BioLiP

>protein
PSDKPVAHVVANPQAEGQLQWLNRRANALLANGVELRDNQLVVPSEGLYLIYSQVLFKGQGCPSTHVLLTHTISRIAVSY
QTKVNLLSAIKSPCQRETPEAKPWYEPIYLGGVFQLEKGDRLSAEINRPDYLDFAESGQVYFGIIAL

The query sequence (length=147) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7jra:A	153	150	1.0000	0.9608	0.9800	3.14e-106	2az5:A, 2az5:B, 2az5:C, 2az5:D, 7jra:B, 7jra:C, 7kp9:A, 7kp9:B, 7kp9:C, 7kpa:A, 7kpa:B, 7kpa:C, 7kpb:A, 7kpb:B, 7kpb:C, 5mu8:A, 5mu8:B, 5mu8:C, 5mu8:D, 5mu8:F, 5mu8:G, 5mu8:H, 5mu8:I, 5mu8:J, 5mu8:K, 5mu8:L, 5mu8:M, 5mu8:N, 5mu8:O, 5mu8:Q, 5mu8:R, 5mu8:S, 5mu8:U, 5mu8:V, 5mu8:W, 5mu8:X, 5mu8:Y, 5mu8:Z, 5mu8:a, 5mu8:b, 5mu8:c, 5mu8:d, 5mu8:e, 5mu8:f, 5mu8:h, 5mu8:i, 5mu8:j, 5mu8:l, 5mu8:m, 5mu8:n, 5mu8:o, 5mu8:p, 5mu8:q, 5mu8:r, 5mu8:t, 5mu8:u, 5mu8:v, 6ooy:A, 6ooy:B, 6ooy:C, 6ooz:A, 6ooz:B, 6op0:A, 6op0:B, 7ta6:C, 7ta6:D, 7ta6:F, 7ta6:A, 7ta6:G, 4twt:A, 4twt:B, 4twt:D, 5uui:A, 6x81:A, 6x81:C, 6x81:B, 6x81:D, 6x81:E, 6x81:F, 6x82:A, 6x82:B, 6x82:C, 6x82:D, 6x82:E, 6x82:F, 6x83:A, 6x83:B, 6x83:C, 6x83:E, 6x83:F, 6x85:B, 6x85:C, 6x86:A, 6x86:B, 6x86:C, 6x86:D, 6x86:E, 6x86:F
2	7ta6:E	136	147	0.9184	0.9926	0.9184	4.08e-92	6ooz:C, 6op0:C, 7ta6:B, 7ta6:H, 6x83:D
3	7kp8:A	140	145	0.7619	0.8000	0.7724	8.37e-79	7kp8:B, 7kp8:C
4	3lkj:A	133	144	0.2721	0.3008	0.2778	1.01e-08	3lkj:B, 3lkj:C
5	1kxg:A	144	118	0.2109	0.2153	0.2627	6.12e-05	1kxg:F, 1oqd:E, 1oqd:F, 1oqe:E, 1oqe:F, 1osg:A, 1osg:D, 1osg:B, 1osg:C, 1osg:E, 1osg:F, 4v46:AA, 4v46:AB, 4v46:AC, 4v46:AD, 4v46:AE, 4v46:AF, 4v46:AG, 4v46:AH, 4v46:AI, 4v46:AJ, 4v46:AK, 4v46:AL, 4v46:AM, 4v46:AN, 4v46:AO, 4v46:AP, 4v46:AQ, 4v46:AR, 4v46:AS, 4v46:AT, 4v46:AU, 4v46:AV, 4v46:AW, 4v46:AX, 4v46:AY, 4v46:AZ, 4v46:A0, 4v46:A1, 4v46:A2, 4v46:A3, 4v46:A4, 4v46:A5, 4v46:A6, 4v46:A7, 4v46:A8, 4v46:A9, 4v46:Aa, 4v46:Ab, 4v46:Ac, 4v46:Ad, 4v46:Ae, 4v46:Af, 4v46:Ag, 4v46:Ah, 4v46:Ai, 4v46:Aj, 4v46:Ak, 4v46:Al, 4v46:Am, 4v46:An, 4v46:Ao, 4v46:Ap, 4v46:Aq, 4v46:Ar, 4v46:As, 4v46:At, 4v46:Au, 4v46:Av, 4v46:Aw, 4v46:Ax, 3v56:A, 3v56:B, 3v56:C, 3v56:D, 3v56:E, 3v56:F
6	3k48:A	137	108	0.2245	0.2409	0.3056	0.001	3k48:D, 3k48:B
7	8bdr:A	722	34	0.0884	0.0180	0.3824	4.6	8be0:A, 8bf5:A, 5epi:A, 5epi:E, 5epi:I, 5epi:M, 5epi:Q, 5epi:U, 6f5o:A, 5fml:B, 5fmz:D, 5fmz:A, 6fs8:B, 6fs8:A, 6fs9:A, 6fsb:A, 6fsb:B, 5m3j:A, 5msg:A, 6qcs:A, 6qct:A, 6qcv:A, 6qcw:A, 6qcx:A, 6qwl:E, 7r1f:A, 8rn1:A, 8rn3:A, 8rn4:A, 8rn4:D, 8rn5:A, 8rn7:A, 8rn9:A, 8rnc:A, 6t0w:A, 4wrt:A, 4wsa:A, 7z42:A, 7z42:D, 7z43:AAA
8	1xcr:A	313	26	0.0816	0.0383	0.4615	4.7	1xcr:B
9	7ml1:X	156	19	0.0816	0.0769	0.6316	7.3
10	7y7b:b	176	29	0.0748	0.0625	0.3793	8.5	8wb4:6, 8wb4:P, 8xkl:P, 8xr6:1, 8xr6:7, 7y8a:b
11	6v42:A	466	68	0.1088	0.0343	0.2353	9.5	6v42:B, 6v43:A, 6v43:B
12	5bxc:A	297	45	0.0816	0.0404	0.2667	9.7	5c1g:A, 5c1h:A, 5c1l:A, 4c2s:A, 4c2s:B, 5c36:A, 5c38:A, 5c3a:A, 5c3b:A, 5c3d:A, 5c47:A, 5c48:A, 5c49:A, 5c4b:A, 5c4c:A, 5c4d:A, 5c4e:A, 5c4f:A, 5c8r:A, 4fqw:A, 4fra:A, 4frb:A, 4frd:A, 4fre:A, 4frh:A, 4frl:A, 4frm:A, 4fro:A, 4frp:A, 4frq:A, 4gbp:A, 6gx0:A, 6gx1:A, 6gx2:A, 3i0d:A, 3i0e:A, 3i0f:A, 3i0g:A, 3i0i:X, 3i0j:A, 3i0k:A, 3i0l:A, 3ioi:A, 3ioj:A, 3ioj:B, 4kc1:A, 4kc2:A, 4kc4:A, 1lzi:A, 5m79:A, 5m7a:A, 5m7b:A, 5m7c:A, 5m7c:B, 5m7d:A, 2pgv:A, 1r7u:A, 1r7y:A, 1r80:A, 1r81:A, 2rix:A, 2riy:A, 2rj0:A, 2rj1:A, 2rj4:A, 2rj5:A, 2rj6:A, 2rj7:A, 2rj8:A, 2rj9:A, 3sx3:A, 3sx5:A, 3sx7:A, 3sx8:A, 3sxa:A, 3sxb:A, 3sxc:A, 3sxd:A, 3sxe:A, 3sxg:A, 3u0x:A, 3u0x:B, 3u0y:A, 3u0y:B, 3v0l:A, 3v0m:A, 3v0m:B, 3v0n:A, 3v0n:B, 3v0o:A, 3v0o:B, 3v0p:A, 3v0p:B, 3v0q:A, 3v0q:B, 4y62:A, 4y63:A, 4y64:A, 2y7a:A, 3zgf:A, 3zgf:B, 3zgg:A, 1zhj:A, 1zj0:A
13	2j9f:D	329	65	0.1361	0.0608	0.3077	9.8	1dtw:B, 2j9f:B

[Back]