Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
QQVTADEVGDWYDKFGEVYHLTLGESVHCGLWFPPDAPVPQDMELVTMSSQAQDRYTDYLIETLDPKAGQHLLDIGCGTG
RTALKAARQRGIAVVSKEQIAAANRLAAGHGLTERLTFEVADAMRLPYEDESFWAIESLCHMDRAKALGEAWRVLKPGGD
LLVLESVVTEELTEPETALFETLYAANVPPRLGEFFDIVSGAGFHTLSLKDLSANLAMTMNVFALGVYSRRAEFTERFGA
EFVDGLLAGLGSAQETLIRKTRFFMATLRKPAV

The query sequence (length=273) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5gm2:B 282 280 1.0000 0.9681 0.9750 0.0 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
2 5gm2:K 267 276 0.9414 0.9625 0.9312 0.0
3 3bus:A 251 259 0.3187 0.3466 0.3359 1.88e-31 3bus:B
4 6uv6:C 264 221 0.2930 0.3030 0.3620 4.90e-27 6uv6:A, 6uv6:B
5 4pne:B 272 282 0.3297 0.3309 0.3191 2.62e-25 4pne:A
6 7v6h:A 267 206 0.2527 0.2584 0.3350 2.99e-21 7v6h:B
7 5wp4:A 485 213 0.2015 0.1134 0.2582 8.74e-09
8 5wp5:A 463 132 0.1538 0.0907 0.3182 1.01e-08 5wp5:B
9 4ine:A 431 196 0.1941 0.1230 0.2704 3.57e-08 4ine:B
10 5fcd:A 228 114 0.1209 0.1447 0.2895 5.77e-08 5fcd:B
11 4krh:A 430 198 0.1978 0.1256 0.2727 1.77e-07 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
12 2glu:A 234 121 0.1502 0.1752 0.3388 1.16e-06 2glu:B
13 7wdq:A 336 140 0.1502 0.1220 0.2929 2.71e-06 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
14 6uak:A 297 102 0.1319 0.1212 0.3529 8.88e-06
15 5z9o:A 373 202 0.1612 0.1180 0.2178 9.20e-06 5z9o:B
16 4f86:A 275 165 0.1429 0.1418 0.2364 1.72e-05 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
17 3uj7:A 259 231 0.1795 0.1892 0.2121 2.67e-05 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
18 7fbo:A 282 151 0.1575 0.1525 0.2848 3.09e-05 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
19 6wlf:B 434 130 0.1429 0.0899 0.3000 9.31e-05 6wlf:A
20 1p91:A 268 106 0.1465 0.1493 0.3774 3.06e-04 1p91:B
21 2yqz:A 261 97 0.1355 0.1418 0.3814 4.25e-04 2yqz:B
22 5f8f:B 361 121 0.1355 0.1025 0.3058 0.004 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
23 3kkz:A 256 109 0.1282 0.1367 0.3211 0.006 3kkz:B
24 2gs9:A 211 126 0.1465 0.1896 0.3175 0.007 2gs9:B
25 8joz:A 257 103 0.1172 0.1245 0.3107 0.008 4htf:A, 4htf:B
26 7q2d:A 286 85 0.0952 0.0909 0.3059 0.009 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
27 7qos:A 352 242 0.1722 0.1335 0.1942 0.009 7qos:B
28 3dlc:A 219 114 0.1136 0.1416 0.2719 0.011
29 5i2h:A 335 124 0.1245 0.1015 0.2742 0.016 5i2h:B
30 3vc1:D 288 111 0.1026 0.0972 0.2523 0.023 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
31 4mwz:B 265 195 0.1429 0.1472 0.2000 0.028 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
32 1qzz:A 340 112 0.1282 0.1029 0.3125 0.045 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
33 1wzn:A 244 100 0.1062 0.1189 0.2900 0.047 1wzn:B, 1wzn:C
34 5h02:A 252 132 0.1502 0.1627 0.3106 0.048 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
35 6cu5:A 314 108 0.1172 0.1019 0.2963 0.059 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
36 3t7s:A 246 110 0.1136 0.1260 0.2818 0.091 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
37 1tpy:A 285 213 0.1905 0.1825 0.2441 0.094
38 4iv8:A 245 200 0.1429 0.1592 0.1950 0.11 4iv8:B
39 4nec:B 244 97 0.1355 0.1516 0.3814 0.12 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
40 1kpg:A 285 64 0.0769 0.0737 0.3281 0.13 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
41 3hem:A 291 86 0.0916 0.0859 0.2907 0.20 1kpi:A
42 4a6d:A 345 156 0.1319 0.1043 0.2308 0.30 4a6e:A
43 1jhd:A 396 65 0.0696 0.0480 0.2923 0.35
44 5bxy:A 155 70 0.0696 0.1226 0.2714 0.36 5bxy:B
45 1l1e:A 272 204 0.1502 0.1507 0.2010 0.40 1l1e:B
46 3e23:A 198 98 0.1209 0.1667 0.3367 0.53
47 1l3i:A 186 106 0.1099 0.1613 0.2830 0.57 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
48 6bqc:A 348 66 0.0842 0.0661 0.3485 0.59
49 5kok:A 348 38 0.0586 0.0460 0.4211 0.75 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
50 6i6m:B 357 147 0.1282 0.0980 0.2381 0.84 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
51 7lxi:A 279 203 0.1685 0.1649 0.2266 1.1 7mcj:A, 7mcj:B
52 7pd7:B 250 100 0.1062 0.1160 0.2900 1.3 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
53 3lcc:A 216 173 0.1502 0.1898 0.2370 1.4
54 2xva:A 199 107 0.1062 0.1457 0.2710 1.5 2xva:B, 2xva:C, 2xva:D, 2xvm:A, 2xvm:B
55 2zfu:A 212 106 0.1245 0.1604 0.3208 1.6 2zfu:B
56 7jwq:C 212 59 0.0623 0.0802 0.2881 1.7 7jwp:A, 7jwp:C, 7jwp:E, 7jwp:G, 7jwp:I, 7jwp:K, 7jwp:M, 7jwp:O, 7jwq:A
57 4o29:A 207 113 0.0952 0.1256 0.2301 1.9
58 6mro:A 194 114 0.1209 0.1701 0.2895 2.0 8gdu:A
59 3sxj:A 245 103 0.0952 0.1061 0.2524 2.1 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
60 6dxp:A 206 105 0.1136 0.1505 0.2952 2.2 6dxp:C, 6dxp:B, 6dxp:D, 8h4j:A, 8h4j:B, 8h4j:C, 8h4j:D, 8h4j:E, 8h4j:F, 8h4j:G, 8h4j:H, 7n2w:A, 7n2w:B, 7n2w:C, 7n2w:D
61 4obw:D 235 53 0.0733 0.0851 0.3774 2.6 4obw:A, 4obw:C, 4obw:B
62 3ijh:B 221 131 0.1062 0.1312 0.2214 2.6 3ijh:D, 3ijs:B, 3ijs:D, 3ijy:B, 3ijy:D, 3ikc:B, 3ikc:D
63 7qcb:A 240 123 0.1136 0.1292 0.2520 2.7
64 7vru:A 497 21 0.0366 0.0201 0.4762 2.9 7vs4:A
65 1f3l:A 321 46 0.0476 0.0405 0.2826 3.2 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
66 8pjd:A 347 67 0.0586 0.0461 0.2388 3.3 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
67 5bp7:A 249 114 0.1136 0.1245 0.2719 3.4 5bp7:B, 5bp7:C
68 7qrd:C 364 100 0.0989 0.0742 0.2700 3.5 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
69 7cpx:A 2262 107 0.1099 0.0133 0.2804 4.0 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
70 5w7m:A 273 178 0.1538 0.1538 0.2360 4.3
71 6p3o:A 341 43 0.0549 0.0440 0.3488 5.0 6p3m:A, 6p3n:A
72 3wst:I 644 28 0.0513 0.0217 0.5000 5.3 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
73 6zxv:A 325 116 0.1209 0.1015 0.2845 5.6 6zxv:B, 6zxw:G
74 5u1e:A 321 68 0.0879 0.0748 0.3529 6.5 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
75 5dm2:A 258 40 0.0549 0.0581 0.3750 6.8 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
76 1mwi:A 165 53 0.0659 0.1091 0.3396 9.7 1mtl:A, 1mtl:B, 1mwj:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218