BioLiP

>protein
RKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELHVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKL
ASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKD
WLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFKDITRIASSSPKMWSDIVKQNRE
HLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHVTSILAREEIS
ITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI

The query sequence (length=365) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5uyy:A	373	365	1.0000	0.9786	1.0000	0.0	7mqv:A, 7mqv:B, 7mqv:C, 7mqv:D, 6u60:A, 6u60:B, 5uyy:B, 5uyy:C, 5uyy:D
2	3b1f:A	286	283	0.2795	0.3566	0.3604	6.34e-58
3	3ggg:D	293	280	0.2493	0.3106	0.3250	6.34e-44	2g5c:A, 2g5c:B, 2g5c:C, 2g5c:D, 3ggg:A, 3ggg:B, 3ggg:C, 3ggo:A, 3ggo:B, 3ggo:D, 3ggo:C, 3ggp:A, 3ggp:B, 3ggp:D, 3ggp:C
4	4wji:A	293	284	0.2521	0.3140	0.3239	4.61e-43
5	2f1k:A	279	280	0.2384	0.3118	0.3107	1.43e-37	2f1k:B, 2f1k:C, 2f1k:D
6	6za2:B	1083	98	0.0767	0.0259	0.2857	0.075	6za2:A
7	2fn7:A	317	46	0.0438	0.0505	0.3478	0.16	2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
8	8grv:A	336	122	0.0822	0.0893	0.2459	0.38
9	3gvh:A	318	55	0.0575	0.0660	0.3818	0.59	3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
10	1cli:A	341	118	0.0849	0.0909	0.2627	0.77	1cli:B, 1cli:C, 1cli:D
11	3wsw:A	316	81	0.0603	0.0696	0.2716	0.81	3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
12	3om9:A	329	41	0.0438	0.0486	0.3902	1.1	3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
13	7k5b:B	4524	65	0.0603	0.0049	0.3385	1.4	8bx8:B, 7k58:B, 7kek:B
14	6st5:A	913	49	0.0438	0.0175	0.3265	1.7
15	4ros:A	318	55	0.0575	0.0660	0.3818	2.3	5ujk:A
16	1s05:A	129	86	0.0630	0.1783	0.2674	2.5
17	4plf:B	330	17	0.0301	0.0333	0.6471	3.5	4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
18	7osn:B	291	135	0.0986	0.1237	0.2667	4.2	7osn:A, 7osn:C, 7osn:D, 7osn:E, 7osn:F
19	1yge:A	839	43	0.0384	0.0167	0.3256	4.9	3bnb:A, 3bnc:A, 3bnd:A, 3bne:A, 5eeo:A, 1f8n:A, 1fgm:A, 1fgo:A, 1fgq:A, 1fgr:A, 1fgt:A, 3pzw:A, 2sbl:B, 2sbl:A, 7soi:A, 7soi:B, 7soj:A, 7soj:B, 5t5v:A, 5t5v:B, 5tqn:A, 5tqn:B, 5tqo:A, 5tqo:B, 5tqp:A, 5tqp:B, 5tr0:A, 5tr0:B, 4wfo:A, 4wha:A, 1y4k:A
20	4plt:B	319	48	0.0575	0.0658	0.4375	6.3	4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
21	3ac0:A	841	55	0.0493	0.0214	0.3273	8.2	3ac0:B, 3ac0:C, 3ac0:D
22	7q3y:A	1201	60	0.0603	0.0183	0.3667	8.4	5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
23	2a92:C	318	36	0.0301	0.0346	0.3056	9.8	2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D

[Back]