Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
RQTREVLDPIVASLMEAQQIPGMAIALVRPEGTTISHYGAADRETGTPVDDDTLFEIGSLSKTLTATLASLAEVEGKLDF
DAPVSRYLPELEGSAFDDISGLNLGTHTGGGLPLFVPDEVTDRASLMAWYREWQPTEPIGESRTYSNLGIGLLGLETAAS
LDGEFVPTMRAKVLAPLGMQDTWYDVPEARMADYAMGEDKDGQPTRVSPGVLDDEAYGIKTTAADLAKLVRANLHLADVD
AELQQAIDATRQGHYRVGDMTQALIWEQYSLPVAPETLRAGQGYDMILEPNAAEALEPPQSPRDDVWVNKTGSTQGFGGY
IVMLPGKHTGLVMLANKNYPNDARVEAAYRILSGLGAIDV

The query sequence (length=360) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ws1:A 360 359 0.9972 0.9972 1.0000 0.0 3wrz:A, 3wrz:B, 3ws0:A, 3ws0:B, 3ws0:C, 3ws1:B, 3ws1:C, 3ws2:A, 3ws2:B, 3ws2:C, 3ws5:B
2 5f1f:A 361 352 0.4722 0.4709 0.4830 4.45e-110 5k1d:A, 5k1f:A, 3w8k:A, 4wbg:A, 1zkj:A, 5zyb:A
3 6kby:A 362 354 0.4417 0.4392 0.4492 8.33e-108 6k9t:A, 6ka5:A, 6m5p:A, 6m5q:A
4 6s1s:A 367 353 0.4750 0.4659 0.4844 8.54e-106 4hef:A, 6i30:A, 4nk3:A, 4ooy:A, 3s1y:A, 3s22:A, 8sdr:A, 8sds:A, 8sdt:A, 8sdv:A, 6uqs:A, 6uqt:A, 6uqu:A, 6ur3:A, 4wyy:A, 2wzx:A, 2wzz:A, 4wz4:A, 4x68:A, 4x68:B
5 6fm7:A 356 351 0.4361 0.4410 0.4473 6.50e-100
6 5cgw:A 362 349 0.4361 0.4337 0.4499 1.49e-98 5cgs:A, 5cgx:A, 5chj:A, 5chj:B, 5chm:A, 5chu:B, 5za2:A, 5za2:B
7 3s4x:A 367 356 0.4361 0.4278 0.4410 3.33e-96 1bls:A, 1bls:B, 1ga0:A, 1onh:A, 1q2q:A, 2q9m:A, 2q9n:A, 1rgz:A, 1s6r:A, 7ti1:A, 5xhr:A, 4xux:A, 1y54:A
8 1fr6:A 361 356 0.4083 0.4072 0.4129 6.51e-93 1fr6:B, 8jb8:A, 8jb8:B, 1rgy:A
9 8ttp:B 359 356 0.3944 0.3955 0.3989 4.42e-89 3bls:A, 3bls:B, 3bm6:A, 3bm6:B, 1c3b:A, 1c3b:B, 9c6p:A, 9c6p:B, 9c81:A, 9c81:B, 9c83:A, 9c83:B, 9c84:A, 9c84:B, 9c8j:A, 9c8j:B, 7cin:A, 7cin:B, 6dpt:A, 6dpt:B, 6dpx:A, 6dpx:B, 6dpy:A, 6dpy:B, 6dpz:A, 6dpz:B, 4e3i:A, 4e3i:B, 4e3j:A, 4e3j:B, 4e3k:A, 4e3k:B, 4e3l:A, 4e3l:B, 4e3m:A, 4e3m:B, 4e3n:A, 4e3n:B, 4e3o:A, 4e3o:B, 5f1g:A, 1fcm:A, 1fcm:B, 1fcn:A, 1fcn:B, 1fco:A, 1fco:B, 2ffy:A, 2ffy:B, 3fkv:A, 3fkv:B, 1fsw:A, 1fsw:B, 1fsy:A, 1fsy:B, 1ga9:A, 1ga9:B, 3gqz:A, 3gr2:A, 3grj:A, 3grj:B, 3gsg:A, 3gsg:B, 3gtc:A, 3gtc:B, 3gv9:A, 3gv9:B, 3gvb:A, 5gzw:A, 5gzw:B, 2hdq:A, 2hdq:B, 2hdr:A, 2hdr:B, 2hds:A, 2hds:B, 2hdu:A, 2hdu:B, 1i5q:A, 1i5q:B, 2i72:A, 2i72:B, 1iel:A, 1iel:B, 1iem:A, 1iem:B, 3iwo:A, 3iwo:B, 3ixb:B, 3ixb:A, 3ixg:B, 3ixh:B, 4jxg:B, 4jxg:A, 4jxs:B, 4jxv:A, 4jxv:B, 4jxw:A, 4jxw:B, 1kds:A, 1kds:B, 1kdw:A, 1kdw:B, 1ke0:A, 1ke0:B, 1ke3:A, 1ke3:B, 4ken:B, 4kg2:B, 4kg2:A, 4kg5:B, 4kg5:A, 4kg5:C, 4kg5:D, 1kvl:A, 1kvl:B, 1kvm:B, 4kz3:A, 4kz3:B, 4kz4:B, 4kz5:A, 4kz5:B, 4kz6:B, 4kz7:A, 4kz7:B, 4kz8:A, 4kz8:B, 4kz9:A, 4kza:A, 4kza:B, 4kzb:A, 4kzb:B, 1l0g:A, 1l2s:A, 1l2s:B, 1ll5:A, 1ll5:B, 1ll9:B, 1llb:B, 4lv0:A, 4lv0:B, 4lv1:A, 4lv1:B, 4lv2:A, 4lv2:B, 4lv3:A, 4lv3:B, 1mxo:A, 1mxo:B, 1my8:A, 1my8:B, 1o07:A, 1o07:B, 3o86:A, 3o86:B, 3o87:A, 3o87:B, 3o88:A, 3o88:B, 4okp:B, 4old:A, 4old:B, 4olg:A, 4olg:B, 1pi4:A, 1pi4:B, 1pi5:A, 1pi5:B, 2pu2:A, 2pu2:B, 2pu4:A, 2pu4:B, 2r9w:A, 2r9w:B, 2r9x:A, 2r9x:B, 2rcx:A, 2rcx:B, 6t35:A, 6t5y:A, 6t7l:A, 6tbw:A, 6tpm:A, 8ttp:A, 6whf:A, 6whf:B, 6xfs:A, 6xfs:B, 6xfs:C, 6xfs:D, 1xgi:B, 1xgj:A, 1xgj:B, 6yen:A, 6yeo:A, 6yeo:B, 6yeo:C, 6yeo:D, 6ypd:A
10 6lc8:A 357 356 0.4222 0.4258 0.4270 5.45e-89 6lc9:A
11 8cup:B 360 356 0.3556 0.3556 0.3596 1.69e-84 8cup:A, 8cuq:B, 8cuq:A, 8fqm:A, 8fqm:B, 8fqm:C, 8fqm:D, 8fqn:A, 8fqo:B, 8fqo:A, 8fqp:B, 8fqp:A, 8fqq:A, 8fqq:B, 8fqr:B, 8fqs:B, 8fqu:B, 8fqu:A, 8fqw:B, 8fqw:A, 6pwl:A, 6pwl:B, 6pwl:C, 6pwl:D, 6pwm:A, 6pwm:B, 6pwm:C, 6pwm:D, 6tzf:A, 6tzf:B, 6tzf:C, 6tzf:D, 6tzg:A, 6tzg:B, 6tzg:C, 6tzg:D, 6tzh:A, 6tzh:B, 6tzh:C, 6tzh:D, 6tzi:A, 6tzi:B, 6tzi:C, 6tzi:D, 6tzj:A, 6tzj:B, 6tzj:C, 6tzj:D, 4u0x:B, 4u0x:A, 4u0x:C, 4u0x:D, 5w12:A, 5w12:B, 5w12:C, 5w12:D, 5w13:A, 5w13:B, 5w13:C, 5w13:D, 5w14:A, 5w14:B, 5w14:C, 5w14:D, 5wac:A, 5wac:B, 5wac:C, 5wac:D, 5wad:A, 5wad:B, 5wad:C, 5wad:D, 5wae:A, 5wae:B, 5wae:C, 5wae:D, 5waf:A, 5waf:B, 5waf:C, 5waf:D, 5wag:B, 5wag:A, 5wag:C, 5wag:D, 6wif:A, 6wif:B, 6wif:C, 6wif:D
12 6lc8:B 318 356 0.3806 0.4308 0.3848 8.26e-71 6lc9:B
13 2qmi:F 447 365 0.2611 0.2103 0.2575 3.28e-15 2qmi:E, 2qmi:G, 2qmi:H
14 2dns:A 362 179 0.1472 0.1464 0.2961 3.69e-14 2dns:B, 2dns:C, 2dns:D, 2dns:E, 2efu:A, 2efu:B, 2efu:C, 2efu:D, 2efx:A, 2efx:B, 2efx:C, 2efx:D, 2efx:E
15 2efu:E 342 179 0.1472 0.1550 0.2961 6.07e-13 2efu:F, 2efx:F
16 4ivk:A 404 87 0.0833 0.0743 0.3448 1.07e-08
17 1cef:A 347 189 0.1528 0.1585 0.2910 2.45e-08 1ceg:A, 1hvb:A, 1ikg:A, 1iki:A, 1mpl:A, 1pw1:A, 1pw8:A, 1pwc:A, 1pwd:A, 1pwg:A, 1scw:A, 1sde:A, 1yqs:A
18 1ci9:A 377 110 0.1056 0.1008 0.3455 2.80e-08 1ci9:B
19 6kjj:A 361 185 0.1333 0.1330 0.2595 9.45e-07 6kjp:A, 6kjq:A, 6kjr:A
20 3wwx:A 340 173 0.1361 0.1441 0.2832 3.70e-06
21 5tgf:D 332 182 0.1278 0.1386 0.2527 4.21e-06
22 7pp8:A 402 233 0.1611 0.1443 0.2489 4.71e-06 7pp8:B, 7pp8:C, 7pp8:D, 7pp8:E, 7pp8:F, 7pp8:G, 7pp8:H, 7pu6:A, 7pu6:B, 7pu6:C, 7pu6:D, 7pu6:E, 7pu6:F, 7pu6:G, 7pu6:H
23 4e6x:C 305 343 0.2056 0.2426 0.2157 5.22e-06 4e6x:B
24 7v1y:A 394 54 0.0722 0.0660 0.4815 2.57e-05 7v1y:C, 7v1y:B, 7v1y:D
25 7mdf:A 453 346 0.1972 0.1567 0.2052 1.35e-04 4e6w:A, 4e6w:B, 4e6w:C, 7mdc:A
26 7u1b:A 403 287 0.1861 0.1663 0.2334 3.30e-04
27 8rlk:A 385 51 0.0528 0.0494 0.3725 0.002 8rlk:B, 8rlk:C, 8rlk:D
28 6ksv:A 427 191 0.1611 0.1358 0.3037 0.017 6ksv:B
29 3a65:A 384 46 0.0500 0.0469 0.3913 0.026 3a66:A, 2dcf:A, 3vwp:A, 3vwq:A, 3vwr:A, 2zm7:A, 2zm8:A, 2zm9:A, 2zma:A
30 3hlf:A 425 229 0.1472 0.1247 0.2314 0.35 3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
31 8ki1:A 181 102 0.0778 0.1547 0.2745 0.46 8ki0:A, 8ki0:B, 8ki1:B
32 8ttt:A 256 53 0.0389 0.0547 0.2642 0.77 8ttu:A, 8ttv:A
33 8aji:A 348 98 0.0639 0.0661 0.2347 1.6 8aji:B, 8aji:C, 8aji:D, 8akh:A, 8akh:B
34 3god:A 320 40 0.0417 0.0469 0.3750 5.6 8flj:A, 8flj:C, 8flj:D, 8flj:B, 3god:B
35 2fq1:A 279 37 0.0389 0.0502 0.3784 5.7
36 7emo:A 186 40 0.0417 0.0806 0.3750 7.0 3ell:A, 3ell:B, 7emo:B, 7emo:C, 7emp:A, 7emp:B, 7emp:C, 7emq:A, 7emq:B, 7emq:C, 7emr:A, 7emr:B, 7emr:C, 7ems:A, 7ems:B, 7ems:C, 7emt:A, 7emu:A, 7emv:A, 7emw:A, 5iqx:A, 6jlg:A, 6jlg:E, 6jlg:B, 6jlg:C, 6jlg:D, 6jlg:F, 6jlg:G, 6jlg:H, 3mol:A, 3mol:B, 3mom:A, 3mom:B, 4o6q:A, 4o6s:A, 4o6t:A, 4o6u:A, 6u87:A, 6urb:A, 6urb:B, 7vf7:A, 7vf7:B, 7vf7:C, 7vf8:A, 7vf8:B, 7vm1:A, 7vm1:B, 7vm1:C, 7vm1:D, 3w8m:A, 3w8o:A, 3w8o:B, 3wah:A, 3wah:B, 5xa4:A, 5xa4:B, 5xhl:A, 5xhl:B, 5xib:A, 5xib:B, 5xic:A, 5xic:B, 5xic:C, 5xic:D, 5xie:A, 5xie:B, 5xkb:A, 5xkb:B
37 9c57:G 878 36 0.0333 0.0137 0.3333 7.7
38 8auw:A 2900 74 0.0556 0.0069 0.2703 9.7
39 8atu:A 2837 74 0.0556 0.0070 0.2703 9.8 8atu:B, 8atx:A, 8atx:B, 8auk:A, 8auk:B, 8auw:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218