1084	0.2664	3.86e-12	6mrv:B, 6mrv:A, 6myv:A, 6myv:B, 6myv:D
5	7qxo:A	519	292	0.2033	0.1407	0.2500	1.22e-10	7qxo:B, 7qy8:A, 7qy8:B, 7qy9:A, 7qy9:B
6	7p1o:X	386	279	0.2284	0.2124	0.2939	2.24e-10	7p1d:A, 7p1e:A, 7p1f:B, 7p1f:A, 7p1o:A
7	8u5o:A	449	271	0.1838	0.1470	0.2435	5.62e-09	2bf6:A, 5tsp:A, 5tsp:B, 8u2a:A, 2vk5:A, 2vk6:A, 2vk7:A, 2vk7:B
8	7lbv:A	380	293	0.2145	0.2026	0.2628	7.51e-09
9	7p1v:A	384	179	0.1504	0.1406	0.3017	1.40e-08	7p1q:A, 7p1r:A, 7p1r:B, 7p1r:C, 7p1r:D, 7p1s:A, 7p1s:B, 7p1s:C, 7p1s:D, 7p1u:A, 7p1u:B, 7p1v:B, 7p1v:C, 7p1v:D
10	9c20:A	451	261	0.1838	0.1463	0.2529	1.12e-07	8url:A, 8uvv:A
11	6qzh:A	744	242	0.1643	0.0793	0.2438	3.07e-07	7a54:A, 7a54:B, 7a5x:A, 7a5x:B, 3h72:A, 3h72:B, 3h73:A, 3h73:B, 5kky:A, 5kky:B, 2vvz:A, 2vvz:B, 2ya5:A, 2ya5:B, 2ya6:A, 2ya6:B, 2ya7:A, 2ya7:B, 2ya7:C, 2ya7:D, 2ya8:A, 2ya8:B
12	2xzj:A	386	278	0.1978	0.1839	0.2554	5.66e-05	4m4v:A, 2xzi:A, 2xzi:B, 2xzj:B, 2xzk:A, 2xzk:B
13	8ul7:A	363	262	0.1616	0.1598	0.2214	5.11e-04	8ule:A, 8um0:A
14	1dil:A	381	159	0.1170	0.1102	0.2642	0.016	7aey:AAA, 1dim:A, 2sim:A, 6tvi:AAA
15	3b69:A	626	317	0.1866	0.1070	0.2114	0.079	2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
16	5f9t:A	659	157	0.1058	0.0577	0.2420	0.24	5f9t:B, 4yw1:A, 4yw1:B, 4yw2:A, 4yw2:B, 4yw3:A, 4yw3:B, 4yw5:A, 4yw5:B, 4yz2:A, 4yz2:B, 4yz3:A, 4yz3:B, 4yz4:A, 4yz4:B, 4yz5:A, 4yz5:B
17	5cwa:A	505	36	0.0418	0.0297	0.4167	0.44
18	4m2j:A	382	44	0.0474	0.0445	0.3864	1.9	4m2k:A, 4m2m:A
19	2isa:A	482	84	0.0585	0.0436	0.2500	4.8	2isa:B, 2isa:C, 2isa:D, 2isa:E, 2isa:F, 2isa:G, 2isa:H
20	2b06:A	150	50	0.0446	0.1067	0.3200	7.6
21	5g5v:A	335	34	0.0362	0.0388	0.3824	8.9	7a28:A, 7a28:B, 7a2f:A, 7a2f:B, 6fds:A, 6fds:B, 6fdw:A, 6fdw:B, 6fdx:A, 6fdx:B, 6fe3:A, 6fe3:B, 6frd:A, 6frd:B, 6ftm:A, 6ftm:B, 6fv9:A, 6fv9:B, 5g2b:A, 5g2b:B, 5g57:A, 5g57:B, 5g5v:B, 6gxq:A, 6gxq:B, 4i15:A, 4i15:B, 5l8c:A, 5l8c:B, 5l8y:A, 5l8y:B, 5l9h:A, 5l9h:B, 4phl:A, 4phl:B, 6qgp:A, 6qgp:B, 6qgu:A, 6qgu:B, 6rb6:A, 6rb6:B, 6rfn:A, 6rfn:B, 6rfw:A, 6rfw:B, 6rgk:A, 6rgk:B

[Back]