Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLMNIVLHKEDGLGFSIAGGVGNQHIINDNGIFVTKIIEGGAAFQDGRLEVGDRITKVNTLSLENVTHEEAVAILKETAD
VVSLVVVKP

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8bq8:C 93 90 1.0000 0.9570 0.9889 6.02e-57 8bq8:A, 8bq8:B
2 2ka9:A 189 89 0.6629 0.3122 0.6629 8.35e-33 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 77 0.4944 0.2328 0.5714 5.45e-22 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 7pc3:A 405 89 0.6404 0.1407 0.6404 4.99e-30 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
5 8cn1:H 101 77 0.4944 0.4356 0.5714 7.89e-24 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 8c1t:A 90 84 0.4382 0.4333 0.4643 6.50e-19 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
7 7p73:A 420 75 0.4045 0.0857 0.4800 3.13e-17 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 6xa7:B 96 85 0.3820 0.3542 0.4000 5.64e-17 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
9 4wyu:A 201 92 0.4270 0.1891 0.4130 8.63e-15 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
10 4wyu:A 201 79 0.3371 0.1493 0.3797 3.07e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
11 3jxt:A 96 86 0.4270 0.3958 0.4419 1.75e-14 3jxt:B
12 2m0z:A 97 79 0.3708 0.3402 0.4177 2.43e-14 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
13 1n7t:A 103 89 0.3820 0.3301 0.3820 2.81e-13 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
14 2exg:A 101 89 0.3708 0.3267 0.3708 5.02e-13 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
15 3ch8:A 190 79 0.3708 0.1737 0.4177 3.73e-12 2qbw:A
16 5wou:A 95 78 0.3708 0.3474 0.4231 1.65e-11
17 8bv7:A 95 60 0.3258 0.3053 0.4833 1.71e-11 8buw:A, 8buw:B
18 8b82:A 108 84 0.3483 0.2870 0.3690 3.30e-11 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
19 7qqm:A 413 85 0.3820 0.0823 0.4000 4.59e-11
20 6q0m:B 94 89 0.3483 0.3298 0.3483 5.21e-11
21 2kaw:A 90 79 0.3483 0.3444 0.3924 6.65e-11 6lcb:A, 2mx6:A
22 4xhv:A 94 80 0.3596 0.3404 0.4000 7.36e-11
23 5heb:A 119 88 0.3820 0.2857 0.3864 7.61e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
24 2l4t:A 124 84 0.3820 0.2742 0.4048 8.14e-11 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
25 8bp4:A 93 84 0.3371 0.3226 0.3571 9.54e-11 8bp4:C, 8bp4:B
26 1l6o:A 95 71 0.3034 0.2842 0.3803 1.40e-10 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
27 6zbq:A 89 71 0.2921 0.2921 0.3662 3.13e-10 6zc4:A
28 7qct:A 90 91 0.3146 0.3111 0.3077 1.22e-09 7qct:B
29 2koh:A 111 67 0.3258 0.2613 0.4328 1.28e-08 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
30 2pdz:A 86 85 0.4045 0.4186 0.4235 2.08e-08
31 3tsz:A 341 75 0.3258 0.0850 0.3867 3.88e-08 3shw:A
32 6gbe:A 119 87 0.3146 0.2353 0.3218 5.01e-08
33 7p70:A 407 82 0.4045 0.0885 0.4390 5.07e-08 7pc4:A, 7qql:A
34 2qt5:A 194 85 0.3034 0.1392 0.3176 1.24e-07 2qt5:B
35 2qt5:A 194 82 0.3146 0.1443 0.3415 1.78e-05 2qt5:B
36 2i0i:A 81 82 0.3820 0.4198 0.4146 1.26e-07 2i0i:B, 2i0i:C
37 4e34:A 87 89 0.3708 0.3793 0.3708 2.11e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
38 7weg:B 96 80 0.3371 0.3125 0.3750 2.86e-07 7weg:A
39 2os6:A 89 86 0.3146 0.3146 0.3256 9.83e-07
40 7x2e:A 163 76 0.3034 0.1656 0.3553 1.35e-06 2kbs:A
41 7d6f:A 87 86 0.2921 0.2989 0.3023 1.74e-06
42 7pc5:A 405 76 0.3034 0.0667 0.3553 5.91e-06
43 5zys:A 90 77 0.2809 0.2778 0.3247 1.85e-05
44 7qqn:C 414 75 0.2921 0.0628 0.3467 3.69e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
45 6x23:A 89 84 0.2472 0.2472 0.2619 4.22e-05
46 6nid:B 88 58 0.2135 0.2159 0.3276 7.00e-05 6nid:A, 6nid:C
47 2m0u:A 117 81 0.2697 0.2051 0.2963 7.01e-05
48 1n7f:A 86 57 0.2022 0.2093 0.3158 9.80e-05 1n7f:B
49 1ihj:B 95 61 0.2247 0.2105 0.3279 1.50e-04 1ihj:A
50 1b8q:A 127 80 0.2697 0.1890 0.3000 1.54e-04
51 3vqg:A 85 62 0.2022 0.2118 0.2903 2.36e-04
52 4xh7:A 110 78 0.2584 0.2091 0.2949 2.68e-04
53 7pcb:A 415 93 0.3146 0.0675 0.3011 3.17e-04 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
54 6kz1:A 97 65 0.2584 0.2371 0.3538 5.76e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
55 2ejy:A 85 54 0.2022 0.2118 0.3333 8.82e-04
56 3r0h:D 199 89 0.3034 0.1357 0.3034 0.002 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
57 5n7d:A 423 65 0.2135 0.0449 0.2923 0.004 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
58 2kpl:A 129 65 0.2135 0.1473 0.2923 0.006
59 2egn:A 83 52 0.2247 0.2410 0.3846 0.006
60 4wsi:A 372 58 0.1461 0.0349 0.2241 0.011 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
61 1zub:A 109 74 0.2697 0.2202 0.3243 0.012
62 6ar4:B 87 72 0.2247 0.2299 0.2778 0.060 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
63 1u38:A 89 45 0.1461 0.1461 0.2889 0.061
64 3cyy:B 81 57 0.1798 0.1975 0.2807 0.064 3cyy:A
65 1rzx:A 98 81 0.2472 0.2245 0.2716 0.069 5i7z:A, 1x8s:A
66 6yx0:B 112 93 0.2584 0.2054 0.2473 0.21 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
67 5h3h:B 269 31 0.1461 0.0483 0.4194 0.35 5h3h:A
68 5f67:A 98 85 0.2809 0.2551 0.2941 0.36 5f67:B
69 2m0v:A 128 57 0.1910 0.1328 0.2982 0.56
70 5ez0:D 95 81 0.2135 0.2000 0.2346 0.59 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
71 5oak:A 90 56 0.1685 0.1667 0.2679 1.8 5oak:C
72 6hks:B 94 73 0.2360 0.2234 0.2877 2.1 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
73 3bpu:A 86 68 0.2135 0.2209 0.2794 2.4
74 6n2n:B 291 38 0.1573 0.0481 0.3684 4.6 6n2n:D, 6n2o:B, 6n2o:D
75 5ha5:D 244 51 0.2135 0.0779 0.3725 6.2 5ha5:B, 5ha5:C
76 6b0j:A 452 44 0.1573 0.0310 0.3182 6.2 6b0j:B, 6b0j:C, 6b0k:A, 6b0k:B, 6b0k:C, 6b1v:A, 6b1v:B, 6b1v:C, 6bia:A, 6bia:B, 6bia:C
77 7yp9:D 1285 53 0.1798 0.0125 0.3019 7.0
78 8xud:D 651 39 0.1236 0.0169 0.2821 9.2 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218