Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SEPFYITTAIAYPNGVPHIGHAYEYIATDAIARFKRLDGYDVRYLTGTDVHGQKMAETAAKEGIPAAELARRNSDVFQRL
QEKLNISFDRFIRTSDADHYEASKAIWKRMADAGDIYLDAYTEEQTYFFRLSAYTDRLLALYEEHPEFIGPDARRNEIVS
FVSGGLKDLSISRTTFDWGVPVPDHPDHVMYVWVDALTNYLTGVGFPDTESESFRRYWPADLHMIGKDIIRFHTVYWPAF
LMSAGLPLPKRIFAHGWLLNRGEKMSKSIGNVVDPVNLVDTFGLDQVRYFLLREVPFGQDGSYNEDAIIGRVNADLANEL
GNLAQRSLSMVAKNLGAAVPDPGEFTDEDTALLAAADALLERVREHFDVPAMHLALEAIWSVLGAANRYFSAQEPWVLRK
SDAAEDQQRFRTVLYTTLEVVRIASLLLQPVMPESTAKLLDLLGQPTDERDFSAIANRIKPGTSLPAPSGIFPRYQ

The query sequence (length=476) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2x1l:C 476 476 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2x1l:B
2 2x1l:A 511 511 0.9979 0.9295 0.9295 0.0 2x1m:A
3 6ax8:A 509 508 0.7563 0.7073 0.7087 0.0 5xet:C
4 5k0t:B 468 482 0.6113 0.6218 0.6037 0.0
5 5k0s:C 497 510 0.6155 0.5895 0.5745 0.0 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
6 2ct8:A 465 444 0.4454 0.4559 0.4775 1.28e-147 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
7 7wpt:A 483 450 0.4202 0.4141 0.4444 1.04e-141 7wpn:A
8 7wpi:A 520 487 0.4223 0.3865 0.4127 2.22e-136 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
9 4eg6:B 515 504 0.4412 0.4078 0.4167 6.19e-130 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
10 3kfl:A 530 516 0.4223 0.3792 0.3895 1.47e-126 6swx:A
11 4eg7:B 536 525 0.4412 0.3918 0.4000 1.77e-126 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
12 1a8h:A 500 483 0.3866 0.3680 0.3810 4.22e-108 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
13 1pg0:A 492 452 0.2605 0.2520 0.2743 3.86e-52 1pg2:A
14 1rqg:A 606 529 0.3067 0.2409 0.2760 4.72e-52
15 7ulz:A 521 483 0.2794 0.2553 0.2754 2.24e-47
16 1pfu:A 547 508 0.2710 0.2358 0.2539 5.04e-45 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
17 5urb:A 546 507 0.2626 0.2289 0.2465 1.51e-41 5urb:B
18 6wq6:A 547 536 0.3046 0.2651 0.2705 1.32e-38 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
19 5goy:A 598 297 0.1912 0.1522 0.3064 1.66e-24 5gl7:A
20 5goy:A 598 116 0.0735 0.0585 0.3017 2.02e-11 5gl7:A
21 1obh:A 762 140 0.0840 0.0525 0.2857 2.94e-12
22 1gax:A 862 329 0.1765 0.0974 0.2553 4.53e-12 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
23 1gax:A 862 50 0.0399 0.0220 0.3800 0.004 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
24 1ile:A 821 188 0.1134 0.0658 0.2872 2.50e-11 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
25 1ile:A 821 139 0.0798 0.0463 0.2734 0.015 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
26 3ziu:A 621 117 0.0798 0.0612 0.3248 5.49e-11 3ziu:B
27 3ziu:A 621 105 0.0651 0.0499 0.2952 2.30e-07 3ziu:B
28 8c8v:A 1032 107 0.0840 0.0388 0.3738 2.04e-10 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
29 8c8v:A 1032 39 0.0357 0.0165 0.4359 0.001 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
30 2bte:A 876 118 0.0693 0.0377 0.2797 2.05e-08 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
31 4ari:A 821 142 0.0777 0.0451 0.2606 2.27e-08 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
32 4ari:A 821 47 0.0357 0.0207 0.3617 0.079 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
33 6q89:A 852 120 0.0651 0.0364 0.2583 1.38e-07 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
34 6q89:A 852 73 0.0483 0.0270 0.3151 0.005 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
35 8c9e:A 921 276 0.1408 0.0727 0.2428 1.50e-07 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
36 8c9e:A 921 41 0.0378 0.0195 0.4390 0.001 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
37 7nu2:A 875 120 0.0651 0.0354 0.2583 1.58e-07 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
38 7nu2:A 875 92 0.0588 0.0320 0.3043 0.001 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
39 1wz2:A 948 54 0.0525 0.0264 0.4630 1.25e-06 1wz2:B
40 1wz2:A 948 241 0.1155 0.0580 0.2282 3.74e-06 1wz2:B
41 1ffy:A 917 131 0.0819 0.0425 0.2977 4.98e-06 1qu2:A, 1qu3:A
42 1ffy:A 917 106 0.0693 0.0360 0.3113 8.43e-04 1qu2:A, 1qu3:A
43 3zgz:D 867 119 0.0630 0.0346 0.2521 1.37e-05 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
44 3zgz:D 867 47 0.0357 0.0196 0.3617 0.078 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
45 6lpf:B 1006 249 0.1282 0.0606 0.2450 3.53e-05 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
46 6lpf:B 1006 101 0.0504 0.0239 0.2376 3.0 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
47 8qhp:A 410 406 0.1975 0.2293 0.2315 4.28e-05 8qhp:B
48 8wnf:A 918 107 0.0693 0.0359 0.3084 7.84e-05 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
49 8wnf:A 918 55 0.0399 0.0207 0.3455 0.039 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
50 5ah5:A 789 118 0.0672 0.0406 0.2712 2.83e-04 5ah5:B
51 5ah5:A 789 31 0.0378 0.0228 0.5806 0.004 5ah5:B
52 6ujd:A 406 281 0.1387 0.1626 0.2349 0.003
53 1u0b:B 461 302 0.1492 0.1540 0.2351 0.005 1li5:A, 1li7:A
54 6ldk:A 813 107 0.0567 0.0332 0.2523 0.005
55 6ldk:A 813 108 0.0546 0.0320 0.2407 1.0
56 7d5c:A 919 108 0.0588 0.0305 0.2593 0.042
57 7d5c:A 919 88 0.0483 0.0250 0.2614 0.60
58 3tqo:A 387 70 0.0420 0.0517 0.2857 0.070
59 3tqo:A 387 43 0.0336 0.0413 0.3721 1.5
60 1li7:B 375 36 0.0294 0.0373 0.3889 0.26 1li5:B
61 4d2s:A 249 71 0.0399 0.0763 0.2676 0.74 4c4h:A
62 8hfn:A 413 74 0.0399 0.0460 0.2568 0.89 3c8z:A, 3c8z:B, 8hfm:A, 8hfo:A
63 5ntt:A 277 71 0.0399 0.0686 0.2676 0.90 5ap0:A, 5ap1:A, 5ap2:A, 5ap3:A, 5ap4:A, 5ap5:A, 5ap6:A, 5ap7:A, 6b4w:A, 4bhz:A, 4bi0:A, 4bi1:A, 4bi2:A, 4c4e:A, 4c4f:A, 4c4g:A, 4c4i:A, 4c4j:A, 7chm:A, 7chn:A, 7cht:A, 7cil:A, 7cja:A, 7clh:A, 4cv8:A, 4cv9:A, 4cva:A, 5eh0:A, 5ehl:A, 5eho:A, 5ehy:A, 5ei2:A, 5ei6:A, 5ei8:A, 3gfw:A, 6h3k:A, 3h9f:A, 3hmn:A, 3hmo:A, 3hmp:A, 4js8:A, 4jt3:A, 5ljj:A, 7lqd:A, 5mrb:A, 6n6o:A, 5n7v:A, 5n84:A, 5n87:A, 5n93:A, 5n9s:A, 5na0:A, 5nad:A, 4o6l:A, 4o6l:B, 5o91:A, 6tn9:A, 6tnb:A, 6tnc:A, 6tnd:A, 3vqu:A, 3w1f:A, 3wyx:A, 3wyy:A, 3wzj:A, 3wzk:A, 2x9e:A, 4zeg:A, 2zmd:A
64 8cv2:A 433 98 0.0588 0.0647 0.2857 1.6 8ctc:A, 8ctc:B, 8ctc:C, 8ctd:A, 8cua:A, 8cua:B, 8cua:C, 8cv2:B, 8cv2:C, 8cv3:A, 7nsg:A, 7nsg:B, 7nsg:C, 6s3q:A, 6s3q:B, 6s3q:C, 6x2z:A, 6x3e:A
65 5hld:A 649 59 0.0483 0.0354 0.3898 2.0
66 5hlb:A 733 59 0.0483 0.0314 0.3898 2.3
67 3vma:A 708 59 0.0483 0.0325 0.3898 2.3 5fgz:A, 3fwl:A, 5hl9:A, 5hla:A, 6yn0:A
68 6s6b:K 1024 52 0.0378 0.0176 0.3462 4.4 6s8b:K, 6s8e:K, 6s91:K, 6sh8:K, 6shb:K, 6sic:K
69 2zue:A 628 46 0.0336 0.0255 0.3478 6.4 2zuf:A
70 8h9v:D 432 21 0.0189 0.0208 0.4286 6.7
71 8h9t:D 442 21 0.0189 0.0204 0.4286 6.8 8h9p:D
72 1mab:B 477 21 0.0189 0.0189 0.4286 6.9 4asu:D, 4asu:E, 4asu:F, 1bmf:D, 1bmf:F, 2ck3:D, 2ck3:E, 2ck3:F, 1cow:D, 1cow:E, 1cow:F, 1e1q:D, 1e1q:E, 1e1q:F, 1e1r:D, 1e1r:F, 1e79:D, 1e79:F, 1efr:E, 1efr:D, 1efr:F, 2f43:B, 1h8e:D, 1h8e:E, 1h8e:F, 1h8h:D, 1h8h:F, 8h9e:E, 8h9e:F, 8h9e:D, 8h9i:E, 8h9i:F, 8h9i:D, 8h9l:E, 8h9l:F, 8h9l:D, 8h9p:E, 8h9p:F, 8h9s:E, 8h9s:F, 8h9s:D, 8h9t:E, 8h9t:F, 8h9u:E, 8h9u:F, 8h9u:D, 8h9v:F, 6j5i:D, 6j5i:F, 6j5j:D, 6j5j:F, 6j5k:D, 6j5k:F, 6j5k:AD, 6j5k:AF, 6j5k:BD, 6j5k:BF, 6j5k:CD, 6j5k:CF, 2jdi:D, 2jdi:F, 2jiz:D, 2jiz:F, 2jiz:K, 2jiz:M, 2jj1:D, 2jj1:F, 2jj1:K, 2jj1:M, 2jj2:D, 2jj2:F, 2jj2:L, 2jj2:K, 2jj2:M, 8ki3:E, 8ki3:D, 8ki3:F, 1nbm:D, 1nbm:F, 1ohh:D, 1ohh:F, 4tsf:E, 4tsf:F, 4tsf:D, 4tt3:F, 4tt3:E, 4tt3:D, 6tt7:D, 6tt7:F, 2v7q:D, 2v7q:F, 1w0j:D, 1w0j:E, 1w0j:F, 1w0k:D, 1w0k:E, 1w0k:F, 2w6e:D, 2wss:D, 2wss:F, 2wss:M, 2wss:O, 2xnd:D, 2xnd:F, 4yxw:D, 4yxw:E, 4yxw:F, 6yy0:D, 6yy0:E, 6yy0:F, 4z1m:F, 4z1m:E, 4z1m:D, 6z1r:E, 6z1r:D, 6z1r:F, 6z1u:E, 6z1u:D, 6z1u:F, 6zpo:D, 6zpo:E, 6zpo:F, 6zqm:E, 6zqm:D, 6zqm:F, 6zqn:E, 6zqn:D, 6zqn:F
73 7c23:A 194 111 0.0693 0.1701 0.2973 8.2 7c29:A, 7c29:B
74 5lj3:C 882 64 0.0336 0.0181 0.2500 9.0 6exn:C, 5gam:C, 5gan:C, 5lj5:C, 5lqw:B, 5mps:C, 5mq0:C, 5nrl:C
75 6j6g:C 920 64 0.0336 0.0174 0.2500 9.8 7b9v:C, 6bk8:B, 7dco:C, 5gm6:C, 5gmk:C, 6j6h:C, 6j6n:C, 6j6q:C, 3jcm:H, 6teo:A, 6teo:C, 5wsg:C, 5y88:C, 5ylz:C, 5zwm:C, 5zwo:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218