Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QEDQAYCICRSSDCSRFMIGCDGCEEWYHGDCIGITEKEAKHIKQYYCRRCKKENPELQTIFR

The query sequence (length=63) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9c0o:A 63 63 1.0000 1.0000 1.0000 1.33e-42
2 8f8y:B 433 49 0.3968 0.0577 0.5102 1.52e-14 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
3 3kv4:A 432 48 0.3651 0.0532 0.4792 4.45e-13 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
4 3kv6:D 448 47 0.3651 0.0513 0.4894 1.23e-12 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
5 2f6j:A 168 52 0.3968 0.1488 0.4808 1.24e-12 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
6 1wem:A 76 54 0.3968 0.3289 0.4630 8.23e-12 4l7x:A, 2m3h:A
7 6j2p:A 98 50 0.3016 0.1939 0.3800 6.77e-10 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
8 5wlf:A 60 56 0.3333 0.3500 0.3750 7.45e-10 5wle:A
9 1wep:A 79 51 0.3333 0.2658 0.4118 1.35e-09
10 1we9:A 64 39 0.3175 0.3125 0.5128 8.57e-09
11 5yc3:A 60 43 0.3333 0.3500 0.4884 1.03e-08 5yc4:A
12 5y20:A 52 35 0.3175 0.3846 0.5714 3.87e-08
13 2k16:A 75 46 0.2698 0.2267 0.3696 4.26e-07 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
14 5z8l:A 204 57 0.2857 0.0882 0.3158 7.43e-07 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
15 5znp:B 186 48 0.2540 0.0860 0.3333 5.20e-06 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
16 5tab:A 53 46 0.2698 0.3208 0.3696 3.63e-05
17 2lv9:A 80 54 0.3492 0.2750 0.4074 4.74e-05 4l58:A
18 1weu:A 91 58 0.3016 0.2088 0.3276 1.23e-04 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
19 5tbn:A 57 46 0.2698 0.2982 0.3696 3.09e-04
20 1wee:A 72 34 0.2540 0.2222 0.4706 4.56e-04
21 2qic:A 51 55 0.3016 0.3725 0.3455 8.51e-04
22 3n9m:A 503 33 0.2063 0.0258 0.3939 0.002 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
23 6wxk:B 51 51 0.2698 0.3333 0.3333 0.003 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
24 5tdr:A 70 53 0.2698 0.2429 0.3208 0.006 5tdw:A
25 2rsd:A 68 56 0.2857 0.2647 0.3214 0.008
26 1x4i:A 70 52 0.2857 0.2571 0.3462 0.009 7zmx:A, 7zmx:B
27 7y0i:A 56 49 0.2698 0.3036 0.3469 0.011
28 2mum:A 50 52 0.2857 0.3600 0.3462 0.018
29 5c11:A 52 52 0.2540 0.3077 0.3077 0.020 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
30 1wes:A 71 58 0.2698 0.2394 0.2931 0.020 2g6q:A
31 2miq:A 94 47 0.2381 0.1596 0.3191 0.030
32 2ma5:A 61 38 0.2063 0.2131 0.3421 0.035
33 2jmi:A 60 55 0.2857 0.3000 0.3273 0.047 2jmj:A
34 3o70:A 55 46 0.2063 0.2364 0.2826 0.063 3o7a:A
35 2m85:A 65 33 0.2063 0.2000 0.3939 0.071
36 6u04:A 168 49 0.2540 0.0952 0.3265 0.67 5erc:A
37 6avo:X 213 29 0.1746 0.0516 0.3793 1.0 6avo:S, 8cvr:M, 8cvr:a, 8cvs:L, 8cvs:Z, 8cvt:S, 1iru:M, 1iru:1, 5ley:L, 5ley:Z, 5lez:L, 5lez:Z, 5lf0:L, 5lf0:Z, 5lf4:L, 5lf4:Z, 5m32:L, 4r67:M, 4r67:1, 4r67:o, 4r67:a, 8ud9:M, 8ud9:a, 8yvp:X, 8yvp:S
38 8fmf:A 369 42 0.1746 0.0298 0.2619 2.1 8fm1:A, 8fm1:B, 8fm1:C, 8fm1:D, 8fm1:E, 8fm1:F, 8fm1:G, 8fm1:H, 8fm1:J, 8fm1:K, 8fm1:L, 8fmf:B, 8fmf:C, 8fmf:D, 8fmg:A, 8fmg:C, 8fmg:B, 8fmg:D, 8fmg:E, 8fmg:F, 8fmg:G, 8fmg:H, 8fmg:K, 8fmg:L, 8fmg:M, 8fmg:N, 8fmh:A, 8fmh:B, 8fmh:C, 8fmh:D, 8fmh:E, 8fmh:F, 8fmh:G, 8fmh:H
39 1d7c:A 190 23 0.1270 0.0421 0.3478 2.5 1d7b:A, 1d7b:B, 1d7c:B, 1d7d:A, 1d7d:B, 1pl3:A, 1pl3:B
40 5xfo:A 315 49 0.2063 0.0413 0.2653 2.6 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
41 5xfo:A 315 33 0.1746 0.0349 0.3333 4.3 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
42 2bty:A 282 24 0.1746 0.0390 0.4583 2.7 2bty:B, 2bty:C
43 2xrg:A 758 26 0.1270 0.0106 0.3077 3.1
44 3way:A 787 26 0.1270 0.0102 0.3077 3.1 8c3o:B, 8c3p:A, 8c3p:B, 8c4w:A, 8c7r:A, 5dlv:A, 5dlv:B, 5dlw:A, 5inh:A, 5l0b:A, 5l0b:B, 5l0e:A, 5l0e:B, 5l0k:A, 5l0k:B, 6leh:A, 5lqq:A, 5m0d:A, 5m0e:A, 5m0m:A, 5m0s:A, 7mfh:A, 5mhp:A, 3nkn:A, 3nko:A, 3nkq:A, 3nkr:A, 5ohi:A, 5olb:A, 7p0k:AAA, 7p4j:A, 7p4o:A, 3waw:A, 6y5m:A, 4zg7:A
45 5s9m:A 809 26 0.1270 0.0099 0.3077 3.1 8c3o:A, 5dlt:A, 9ent:A, 9eu5:A, 5hrt:A, 5ijq:A, 5ijs:A, 5lia:A, 3nkm:A, 3nkp:A, 5s9l:A, 5s9n:A, 6w35:A, 3wav:A, 3wax:A, 2xr9:A, 7z0n:AAA, 7z3k:AAA, 7z3l:AAA
46 4qn1:A 372 26 0.1587 0.0269 0.3846 3.3
47 4q6f:A 56 22 0.1429 0.1607 0.4091 3.4 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
48 5v8f:7 725 32 0.1270 0.0110 0.2500 3.4 8b9a:7, 8b9b:7, 8b9c:7, 3jc6:7, 3jc7:7, 8kg6:7, 8kg8:7, 8p5e:7, 8p62:7, 8p63:7, 7pt6:7, 7pt6:G, 7pt7:7, 7pt7:G, 7qhs:7, 6rqc:7, 6sko:7, 8w7m:7, 7z13:7, 7z13:f
49 1wev:A 88 40 0.2063 0.1477 0.3250 3.7
50 3mcx:A 459 27 0.1587 0.0218 0.3704 3.9
51 6fhq:A 58 30 0.1905 0.2069 0.4000 3.9 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
52 8i02:G 284 24 0.1270 0.0282 0.3333 4.0 8ifg:P
53 2xzl:A 756 24 0.1429 0.0119 0.3750 4.4
54 2naa:A 94 18 0.1270 0.0851 0.4444 4.7
55 2xb1:C 97 15 0.1111 0.0722 0.4667 4.7 4up0:A, 4up5:A, 2xb1:A
56 2h59:A 246 15 0.1111 0.0285 0.4667 4.9 4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
57 7rtm:A 571 20 0.1429 0.0158 0.4500 5.3 7rtm:B
58 2puy:B 60 37 0.1746 0.1833 0.2973 6.8 2puy:A
59 8hxx:N 375 19 0.1270 0.0213 0.4211 7.8 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
60 8kd6:E 301 19 0.1270 0.0266 0.4211 8.1 8kd2:E
61 7y8r:I 732 34 0.1746 0.0150 0.3235 8.2
62 4ii3:A 986 51 0.2381 0.0152 0.2941 8.5 9b5c:A, 9b5d:A, 9b5e:A, 9b5f:A, 9b5g:A, 9b5h:A, 9b5i:A, 9b5j:A, 9b5k:A, 9b5l:A, 9b5m:A, 9b5n:A, 9b5o:A, 9b5p:A, 9b5q:A, 9b5r:A, 9b5s:A, 9b5t:A, 9b5u:A, 9b5v:A, 9b5w:A, 9b5x:A, 4ii2:A, 4ii3:C, 6o82:A, 6o82:C, 6o83:A, 6o83:C, 5um6:A
63 6v4x:I 510 45 0.2381 0.0294 0.3333 8.5
64 8ihn:M 357 19 0.1270 0.0224 0.4211 8.5 8kd4:E
65 7yi2:D 321 19 0.1270 0.0249 0.4211 8.7 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
66 5xxb:N 200 34 0.1905 0.0600 0.3529 9.0
67 1rm6:B 323 27 0.1429 0.0279 0.3333 9.0 1rm6:E, 1sb3:B, 1sb3:E
68 2yql:A 56 37 0.1746 0.1964 0.2973 9.2
69 7duf:A 62 44 0.1587 0.1613 0.2273 9.2 7duf:B
70 6voy:A 276 26 0.1746 0.0399 0.4231 9.8 6voy:C, 6voy:B, 6voy:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218