BioLiP

>protein
RRPIRRALISVYDKTGLVDLAQGLSAAGVEIISTGSTAKTIADTGIPVTPVEQLTGFPEVLDGRVKTLHPRVHAGLLADL
RKSEHAAALEQLGIEAFELVVVNLYPFSQTVESGASVDDCVEQIDIGGPAMVRAAAKNHPSAAVVTDPLGYHGVLAALRA
GGFTLAERKRLASLAFQHIAEYDIAVASWMQQTLAPEHPVAAFPQWFGRSWRRVAMLRYGENPHQQAALYGDPTAWPGLA
QAEQLHGKDMSYNNFTDADAAWRAAFDHEQTCVAIIKHANPCGIAISSVSVADAHRKAHECDPLSAYGGVIAANTEVSVE
MAEYVSTIFTEVIVAPGYAPGALDVLARKKNIRVLVAAEPLAGGSELRPISGGLLIQQSDQLDAHGDNPANWTLATGSPA
DPATLTDLVFAWRACRAVKSNAIVIAADGATVGVGMGQVNRVDAARLAVERGGERVRGAVAASDAFFPFPDGLETLAAAG
VTAVVHPGGSVRDEEVTEAAAKAGVTLYLTGARHFAH

The query sequence (length=517) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3zzm:A	520	517	1.0000	0.9942	1.0000	0.0	4a1o:A, 4a1o:B
2	2b1g:A	590	481	0.3211	0.2814	0.3451	1.52e-67	2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
3	2b1g:A	590	56	0.0503	0.0441	0.4643	6.64e-07	2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
4	1p4r:A	589	481	0.3153	0.2767	0.3389	1.16e-64	1p4r:B, 1pkx:A, 1pkx:C, 1pl0:A, 1pl0:B, 1pl0:C, 1pl0:D, 5uy8:A, 5uy8:B, 5uy8:C, 5uy8:D, 5uz0:A, 5uz0:B, 5uz0:C, 5uz0:D
5	1p4r:A	589	64	0.0464	0.0407	0.3750	2.03e-05	1p4r:B, 1pkx:A, 1pkx:C, 1pl0:A, 1pl0:B, 1pl0:C, 1pl0:D, 5uy8:A, 5uy8:B, 5uy8:C, 5uy8:D, 5uz0:A, 5uz0:B, 5uz0:C, 5uz0:D
6	7mgq:A	602	473	0.3037	0.2608	0.3319	2.54e-60	7mgq:B, 7mgq:C, 7mgq:D
7	7mgq:A	602	141	0.0832	0.0714	0.3050	1.26e-07	7mgq:B, 7mgq:C, 7mgq:D
8	1ker:B	347	117	0.0600	0.0893	0.2650	3.5	1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
9	7lvb:F	108	57	0.0348	0.1667	0.3158	6.2	2chb:D, 2chb:E, 2chb:F, 2chb:G, 2chb:H, 3chb:D, 3chb:E, 3chb:F, 3chb:G, 3chb:H, 1ct1:F, 1ct1:G, 1ct1:H, 1eei:D, 1eei:E, 1eei:F, 1eei:G, 1eei:H, 3efx:D, 3efx:E, 3efx:F, 3efx:G, 3efx:H, 3efx:I, 3efx:J, 3efx:K, 3efx:L, 3efx:M, 5elb:A, 5elb:B, 5elb:C, 5elb:D, 5elb:E, 5elb:F, 5elb:G, 5elb:H, 5elb:I, 5elb:J, 5elc:A, 5elc:B, 5elc:C, 5elc:D, 5elc:E, 5elc:G, 5elc:H, 5elc:I, 5elc:J, 5elc:F, 5eld:A, 5eld:C, 5eld:D, 5eld:E, 5ele:D, 5ele:G, 5ele:J, 5ele:A, 5ele:F, 5ele:H, 5ele:I, 5elf:A, 5elf:D, 5elf:E, 5elf:F, 5elf:G, 5elf:I, 5elf:J, 5elf:B, 5elf:H, 1g8z:D, 1g8z:F, 1g8z:G, 1g8z:H, 6hjd:A, 6hjd:B, 6hjd:C, 6hjd:D, 6hjd:E, 6hjd:G, 6hjd:H, 6hjd:I, 6hjd:F, 6hmw:A, 6hmw:B, 6hmw:C, 6hmw:D, 6hmw:E, 6hmw:F, 6hmw:G, 6hmw:H, 6hmw:I, 6hmw:J, 6hmy:A, 6hmy:B, 6hmy:C, 6hmy:D, 6hmy:E, 6hmy:F, 6hmy:G, 6hmy:H, 6hmy:I, 6hmy:J, 1jr0:D, 1jr0:E, 1jr0:F, 1jr0:G, 1jr0:H, 1llr:D, 1llr:E, 1llr:F, 1llr:G, 1llr:H, 7lvb:D, 7lvb:E, 7lvb:G, 7lvb:H, 7lvb:A, 7lvb:B, 7lvb:C, 7lvb:I, 7lvb:J, 5lzg:A, 5lzg:B, 5lzg:C, 5lzg:D, 5lzg:E, 5lzh:A, 5lzh:B, 5lzh:C, 5lzh:D, 5lzh:E, 5lzj:C, 5lzj:D, 1md2:D, 1md2:E, 1md2:F, 8oxs:D, 8oxs:E, 8oxs:F, 8oxs:G, 8oxs:H, 8oxs:C, 8oxs:I, 8oxs:K, 8oxs:L, 1pzj:D, 1pzj:E, 1pzj:F, 1pzj:G, 1pzj:H, 1pzk:D, 1pzk:E, 1pzk:F, 1pzk:G, 1pzk:H, 8qre:D, 8qre:E, 8qre:F, 8qre:G, 8qre:H, 8qre:C, 8qre:I, 8qre:J, 8qre:K, 8qre:L, 1rcv:D, 1rcv:E, 1rcv:F, 1rcv:G, 1rcv:H, 1rd9:D, 1rd9:E, 1rd9:F, 1rd9:G, 1rd9:H, 1rdp:D, 1rdp:E, 1rdp:F, 1rdp:G, 1rdp:H, 1rf2:D, 1rf2:E, 1rf2:F, 1rf2:G, 1rf2:H, 1s5d:D, 1s5d:E, 1s5d:F, 1s5d:G, 1s5d:H, 1s5e:D, 1s5e:J, 1s5f:D, 1s5f:E, 1s5f:F, 1s5f:G, 1s5f:H
10	1fv5:A	36	21	0.0232	0.3333	0.5714	6.4	2l6z:B, 1y0j:B
11	5hwe:A	370	35	0.0271	0.0378	0.4000	8.8	5hxu:A, 5hxu:B, 5hxz:A, 5hxz:D, 5hy1:A

[Back]