Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PKTLDMGAILADTSNRVVVCCGAGGVGKTTTAAALALRAAEYGRTVVVLTIDPAKRLAQALGINDLGNTPQRVPLAPEVP
GELHAMMLDMRRTFDEMVMQYSGPERAQSILDNQFYQTVATSLAGTQEYMAMEKLGQLLSQDRWDLIVVDTPPSRNALDF
LDAPKRLGSFMDSRLWRLLLAITGVMGLAMKALSTVLGSQMLADAAAFVQSLDAGGFREKADRTYALLKRRGTQFVVVSA
AEPDALREASFFVDRLSQESMPLAGLVFNRTHPMLCALPIERAIDAAETLDAETSLAAAVLRIHAERGQTAKREIRLLSR
FTGANPTVPVVGVPSLPFDVSDLEALRALADQLTT

The query sequence (length=355) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6bs3:B 355 355 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6bs4:B
2 1ii0:B 553 158 0.1408 0.0904 0.3165 7.85e-12 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
3 1ii0:B 553 45 0.0592 0.0380 0.4667 8.79e-04 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
4 3zq6:D 307 324 0.2169 0.2508 0.2377 4.17e-08 3zq6:A
5 5zme:A 638 270 0.1803 0.1003 0.2370 4.97e-08 5zmf:A
6 5zme:A 638 261 0.1803 0.1003 0.2452 9.13e-05 5zmf:A
7 2woo:A 303 354 0.2423 0.2838 0.2429 6.65e-07 2woo:B, 2woo:C, 2woo:D, 2woo:E, 2woo:F
8 3ug7:A 317 172 0.1211 0.1356 0.2500 3.81e-06 3ug6:A, 3ug6:B, 3ug6:C, 3ug6:D, 3ug7:B, 3ug7:C, 3ug7:D
9 3zq6:B 288 142 0.1014 0.1250 0.2535 3.97e-06 3zq6:C
10 5if9:A 251 135 0.1014 0.1434 0.2667 0.001 5if9:B, 5ihp:A, 5ihp:B
11 6bs3:A 330 157 0.1268 0.1364 0.2866 0.002 6bs4:A, 6bs5:A
12 5aup:I 241 175 0.1324 0.1950 0.2686 0.002 5aun:B, 5auo:B, 5aup:B, 3vx3:A, 3vx3:B
13 3ibg:A 300 162 0.1296 0.1533 0.2840 0.004 3ibg:B, 3ibg:C, 3ibg:D, 3ibg:E, 3ibg:F
14 8odu:A 291 266 0.1944 0.2371 0.2594 0.008
15 3q9l:A 257 33 0.0479 0.0661 0.5152 0.010 3q9l:B, 3r9i:A, 3r9i:B, 3r9i:C, 3r9i:D, 3r9j:A, 3r9j:B
16 2bej:A 245 48 0.0535 0.0776 0.3958 0.013 2bek:A, 2bek:B, 2bek:C, 2bek:D
17 8hac:B 327 251 0.1775 0.1927 0.2510 0.014 8hac:A
18 3tk1:A 293 195 0.1465 0.1775 0.2667 0.016
19 6iub:A 264 50 0.0507 0.0682 0.3600 0.028 6iub:B, 6iuc:A, 6iuc:B, 6iuc:C, 6iuc:D, 6iud:B, 6iud:C, 6iud:D, 6iud:A, 8jmj:A, 8jmj:B, 8jmj:C, 8jmj:D, 8jmk:A, 8jmk:B, 8jmk:C, 8jmk:D, 8jml:A, 8jml:B
20 3kb1:A 243 48 0.0535 0.0782 0.3958 0.028 3kb1:B, 6oby:A, 6oby:B
21 6nop:B 262 151 0.1211 0.1641 0.2848 0.059 6non:B, 6noo:B, 6nop:A
22 3nxs:A 306 41 0.0535 0.0621 0.4634 0.13
23 1ion:A 243 58 0.0563 0.0823 0.3448 0.17
24 6riq:C 254 133 0.1042 0.1457 0.2782 0.21 6riq:D, 6riq:G, 6riq:J, 6riq:K, 6riq:M, 6riq:N, 6riq:Q, 6riq:R, 6riq:U, 6riq:V
25 2afh:E 289 32 0.0394 0.0484 0.4375 0.25 2afh:F, 2afi:E, 2afi:F, 2afi:G, 2afi:H, 2afi:M, 2afi:N, 2afi:O, 2afi:P, 2c8v:A, 1de0:A, 1de0:B, 8dfc:E, 8dfc:F, 8dfd:E, 8dfd:F, 8dfd:G, 8dfd:H, 1fp6:A, 1fp6:B, 1fp6:C, 1fp6:D, 1g1m:A, 1g1m:B, 1g20:E, 1g20:F, 1g20:G, 1g20:H, 1g21:E, 1g21:F, 1g21:G, 1g21:H, 1g5p:A, 1g5p:B, 1m1y:E, 1m1y:F, 1m1y:G, 1m1y:H, 1m1y:M, 1m1y:N, 1m1y:O, 1m1y:P, 1m34:E, 1m34:F, 1m34:G, 1m34:H, 1m34:M, 1m34:N, 1m34:O, 1m34:P, 1n2c:E, 1n2c:F, 1n2c:G, 1n2c:H, 6n4j:A, 6n4j:B, 6n4k:A, 6n4k:B, 6n4l:A, 6n4m:A, 1nip:B, 1nip:A, 2nip:A, 2nip:B, 6o0b:A, 6o0b:B, 6q93:A, 6q93:B, 6q93:C, 6q93:D, 6q93:E, 6q93:F, 6q93:G, 6q93:H, 1rw4:A, 7t4h:A, 8tc3:A, 8tc3:B, 7tne:A, 7tpn:A, 7tpo:A, 7tpv:A, 7tpw:A, 7tpx:A, 7tpy:A, 7tpz:A, 7tq0:A, 7tq9:A, 7tqc:A, 7tqe:A, 7tqf:A, 7tqh:A, 7tqi:A, 7tqj:A, 7tqk:A, 7ut8:E, 7ut8:F, 7ut9:E, 7ut9:F, 7uta:E, 7uta:F, 7uta:G, 7uta:H, 4wza:E, 4wza:F, 4wza:G, 4wza:H, 4wzb:E, 4wzb:F, 4wzb:G, 4wzb:H, 1xcp:A, 1xcp:B, 1xcp:C, 1xcp:D, 1xd8:A, 1xd8:B, 1xd9:A, 1xd9:B, 1xdb:A, 1xdb:B
26 6g2g:B 273 43 0.0451 0.0586 0.3721 0.26 6g2g:A
27 3tk1:B 319 37 0.0451 0.0502 0.4324 0.28
28 3kjg:A 254 44 0.0563 0.0787 0.4545 0.35 3kjg:B, 3kjh:A, 3kji:A, 3kji:B
29 5k5z:D 314 45 0.0423 0.0478 0.3333 0.44 5k5z:A, 5u1j:B, 5u1j:A, 5u1j:C, 5u1j:D
30 2ynm:B 268 37 0.0366 0.0485 0.3514 0.58 2ynm:A
31 3iqx:A 261 159 0.1099 0.1494 0.2453 0.68 3iqw:A, 3iqw:B, 3iqx:B
32 4v02:A 244 52 0.0563 0.0820 0.3846 0.69 4v02:B, 4v03:A, 4v03:B
33 7obq:y 454 36 0.0394 0.0308 0.3889 0.88 6frk:y, 2go5:1, 5l3q:B, 5l3q:D, 6y32:B, 6y32:D, 6y32:F, 6y32:H
34 8ein:B 370 70 0.0563 0.0541 0.2857 1.0 8ein:A, 8ein:C, 8ein:D, 8eip:A, 8eip:B, 8eip:C, 8eip:D
35 6so5:A 313 137 0.0845 0.0958 0.2190 1.1 7ru9:A, 7ru9:B, 7rua:A, 7rua:B, 7ruc:A, 7ruc:B
36 3sja:A 338 274 0.1775 0.1864 0.2299 1.1 3a36:B, 3a37:B, 3b2e:B, 3b2e:C, 3sja:E
37 1cp2:A 269 38 0.0423 0.0558 0.3947 1.2 1cp2:B
38 3p32:A 306 228 0.1577 0.1830 0.2456 1.3 4gt1:A, 3md0:A
39 1g3q:A 237 50 0.0479 0.0717 0.3400 1.3 1g3r:A
40 4jlv:A 228 146 0.0930 0.1447 0.2260 1.4
41 8xvb:C 246 67 0.0676 0.0976 0.3582 2.1 8xvb:D, 8xvb:F, 8xvb:G, 8xvb:H, 8xvb:A, 8xvb:B, 8xvb:E, 8xvc:A, 8xvc:B, 8xvc:C, 8xvc:D, 8xvc:E, 8xvc:F, 8xvc:G, 8xvc:H, 8xvc:I, 8xvc:J, 8xvc:K, 8xvc:L, 8xvc:M, 8xvc:N, 8xvc:O, 8xvc:P, 8xvc:Q, 8xvc:R, 8xvd:A, 8xvd:B, 8xvd:C, 8xvd:D, 8xvd:E, 8xvd:F, 8xvd:G, 8xvd:H, 8xvd:I, 8xvd:J, 8xvd:K, 8xvd:L, 8xvd:M, 8xvd:N, 8xvd:O, 8xvd:P, 8xvd:Q, 8xvd:R, 8xvd:S, 8xvd:T
42 6cvd:B 303 53 0.0507 0.0594 0.3396 2.2 4c7o:B, 4c7o:D, 6cs8:A, 6cs8:B, 6cvd:A, 6dlx:A, 6dlx:B, 6fqd:A, 6fqd:B, 5gad:l, 6n6n:B, 5nco:l, 6nc1:A, 6nc4:A, 6nc4:B, 5niy:A, 7o9h:A, 7o9h:B, 2xxa:D, 2xxa:B, 3zn8:D
43 4n8g:A 325 35 0.0338 0.0369 0.3429 3.3 4n8g:B, 4n8g:C, 4n8g:D
44 8hue:A 135 63 0.0535 0.1407 0.3016 3.4 1bfb:A, 1bfc:A, 1bff:A, 1fga:A, 4fgf:A, 1fq9:A, 1fq9:B, 8hue:B, 8hue:C, 4oee:A, 4oef:A, 4oeg:A, 5x1o:A
45 7pcs:B 247 142 0.1099 0.1579 0.2746 3.5 7pcs:D
46 4tmk:A 210 84 0.0676 0.1143 0.2857 3.5 5tmp:A
47 3fwy:A 268 38 0.0366 0.0485 0.3421 4.0 3fwy:B, 6uyk:A, 6uyk:B, 6uyk:C, 6uyk:D
48 5w8q:A 379 42 0.0394 0.0369 0.3333 4.0 5w8q:B, 5wc4:A, 5wc4:B
49 8r9r:A 255 38 0.0535 0.0745 0.5000 4.2
50 3cwq:A 206 57 0.0592 0.1019 0.3684 4.4 3cwq:B
51 6aph:A 432 44 0.0563 0.0463 0.4545 5.0
52 3mkv:A 414 186 0.1155 0.0990 0.2204 5.3 3mkv:B, 3mkv:C, 3mkv:D, 3mkv:E, 3mkv:F, 3mkv:G, 3mkv:H
53 7w02:A 1566 137 0.1099 0.0249 0.2847 5.4
54 7q3y:A 1201 71 0.0563 0.0167 0.2817 5.4 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
55 8qno:A 421 44 0.0451 0.0380 0.3636 5.5 8qno:B, 7r37:A, 7r37:B, 7r38:A, 7r38:B
56 5oql:Z 639 88 0.0761 0.0423 0.3068 5.6
57 3g1u:C 424 48 0.0507 0.0425 0.3750 5.8 3g1u:A, 3g1u:B, 3g1u:D
58 6rxt:CI 822 88 0.0761 0.0328 0.3068 5.8 6rxu:CI, 6rxv:CI, 6rxx:CI, 6rxy:CI, 6rxz:CI
59 6u1q:A 208 131 0.0930 0.1587 0.2519 6.8 6u1q:B
60 3x2f:A 406 52 0.0535 0.0468 0.3654 7.0 5tov:B, 5tow:B, 3x2e:A, 3x2e:B, 3x2e:C, 3x2e:D, 3x2f:B
61 2ixp:C 316 32 0.0310 0.0348 0.3438 7.4 2ixp:A, 2ixp:B, 2ixp:D
62 7sq0:A 306 51 0.0310 0.0359 0.2157 8.7 7sq0:B
63 6acx:A 1175 31 0.0394 0.0119 0.4516 8.8 6acx:B
64 6cy5:B 318 31 0.0394 0.0440 0.4516 9.2 6cy5:A
65 3e70:C 307 36 0.0423 0.0489 0.4167 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218