BioLiP

>protein
QTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERR

The query sequence (length=66) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1tbn:A	66	66	1.0000	1.0000	1.0000	4.20e-45	1tbo:A
2	2eli:A	85	66	0.7576	0.5882	0.7576	1.01e-36
3	3pfq:A	523	59	0.7273	0.0918	0.8136	8.22e-35	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
4	6uwa:A	187	54	0.6061	0.2139	0.7407	4.03e-28	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
5	2enz:A	65	53	0.4545	0.4615	0.5660	2.71e-20
6	3uej:A	65	50	0.4697	0.4769	0.6200	3.77e-19	7knd:A, 7knj:A, 7ko6:A, 7l92:A, 7l92:D, 7l92:G, 7l92:J, 7l92:M, 7l92:V, 7l92:P, 7l92:S, 7lcb:A, 7leo:A, 7leo:D, 7lf3:A, 1ptq:A, 1ptr:A, 3uej:B, 3uey:A, 3uey:B, 3uff:A, 3uff:B, 3ugd:A, 3ugd:B, 3ugi:A, 3ugi:B, 3ugl:A, 3ugl:B
7	4fkd:A	65	50	0.4394	0.4462	0.5800	9.26e-19
8	3cxl:A	402	53	0.3182	0.0522	0.3962	6.87e-14
9	1xa6:A	399	53	0.3182	0.0526	0.3962	7.86e-14
10	6ra0:A	138	51	0.3636	0.1739	0.4706	6.31e-11
11	2e73:A	77	50	0.3182	0.2727	0.4200	6.69e-10
12	2e73:A	77	13	0.1970	0.1688	1.0000	0.006
13	4l9m:A	522	42	0.2879	0.0364	0.4524	2.31e-09
14	5ue8:A	847	42	0.2424	0.0189	0.3810	2.56e-08	5ue8:B, 1y8f:A
15	2yuu:A	83	50	0.2576	0.2048	0.3400	1.03e-07
16	7z6e:C	534	58	0.3485	0.0431	0.3966	3.04e-07	7z6e:A, 7z6e:B, 7z6e:D, 7z6e:E
17	2enn:A	77	50	0.2576	0.2208	0.3400	3.15e-07
18	6nf1:A	550	53	0.3030	0.0364	0.3774	4.69e-07	3bji:A, 3bji:B, 3ky9:A, 3ky9:B, 6new:A, 6nfa:A, 2vrw:B
19	8dgt:A	431	54	0.2879	0.0441	0.3519	1.01e-05	9axx:B, 9axy:A, 6b8u:A, 9bfb:A, 3c4c:A, 3c4c:B, 8c7x:A, 8c7x:B, 8c7y:A, 8c7y:B, 5c9c:A, 5csw:A, 5csx:A, 5ct7:A, 5ct7:B, 3d4q:A, 3d4q:B, 4dbn:A, 4dbn:B, 8dgs:A, 4e26:A, 4e26:B, 4e4x:A, 4e4x:B, 4ehe:A, 4ehe:B, 4ehg:A, 4ehg:B, 8f7o:A, 8f7o:B, 8f7p:A, 8f7p:B, 2fb8:A, 2fb8:B, 4fc0:B, 5fd2:A, 4g9c:A, 4g9c:B, 4g9r:A, 4g9r:B, 4h58:A, 5hid:A, 5hid:B, 5hie:A, 5hie:B, 3idp:B, 3idp:A, 3ii5:A, 3ii5:B, 5j18:A, 5j2r:A, 5jrq:A, 5jsm:A, 5jsm:B, 5jsm:C, 5jsm:D, 5jt2:A, 4jvg:B, 4jvg:A, 4jvg:C, 4jvg:D, 7k0v:A, 7k0v:B, 7k0v:C, 7k0v:D, 4ksp:A, 4ksp:B, 4ksq:A, 4ksq:B, 7m0t:A, 7m0u:A, 7m0v:A, 7m0w:A, 7m0x:A, 7m0y:A, 7m0z:A, 4mbj:A, 4mbj:B, 7mfd:A, 7mfe:A, 7mff:A, 7mff:B, 4mnf:A, 4mnf:B, 6n0p:A, 6n0p:B, 6n0q:A, 6nsq:A, 6nyb:A, 6p3d:A, 7p3v:A, 7p3v:B, 6p7g:A, 6p7g:B, 6p7g:C, 6p7g:D, 3ppj:A, 3ppj:B, 3ppk:A, 3ppk:B, 4pp7:A, 4pp7:B, 6pp9:A, 3prf:A, 3prf:B, 3pri:A, 3pri:B, 3psb:A, 3psb:B, 3psd:A, 3psd:B, 3q4c:A, 3q96:B, 8qqg:A, 8qqg:B, 8qqg:C, 4r5y:A, 4r5y:B, 4rzv:A, 4rzv:B, 7shv:A, 7shv:B, 3skc:A, 3skc:B, 3tv4:A, 3tv4:B, 3tv6:A, 3tv6:B, 6u2g:B, 6u2h:C, 6u2h:D, 6uuo:A, 1uwh:A, 1uwh:B, 1uwj:A, 1uwj:B, 6v2u:A, 6v2w:A, 6v34:A, 5vam:A, 5vam:B, 4wo5:A, 4wo5:B, 6xfp:A, 6xlo:A, 4xv9:A, 4yht:A, 4yht:B
20	2db6:A	74	46	0.2424	0.2162	0.3478	3.55e-05
21	6xgu:B	134	54	0.2424	0.1194	0.2963	0.003	1c1y:B, 1faq:A, 1far:A, 1gua:B, 7jhp:C, 3kuc:B, 6pts:D, 6ptw:D, 8t75:B, 8t75:D, 8t75:F, 8t75:H, 6xgv:B, 6xha:B, 6xhb:B, 6xi7:B
22	8e9h:G	782	44	0.1970	0.0166	0.2955	1.5	8e9g:G, 8e9i:G
23	1jdi:A	223	40	0.1970	0.0583	0.3250	2.3	1jdi:B, 1jdi:C, 1jdi:D, 1jdi:E, 1jdi:F, 1k0w:A, 1k0w:B, 1k0w:C, 1k0w:D, 1k0w:E, 1k0w:F
24	6iil:A	341	27	0.1818	0.0352	0.4444	2.6	6iik:A, 6iik:B, 6iil:B, 6iim:A, 6iim:B, 6iin:A, 6iin:B
25	5hvq:C	236	30	0.1818	0.0508	0.4000	4.9	5wy5:A
26	7jgs:C	614	24	0.1364	0.0147	0.3750	8.7	7jgr:C, 7jk2:C, 7jk3:C, 7jk4:C, 7jk5:C, 7jk6:C

[Back]