BioLiP

>protein
SALNKAPGYQDFPAYYSDSAHADDQVTHPDVVVLEEPWNGYRYWAVYTPNVMRISIYENPSIVASSDGVHWVEPEGLSNP
IEPQPPSTRYHNCDADMVYNAEYDAMMAYWNWADDQGGGVGAEVRLRISYDGVHWGVPVTYDEMTRVWSKPTSDAERQVA
DGEDDFITAIASPDRYDMLSPTIVYDDFRDVFILWANNTGDVGYQNGQANFVEMRYSDDGITWGEPVRVNGFLGLDENGQ
QLAPWHQDVQYVPDLKEFVCISQCFAGRNPDGSVLHLTTSKDGVNWEQVGTKPLLSPGPDGSWDDFQIYRSSFYYEPGSS
AGDGTMRVWYSALQKDTNNKMVADSSGNLTIQAKSEDDRIWRIGYAENSFVEMMRVLLDDPGYTT

The query sequence (length=385) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6n1a:A	386	385	1.0000	0.9974	1.0000	0.0	6n1b:A
2	2ber:A	601	200	0.1325	0.0849	0.2550	0.066	2bzd:A, 2bzd:B, 2bzd:C, 1eus:A, 1euu:A, 1w8n:A, 1w8o:A, 1wcq:A, 1wcq:B, 1wcq:C
3	2npn:A	238	79	0.0545	0.0882	0.2658	0.19
4	2e74:C	288	66	0.0545	0.0729	0.3182	0.30	2d2c:C, 2d2c:P, 2e75:C, 2e76:C, 4h0l:C, 4h13:C, 4i7z:C, 4pv1:C, 1vf5:C, 1vf5:P
5	2ood:A	463	38	0.0468	0.0389	0.4737	0.49
6	2obe:A	915	111	0.0805	0.0339	0.2793	3.8	2obe:B, 2obe:C
7	7ern:C	284	58	0.0494	0.0669	0.3276	4.8	7erm:A, 7erm:B, 7erm:C, 7erm:D, 7ern:A, 7ern:B, 7ern:D, 7ero:A, 7ero:B, 7ero:C, 7ero:D
8	6z7n:A	788	105	0.0727	0.0355	0.2667	5.9
9	5qcd:A	223	59	0.0519	0.0897	0.3390	6.0	2f1g:A, 2f1g:B, 2fq9:A, 2fq9:B, 2fra:A, 2fra:B, 2frq:A, 2frq:B, 2ft2:A, 2ft2:B, 2fud:A, 2fud:B, 2fye:A, 2g6d:A, 2g7y:A, 2g7y:B, 9gj2:A, 9gj2:B, 2h7j:A, 2h7j:B, 2hh5:B, 2hh5:A, 2hhn:B, 2hxz:A, 2hxz:B, 2hxz:C, 3iej:A, 3iej:B, 1ms6:A, 3n3g:A, 3n3g:B, 3n4c:A, 3n4c:B, 1npz:A, 1npz:B, 1nqc:A, 2op3:A, 2op3:B, 3ovx:A, 3ovx:B, 4p6e:A, 4p6e:B, 4p6g:A, 4p6g:B, 4p6g:C, 4p6g:D, 8pi3:A, 5qbu:A, 5qbu:B, 5qbv:A, 5qbv:B, 5qbw:A, 5qbx:A, 5qbx:B, 5qby:A, 5qby:B, 5qbz:A, 5qc0:A, 5qc0:B, 5qc1:A, 5qc1:B, 5qc2:A, 5qc2:B, 5qc3:A, 5qc3:B, 5qc4:A, 5qc4:B, 5qc5:A, 5qc5:B, 5qc6:A, 5qc6:B, 5qc7:A, 5qc7:B, 5qc8:A, 5qc8:B, 5qc9:A, 5qc9:B, 5qca:A, 5qca:B, 5qcb:A, 5qcb:B, 5qcc:A, 5qcc:B, 5qce:A, 5qce:B, 5qcf:A, 5qcg:A, 5qcg:B, 5qch:A, 5qch:B, 5qch:D, 5qch:C, 5qci:A, 5qcj:A, 5qcj:B, 5qcj:C, 2r9m:A, 2r9m:B, 2r9n:A, 2r9n:B, 2r9o:A, 2r9o:B, 8rnd:A, 6yyn:AAA, 6yyn:BBB, 6yyo:AAA, 6yyo:BBB, 6yyp:AAA, 6yyq:AAA, 6yyq:BBB, 6yyq:CCC, 6yyr:AAA, 6yyr:BBB
10	7mkr:AAA	240	95	0.0649	0.1042	0.2632	6.3	7mks:AAA
11	4yn2:A	281	55	0.0494	0.0676	0.3455	8.8

[Back]