Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SDETKFIFDQFPKARTVQVRKEGFLGIMVIYGKHAEVGSGIFISDLREGSNAELAGVKVGDMLLAVNQDVTLESNYDDAT
GLLKRAEGVVTMILLTL

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5f67:A 98 97 1.0000 0.9898 1.0000 7.47e-67 5f67:B
2 5wou:A 95 55 0.2165 0.2211 0.3818 4.05e-06
3 2l4t:A 124 56 0.2062 0.1613 0.3571 1.14e-05 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
4 6xa7:B 96 82 0.3196 0.3229 0.3780 3.62e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
5 8b82:A 108 78 0.2990 0.2685 0.3718 1.89e-04 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
6 1b8q:A 127 66 0.2577 0.1969 0.3788 4.05e-04
7 3jxt:A 96 67 0.2474 0.2500 0.3582 5.83e-04 3jxt:B
8 4e34:A 87 65 0.2371 0.2644 0.3538 0.004 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
9 5heb:A 119 80 0.2990 0.2437 0.3625 0.004 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
10 1l6o:A 95 72 0.2784 0.2842 0.3750 0.005 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
11 2kaw:A 90 71 0.2474 0.2667 0.3380 0.006 6lcb:A, 2mx6:A
12 8blu:B 195 52 0.1753 0.0872 0.3269 0.017 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
13 4wyu:A 201 72 0.2474 0.1194 0.3333 0.027 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
14 4wyu:A 201 79 0.2474 0.1194 0.3038 4.8 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
15 2os6:A 89 44 0.1443 0.1573 0.3182 0.045
16 8tua:A 1329 51 0.1237 0.0090 0.2353 0.052 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
17 2exg:A 101 83 0.2371 0.2277 0.2771 0.052 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
18 8bp4:A 93 81 0.2784 0.2903 0.3333 0.13 8bp4:C, 8bp4:B
19 1n7f:A 86 53 0.1959 0.2209 0.3585 0.18 1n7f:B
20 4ynn:A 400 34 0.1340 0.0325 0.3824 0.18 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
21 8kic:A 300 54 0.1856 0.0600 0.3333 0.24 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
22 6ezi:A 86 57 0.1546 0.1744 0.2632 0.25 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
23 3pv3:A 392 55 0.1753 0.0434 0.3091 0.28 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
24 6zbq:A 89 70 0.2371 0.2584 0.3286 0.31 6zc4:A
25 7p70:A 407 77 0.2784 0.0663 0.3506 0.32 7pc4:A, 7qql:A
26 7x2e:A 163 55 0.1649 0.0982 0.2909 0.52 2kbs:A
27 6brm:B 263 46 0.1649 0.0608 0.3478 0.57 6brm:A, 6brm:C, 6brm:D, 6brm:E, 6brm:F, 6brm:G, 6brm:H
28 2m0u:A 117 63 0.1856 0.1538 0.2857 0.57
29 1ihj:B 95 50 0.1856 0.1895 0.3600 0.61 1ihj:A
30 2egn:A 83 26 0.1134 0.1325 0.4231 0.65
31 7d6f:A 87 46 0.1856 0.2069 0.3913 0.66
32 2qt5:A 194 86 0.2680 0.1340 0.3023 0.74 2qt5:B
33 8bq8:C 93 59 0.1959 0.2043 0.3220 0.78 8bq8:A, 8bq8:B
34 7pc3:A 405 62 0.1856 0.0444 0.2903 0.80 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
35 2pdz:A 86 74 0.2577 0.2907 0.3378 0.90
36 2i0i:A 81 45 0.1856 0.2222 0.4000 1.1 2i0i:B, 2i0i:C
37 3cs0:A 392 54 0.1753 0.0434 0.3148 1.6 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
38 3cs0:A 392 29 0.0928 0.0230 0.3103 6.9 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
39 4xh7:A 110 61 0.2165 0.1909 0.3443 1.9
40 8bv7:A 95 30 0.1237 0.1263 0.4000 2.4 8buw:A, 8buw:B
41 7qqn:C 414 81 0.2062 0.0483 0.2469 2.6 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
42 5t63:A 283 28 0.1134 0.0389 0.3929 3.6 5b6l:A, 5gnd:A
43 2ka9:A 189 61 0.1856 0.0952 0.2951 3.6 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
44 6wou:A 3921 33 0.1340 0.0033 0.3939 4.9 6wou:B, 6wou:C, 6wou:D, 6wov:A, 6wov:B, 6wov:C, 6wov:D
45 8uxh:A 4004 33 0.1340 0.0032 0.3939 4.9 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
46 8dtz:A 4061 33 0.1340 0.0032 0.3939 4.9 8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
47 8uxl:A 4232 33 0.1340 0.0031 0.3939 4.9 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
48 7ua3:A 4443 33 0.1340 0.0029 0.3939 4.9 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
49 8dty:A 4004 33 0.1340 0.0032 0.3939 5.1 8dty:B, 8dty:C, 8dty:D
50 2cdu:A 451 25 0.0825 0.0177 0.3200 5.2 2cdu:B
51 4a8f:B 664 41 0.1340 0.0196 0.3171 6.2 4a8f:A, 4a8f:C, 4a8k:B, 4a8k:A, 4a8k:C, 4a8m:Q, 4a8m:P, 4a8m:R, 4a8o:A, 4a8o:B, 4a8o:C, 4a8q:A, 4a8q:B, 4a8q:C, 4a8s:A, 4a8s:B, 4a8s:C, 4a8w:A, 4a8w:B, 4a8w:C, 4a8y:A, 4a8y:B, 4a8y:C, 4b02:A, 4b02:B, 4b02:C, 5fj6:A, 5fj7:C, 1hhs:A, 1hhs:B, 1hhs:C, 1hht:P, 1hht:Q, 1hht:R, 1hi0:P, 1hi0:Q, 1hi0:R, 1hi1:A, 1hi1:B, 1hi1:C, 1hi8:A, 1hi8:B, 2jlf:A, 2jlf:B, 2jlg:A, 2jlg:B, 2jlg:C, 1uvi:A, 1uvi:B, 1uvi:C, 1uvj:A, 1uvj:B, 1uvj:C, 1uvk:A, 1uvk:C, 1uvk:E, 1uvl:A, 1uvl:C, 1uvl:E, 1uvm:A, 1uvm:B, 1uvm:C, 1uvn:A, 1uvn:C, 1uvn:E
52 7e0d:A 604 34 0.1443 0.0232 0.4118 7.1 7e0c:A, 2e1m:A, 2e1m:B, 2e1m:C, 8jpw:A
53 2koh:A 111 54 0.1856 0.1622 0.3333 7.6 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
54 6n8e:A 1332 48 0.1546 0.0113 0.3125 8.3
55 3tsz:A 341 28 0.1237 0.0352 0.4286 8.7 3shw:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218