BioLiP

>protein
RRRVFLDVTIDGNLAGRIVMELYNDIAPRTCNNFLMLCTGMAGTGKISGKPLHYKGSTFHRVIKNFMIQGGDFTKGDGTG
GESIYGGMFDDEEFVMKHDEPFVVSMANKGPNTNGSQFFITTTPAPHLNNIHVVFGKVVSGQEVVTKIEYLKTNSKNRPL
ADVVILNCGELV

The query sequence (length=172) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1c5f:A	177	172	1.0000	0.9718	1.0000	1.41e-127	1c5f:C, 1c5f:E, 1c5f:G, 1c5f:O, 1c5f:I, 1c5f:K, 1c5f:M
2	2wfj:A	172	171	0.6047	0.6047	0.6082	1.04e-79
3	4hy7:A	170	169	0.6163	0.6235	0.6272	1.03e-68
4	1e3b:A	172	171	0.5930	0.5930	0.5965	1.65e-68	1e8k:A, 2igv:A, 2igw:A
5	4jjm:A	170	171	0.5988	0.6059	0.6023	1.07e-66	4jjm:B
6	5yba:C	175	171	0.5698	0.5600	0.5731	3.21e-66	5yba:A
7	1qng:A	170	172	0.5698	0.5765	0.5698	9.75e-63	1qnh:A, 1qnh:B
8	2poy:B	172	167	0.5930	0.5930	0.6108	1.32e-62	2poy:A, 2poy:C
9	6hmz:X	170	169	0.5523	0.5588	0.5621	2.83e-61
10	1vdn:A	161	169	0.5465	0.5839	0.5562	6.08e-60
11	3ici:A	187	169	0.5233	0.4813	0.5325	1.41e-58	1cyn:A, 3ici:B, 8kc9:C
12	3eov:A	166	171	0.5640	0.5843	0.5673	5.25e-56	3eov:B
13	8b58:B	200	170	0.5000	0.4300	0.5059	5.73e-55	8b58:A
14	5a0e:A	165	168	0.5233	0.5455	0.5357	3.93e-54	5a0e:B, 5cbt:A, 5cbu:A, 5cbv:A, 5cbw:A, 5ccn:A, 5ccq:A, 5ccr:A, 5ccs:X, 8ejx:A, 4j58:A, 4j59:A, 4j5a:X, 4j5b:A, 4j5c:X, 4j5d:X, 4j5e:X, 7ogi:A, 7pmt:A, 7r2i:A, 7r2j:A, 7r2l:A, 3r49:A, 3r4g:A, 3r54:A, 3r56:A, 3r57:A, 3r59:A, 6r8l:A, 6r8o:A, 6r8w:A, 6r9s:A, 6r9u:A, 6r9x:A, 6ra1:A, 3rcf:A, 3rci:X, 3rck:X, 3rcl:A, 3rd9:X, 3rda:X, 3rdb:A, 3rdc:A, 7tgs:X, 7tgt:X, 7tgu:X, 7tgv:X, 7th1:X, 7th6:A, 7th7:A, 7thc:A, 7thd:A, 7thf:A, 4tot:A, 4tot:B, 4tot:D, 4tot:C, 4xnc:A, 2z6w:A, 2z6w:B, 7zdn:A, 7zdn:B, 4zsc:A, 4zsd:A
15	1xq7:A	166	171	0.5349	0.5542	0.5380	5.94e-54	1xq7:B, 1xq7:C
16	2rmc:A	182	169	0.5291	0.5000	0.5385	1.05e-53	2esl:A, 2esl:B, 2esl:C, 2esl:D, 2esl:E, 2esl:F, 2rmc:C, 2rmc:E, 2rmc:G
17	2cfe:A	162	166	0.4942	0.5247	0.5120	5.19e-52
18	4n1m:A	168	168	0.4709	0.4821	0.4821	2.24e-50	7abt:A, 2alf:A, 1awq:A, 1awr:A, 1awr:B, 1awr:C, 1awr:D, 1awr:E, 1awr:F, 1aws:A, 1awt:A, 1awt:B, 1awt:C, 1awt:D, 1awt:E, 1awt:F, 1awu:A, 1awv:A, 1awv:B, 1awv:C, 1awv:D, 1awv:E, 1awv:F, 9ax6:D, 9ax6:C, 1bck:A, 9bfy:D, 9bfy:C, 9bg1:D, 9bg1:C, 1cwa:A, 1cwb:A, 1cwc:A, 1cwf:A, 1cwh:A, 1cwi:A, 1cwj:A, 1cwk:A, 1cwl:A, 1cwm:A, 1cwo:A, 2cyh:A, 3cyh:A, 3cys:A, 4cyh:A, 5cyh:A, 4dgb:A, 4dgc:A, 4dgc:C, 4dgc:B, 4dgc:D, 4dgc:E, 1fgl:A, 8g9p:C, 8g9p:D, 8g9q:D, 6gji:A, 6gjj:A, 6gjl:A, 6gjm:A, 6gjn:A, 6gjp:A, 6gjr:A, 6gjy:A, 6gs6:A, 5hsv:A, 5hsv:B, 5hsv:C, 5hsv:D, 8hz8:A, 6i42:A, 4ipz:A, 5lud:A, 1m63:C, 1m63:G, 1mf8:C, 1mik:A, 2ms4:A, 4n1n:A, 4n1o:A, 4n1p:A, 4n1q:A, 4n1r:A, 4n1s:A, 1nmk:A, 1nmk:B, 5noq:A, 5nor:A, 5nos:A, 5not:A, 5nou:A, 5nov:A, 5nox:A, 5noy:A, 5noz:A, 3odi:A, 3odi:I, 3odi:K, 3odi:C, 3odi:S, 3odi:E, 3odi:Q, 3odi:G, 3odi:O, 3odi:M, 3odl:A, 3odl:I, 3odl:M, 3odl:C, 3odl:K, 3odl:E, 3odl:S, 3odl:G, 3odl:Q, 3odl:O, 7pcj:A, 7pcj:D, 3rdd:A, 1rmh:A, 1rmh:B, 2rma:A, 2rma:I, 2rma:K, 2rma:C, 2rma:M, 2rma:E, 2rma:O, 2rma:G, 2rma:Q, 2rma:S, 2rmb:A, 2rmb:I, 2rmb:K, 2rmb:C, 2rmb:M, 2rmb:E, 2rmb:O, 2rmb:G, 2rmb:Q, 2rmb:S, 5t9u:A, 5t9u:B, 5t9u:C, 5t9u:D, 5t9w:A, 5t9z:A, 5ta2:A, 5ta4:A, 8tbf:C, 8tbf:D, 8tbg:C, 8tbg:D, 8tbh:C, 8tbh:D, 8tbi:C, 8tbi:D, 8tbj:C, 8tbj:D, 8tbk:C, 8tbk:D, 8tbl:C, 8tbl:D, 8tbm:D, 8tbm:C, 8tbn:C, 8tbn:D, 7uxj:A, 7uxj:B, 7uxj:C, 7uxj:D, 7uxm:A, 7uxm:B, 7uxm:C, 7uxn:A, 1vbs:A, 1vbt:A, 1vbt:B, 1w8l:A, 1w8m:A, 2x2c:K, 2x2c:O, 2x2c:M, 2x2c:Q, 2x2c:S, 6x3r:A, 6x3y:A, 6x4m:A, 6x4n:A, 6x4o:A, 6x4p:A, 6x4q:A, 1ynd:A, 1ynd:B, 1zkf:A, 1zkf:B
19	3pmp:A	163	168	0.4767	0.5031	0.4881	9.24e-50	3pmp:B
20	6lkb:A	160	153	0.4535	0.4875	0.5098	4.56e-44	6lkb:B
21	6yxx:BQ	218	169	0.4244	0.3349	0.4320	8.76e-41	7aoi:BQ, 6hiv:BQ, 6hix:BQ, 6yxy:BQ
22	5mqf:o	223	170	0.4477	0.3453	0.4529	5.61e-39	6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
23	2x7k:A	164	166	0.4128	0.4329	0.4277	1.17e-37
24	7aih:BH	214	169	0.3953	0.3178	0.4024	1.76e-37	7am2:BH, 7ane:BH
25	2oju:B	166	152	0.4302	0.4458	0.4868	6.82e-37	2oju:A
26	2qer:A	158	153	0.3779	0.4114	0.4248	1.96e-33
27	7dvq:9	409	152	0.3779	0.1589	0.4276	3.32e-24
28	3bo7:C	169	146	0.3198	0.3254	0.3767	1.39e-23	3bo7:A, 3bo7:D, 3bo7:B
29	8i0s:Y	320	171	0.3488	0.1875	0.3509	6.01e-22	8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
30	8ch6:V	285	152	0.3314	0.2000	0.3750	7.85e-21	7qtt:V
31	3t1u:A	163	164	0.3023	0.3190	0.3171	1.35e-13
32	1v9t:B	166	181	0.3372	0.3494	0.3204	9.38e-10	1vai:B
33	1lop:A	164	162	0.2674	0.2805	0.2840	1.21e-09
34	5ex2:A	267	99	0.1744	0.1124	0.3030	4.02e-04	5ex2:B
35	4zmi:A	235	53	0.0814	0.0596	0.2642	0.054
36	6f72:A	548	89	0.1395	0.0438	0.2697	0.12	6f73:A, 6f73:B
37	1vq2:A	173	67	0.0988	0.0983	0.2537	0.41
38	4p9c:A	136	38	0.0640	0.0809	0.2895	0.66	4p9c:B, 4p9c:C, 4p9c:D, 4p9c:E, 4p9c:F, 4p9c:G, 4p9c:H, 4p9c:I, 4p9c:J, 4p9c:K, 4p9c:L, 4p9d:A, 4p9d:B, 4p9d:C, 4p9d:D, 4p9d:E, 4p9d:F, 4p9e:A
39	4l0e:A	440	52	0.0930	0.0364	0.3077	2.7	4l0f:A, 4pwv:A, 4pxh:A, 4pxh:C, 4pxh:E
40	5u6z:A	67	37	0.0814	0.2090	0.3784	5.4
41	3ejb:H	387	66	0.1221	0.0543	0.3182	5.6	3ejb:B, 3ejb:D, 3ejb:F, 3ejd:B, 3ejd:D, 3ejd:F, 3ejd:H, 3eje:B, 3eje:D, 3eje:F, 3eje:H
42	7bmk:A	406	34	0.0698	0.0296	0.3529	8.5	7bmk:B, 6hv0:A, 6hx1:A, 3p23:A, 3p23:B, 3p23:C, 3p23:D, 4pl3:A, 4pl3:B, 4pl4:A, 4pl4:B, 4pl4:C, 4pl5:B, 4pl5:A, 4pl5:C, 4pl5:D, 4u6r:A, 6urc:A, 6urc:B, 8uvl:A, 6w3e:B, 6w3k:A, 6xdb:A, 6xdd:A, 6xdd:B, 6xdf:A, 4yzc:A, 4yzc:B, 4yzd:A, 4yzd:B, 4z7h:A, 4z7h:B
43	4yz9:A	381	34	0.0698	0.0315	0.3529	8.5	4pl4:D, 6w39:A, 6w39:B, 6w3a:A, 6w3a:B, 6w3e:A, 4yz9:B, 4yz9:C, 4yzd:C
44	7v1v:A	447	89	0.1395	0.0537	0.2697	9.3	7v1v:F, 7v1v:B, 7v1v:E, 7v1v:C, 7v1v:D, 7v1w:A, 7v1w:C, 7v1w:B, 7v1w:D, 7v1w:E, 7v1w:F, 7v1x:A, 7v1x:D, 7v1x:B, 7v1x:C, 7v1x:F, 7v1x:E

[Back]