Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PQRSVGWILFVTSIHEEAQEDEIQEKFCDYGEIKNIHLNLDRRTGFSKGYALVEYETHKQALAAKEALNGAEIMGQTIQV
DWCFVKG

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1rk8:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 2.95e-62
2 2xb2:D 89 88 0.7356 0.7191 0.7273 1.44e-44 2xb2:Z
3 7dvq:Y 140 79 0.3563 0.2214 0.3924 5.56e-12 8i0p:Y, 8i0r:Y
4 8y6o:W 167 74 0.3218 0.1677 0.3784 9.82e-12
5 7q33:A 93 72 0.3103 0.2903 0.3750 7.57e-11 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
6 6qx9:1K 201 73 0.2874 0.1244 0.3425 9.83e-11 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
7 7zew:A 117 74 0.2874 0.2137 0.3378 1.39e-10 7zex:A
8 4pkd:B 240 73 0.2874 0.1042 0.3425 1.94e-10 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
9 5kw6:A 201 72 0.3218 0.1393 0.3889 4.65e-10 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
10 5kw6:A 201 72 0.2759 0.1194 0.3333 1.85e-09 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
11 5mqf:o 223 74 0.2874 0.1121 0.3378 7.84e-10 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
12 2mkc:A 118 78 0.2644 0.1949 0.2949 1.32e-09 2my3:A
13 7dco:X 128 78 0.2644 0.1797 0.2949 2.10e-09 5gm6:V, 5zwm:X
14 2rra:A 99 67 0.2759 0.2424 0.3582 2.36e-09 2kxn:B
15 7ohx:o 112 73 0.2414 0.1875 0.2877 3.29e-09
16 6c0f:o 133 73 0.2414 0.1579 0.2877 3.34e-09 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
17 2mb0:B 95 75 0.2759 0.2526 0.3200 4.62e-09
18 4ed5:B 169 75 0.2874 0.1479 0.3333 1.30e-08 4ed5:A
19 4ed5:B 169 76 0.1954 0.1006 0.2237 2.16e-05 4ed5:A
20 8xxm:3G 84 73 0.2644 0.2738 0.3151 1.57e-08 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
21 6r5k:H 394 72 0.3103 0.0685 0.3750 2.42e-08 6r5k:D, 6r5k:F
22 6r5k:H 394 72 0.2529 0.0558 0.3056 2.92e-04 6r5k:D, 6r5k:F
23 6r5k:H 394 75 0.2414 0.0533 0.2800 0.001 6r5k:D, 6r5k:F
24 6r5k:H 394 75 0.2299 0.0508 0.2667 0.007 6r5k:D, 6r5k:F
25 6gd2:A 84 79 0.2299 0.2381 0.2532 5.99e-08 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
26 4a8x:A 88 60 0.2874 0.2841 0.4167 1.17e-07
27 8i0v:4 161 86 0.2989 0.1615 0.3023 2.12e-07
28 8i0v:4 161 73 0.2529 0.1366 0.3014 2.98e-06
29 1fnx:H 174 75 0.2759 0.1379 0.3200 7.48e-07 1fxl:A, 1g2e:A
30 1fnx:H 174 67 0.2184 0.1092 0.2836 6.92e-06 1fxl:A, 1g2e:A
31 2leb:A 101 72 0.2299 0.1980 0.2778 8.17e-07 2lec:A
32 2fy1:A 108 75 0.2529 0.2037 0.2933 9.68e-07
33 5m8i:A 114 75 0.2414 0.1842 0.2800 1.02e-06
34 5ith:A 80 75 0.2414 0.2625 0.2800 1.22e-06 5o3j:A
35 2x1f:A 94 75 0.2184 0.2021 0.2533 1.50e-06 2km8:B, 2x1a:A
36 8by6:B 152 74 0.2644 0.1513 0.3108 2.42e-06 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
37 6xlv:A 203 65 0.2414 0.1034 0.3231 3.39e-06 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
38 8fkp:SH 150 63 0.2299 0.1333 0.3175 5.55e-06 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
39 4f02:A 175 74 0.2644 0.1314 0.3108 8.46e-06 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
40 4f02:A 175 62 0.1954 0.0971 0.2742 0.071 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
41 2rqc:A 115 75 0.2184 0.1652 0.2533 1.45e-05
42 5en1:A 184 50 0.1954 0.0924 0.3400 2.24e-05 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
43 8esq:o 137 72 0.2069 0.1314 0.2500 3.76e-05 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
44 4qqb:A 169 75 0.2184 0.1124 0.2533 5.56e-05 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
45 4qqb:A 169 61 0.2299 0.1183 0.3279 7.17e-05 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
46 4bs2:A 174 65 0.2184 0.1092 0.2923 6.55e-05 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
47 4bs2:A 174 72 0.2069 0.1034 0.2500 2.0 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
48 2n82:B 104 73 0.2299 0.1923 0.2740 7.08e-05 2err:A, 7vrl:B
49 2yka:A 124 76 0.2529 0.1774 0.2895 9.52e-05
50 9gpj:A 184 50 0.1954 0.0924 0.3400 1.00e-04 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
51 9gpj:A 184 59 0.1724 0.0815 0.2542 1.7 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
52 2xs2:A 87 47 0.2184 0.2184 0.4043 1.04e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
53 3smz:A 280 75 0.2529 0.0786 0.2933 1.85e-04
54 3smz:A 280 36 0.1494 0.0464 0.3611 0.019
55 1wtb:A 79 48 0.1494 0.1646 0.2708 2.81e-04 1x0f:A
56 2cjk:A 167 49 0.1954 0.1018 0.3469 2.90e-04 2km8:C
57 2cjk:A 167 48 0.1494 0.0778 0.2708 0.002 2km8:C
58 7csz:A 175 57 0.2184 0.1086 0.3333 3.38e-04
59 7csz:A 175 58 0.2414 0.1200 0.3621 0.043
60 7qde:B 169 75 0.2414 0.1243 0.2800 5.00e-04 7qdd:B
61 5x8p:v 190 75 0.2529 0.1158 0.2933 8.00e-04 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
62 8h6e:4R 106 72 0.1839 0.1509 0.2222 0.001 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
63 4lmz:A 176 68 0.2644 0.1307 0.3382 0.001 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
64 4lmz:A 176 66 0.2069 0.1023 0.2727 0.003 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
65 6g90:B 193 60 0.2184 0.0984 0.3167 0.001
66 6n7p:A 186 60 0.2184 0.1022 0.3167 0.002 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
67 1fje:B 175 68 0.2759 0.1371 0.3529 0.004 1rkj:A
68 8i0s:Y 320 75 0.2184 0.0594 0.2533 0.005 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
69 8ch6:V 285 75 0.2184 0.0667 0.2533 0.008 7qtt:V
70 6m75:A 167 73 0.1954 0.1018 0.2329 0.008
71 7uj1:B 270 72 0.2299 0.0741 0.2778 0.009 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
72 7zap:A 97 81 0.2299 0.2062 0.2469 0.011
73 5ifm:C 256 75 0.2184 0.0742 0.2533 0.012 5ifm:A
74 2mgz:A 94 75 0.2069 0.1915 0.2400 0.015
75 3d2w:A 72 75 0.2299 0.2778 0.2667 0.029
76 2i2y:A 150 73 0.1839 0.1067 0.2192 0.032 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
77 2mxy:A 105 82 0.2184 0.1810 0.2317 0.043 2mz1:A
78 8pv1:CI 152 71 0.1609 0.0921 0.1972 0.093 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
79 8ch6:U 295 83 0.2069 0.0610 0.2169 0.11 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
80 7slp:B 321 46 0.2069 0.0561 0.3913 0.13 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
81 7qun:A 694 71 0.2414 0.0303 0.2958 0.14 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
82 7abi:P 237 76 0.1954 0.0717 0.2237 0.14 7aav:P, 7abg:P
83 6jvx:A 87 45 0.1494 0.1494 0.2889 0.24 6jvy:A
84 3lqv:B 115 78 0.2299 0.1739 0.2564 0.42 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
85 2rs2:A 84 47 0.1264 0.1310 0.2340 0.71
86 2mqp:A 118 23 0.1264 0.0932 0.4783 1.1 7evr:A, 7evr:C
87 2mgz:B 105 77 0.2184 0.1810 0.2468 1.5 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
88 2kg1:A 105 64 0.2069 0.1714 0.2812 1.6
89 7evs:A 101 32 0.1724 0.1485 0.4688 1.7 7evs:B
90 8q5w:G 281 60 0.2529 0.0783 0.3667 1.8 8q5w:A, 8q5w:B, 8q5w:C, 8q5w:D, 8q5w:E, 8q5w:F, 8q5w:H, 8q5w:I, 8q5w:J, 8q5w:K, 8q5w:L
91 5x3z:A 96 49 0.1149 0.1042 0.2041 2.5
92 5osg:h 173 54 0.1839 0.0925 0.2963 2.6 8a3w:Sh, 8a98:Sh, 8ovj:Sh, 8rxh:Sh, 8rxx:Sh
93 7d5m:A 389 32 0.1379 0.0308 0.3750 2.8 7d5n:A, 7d5n:B
94 5det:B 94 80 0.2414 0.2234 0.2625 3.6 5det:A
95 2adc:A 208 77 0.1954 0.0817 0.2208 4.5
96 4zla:A 485 31 0.1609 0.0289 0.4516 4.6 4zi6:A, 4zi6:B, 4zi6:C, 4zi6:D, 4zi6:E, 4zi6:F, 4zla:B, 4zla:C, 4zla:D, 4zla:E, 4zla:F
97 7pcv:A 116 28 0.1264 0.0948 0.3929 4.8 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
98 4on1:A 334 56 0.1839 0.0479 0.2857 5.3 4on1:B
99 3dty:A 374 32 0.1264 0.0294 0.3438 5.4 3dty:E
100 3tht:B 312 43 0.1609 0.0449 0.3256 8.9 3thp:A, 3tht:A, 3tht:C, 3tht:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218