BioLiP

>protein
PGLFLTLEGLDGSGKTTQARRLAAFLEAQGRPVLLTREPGGGLPEVRSLLLTQELSPEAEYLLFSADRAEHVRKVILPGL
AAGKVVISDRYLDSSLAYQGYGRGLPLPWLREVAREATRGLKPRLTFLLDLPPEAAEGLGLEFFRRVREGYLALARAEPG
RFVVLDATLPEEEIARAIQAHLRPLL

The query sequence (length=186) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5x7j:B	197	196	1.0000	0.9442	0.9490	2.60e-123	5x7j:A, 5x86:B, 5x86:A, 5x8a:B, 5x8b:A, 5x8b:B, 5x8c:A, 5x8c:B, 5x8d:B, 5x8d:A, 5x98:B, 5x98:A, 5x99:A, 5x99:B, 5xal:A, 5xal:B, 5xt8:A, 5xt8:B, 5zax:A, 5zax:B, 5zb0:A, 5zb0:B, 5zb4:A, 5zb4:B
2	5h56:B	195	186	0.4409	0.4205	0.4409	4.07e-44	5h56:A, 5h5k:A, 5h5k:B, 4s2e:A, 4s2e:B, 4s35:A, 4s35:B, 5xai:B, 5xai:A, 5xb2:B, 5xb2:A, 5xb3:A, 5xb3:B, 5xb5:A
3	3hjn:A	189	183	0.4624	0.4550	0.4699	1.72e-43	3hjn:B
4	4edh:B	209	187	0.4247	0.3780	0.4225	1.48e-31	4e5u:A, 4e5u:B, 4edh:A, 4gmd:A, 4gmd:B, 4gmd:C, 4gmd:D, 3uwk:A, 3uwk:B, 3uwo:A, 3uwo:B, 3uxm:A, 3uxm:B, 3uxm:C, 3uxm:D
5	4dwj:B	203	190	0.3763	0.3448	0.3684	1.68e-31	2ccg:A, 2ccg:B, 2ccj:A, 2ccj:B, 4dwj:A, 4dwj:C, 4dwj:D, 4dwj:F, 4dwj:G, 4dwj:H, 4eaq:A, 4eaq:B, 4gfd:A, 4gfd:B, 4gsy:A, 4gsy:B, 4hdc:A, 4hdc:B, 4hej:A, 4hlc:A, 4hlc:B, 4hld:A, 4hld:B, 4qg7:A, 4qg7:B, 4qga:A, 4qga:B, 4qgf:A, 4qgf:B, 4qgg:A, 4qgg:B, 4qgh:A, 4qgh:B, 4xwa:A, 4xwa:B
6	4tmk:A	210	200	0.4086	0.3619	0.3800	1.22e-25	5tmp:A
7	3lv8:A	204	198	0.3710	0.3382	0.3485	1.09e-24
8	2wwf:C	212	191	0.3280	0.2877	0.3194	1.13e-19	2wwf:A, 2wwf:B, 2wwg:A, 2wwg:B, 2wwg:C, 2wwh:A, 2wwh:B, 2wwh:C, 2wwi:A, 2wwi:B, 2wwi:C, 2yof:A, 2yof:B, 2yof:C, 2yog:A, 2yog:B, 2yoh:A, 2yoh:B
9	5h70:B	207	137	0.2258	0.2029	0.3066	5.44e-14	5h70:A
10	1e2f:A	210	116	0.2097	0.1857	0.3362	2.86e-10	1e2d:A, 1e2e:A, 1e2g:A, 1e2q:A, 1e98:A, 1e99:A, 1e9a:A, 1e9b:A, 1e9c:A, 1e9d:A, 1e9e:A, 1e9f:A, 1nmx:A, 1nmy:A, 1nmz:A, 1nn0:A, 1nn1:A, 1nn3:A, 1nn5:A, 2xx3:A
11	7fgq:A	190	193	0.2742	0.2684	0.2642	3.92e-10
12	3tmk:A	216	176	0.3172	0.2731	0.3352	4.80e-10	1tmk:A, 1tmk:B, 2tmk:A, 2tmk:B, 3tmk:B, 3tmk:C, 3tmk:D, 3tmk:E, 3tmk:F, 3tmk:G, 3tmk:H
13	5uiv:A	225	102	0.2097	0.1733	0.3824	3.89e-07
14	5nq5:A	191	107	0.1935	0.1885	0.3364	1.48e-04	5nr7:A, 5nr7:B, 5nrn:A, 5nrq:B, 4unn:A, 4unn:B, 4unp:A, 4unq:A, 4unq:B, 4unr:A, 4unr:B, 4uns:A, 4uns:B
15	5nrn:B	211	107	0.1935	0.1706	0.3364	2.08e-04	1g3u:A, 1gsi:A, 1gtv:A, 1gtv:B, 1mrn:A, 1mrs:A, 1n5i:A, 1n5j:A, 1n5k:A, 1n5k:B, 1n5l:A, 1n5l:B, 5nrq:A, 1w2g:A, 1w2g:B, 1w2h:A, 1w2h:B, 6yt1:A, 6yt1:B
16	2v54:A	204	154	0.2312	0.2108	0.2792	3.25e-04	2v54:B, 2w0s:A, 2w0s:B
17	8i4y:A	1687	75	0.1667	0.0184	0.4133	0.44	8i4y:B, 8i4z:A
18	2ia5:H	301	139	0.1720	0.1063	0.2302	0.64	2ia5:A, 2ia5:B, 2ia5:C, 2ia5:D, 2ia5:E, 2ia5:J, 1ltq:A, 1rc8:A, 1rpz:A, 1rrc:A, 5uj0:A, 5uj0:B
19	4fxp:B	200	74	0.1344	0.1250	0.3378	0.81	4fxp:A, 4fxp:C, 3uie:A, 3uie:B, 3uie:C
20	2gks:B	529	34	0.0860	0.0302	0.4706	0.91	2gks:A
21	2c03:B	297	30	0.0860	0.0539	0.5333	0.96	2c03:A, 2cnw:A, 2cnw:B, 2cnw:C, 2j7p:A, 2j7p:B, 1jpj:A, 1jpn:B, 1jpn:A, 1ls1:A, 1ng1:A, 2ng1:A, 1o87:A, 1o87:B, 1okk:A
22	1qzw:A	432	31	0.0753	0.0324	0.4516	1.1	3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
23	8t9c:A	429	80	0.1290	0.0559	0.3000	1.2	8t9x:A, 8tje:A
24	6qp0:A	188	24	0.0699	0.0691	0.5417	1.2
25	3ndb:B	420	33	0.0753	0.0333	0.4242	1.2	2v3c:C, 2v3c:D, 4xco:D
26	3e70:C	307	27	0.0645	0.0391	0.4444	1.9
27	6z69:B	364	62	0.1129	0.0577	0.3387	2.1	6z69:A
28	6cvd:B	303	27	0.0699	0.0429	0.4815	2.2	4c7o:B, 4c7o:D, 6cs8:A, 6cs8:B, 6cvd:A, 6dlx:A, 6dlx:B, 6fqd:A, 6fqd:B, 5gad:l, 6n6n:B, 5nco:l, 6nc1:A, 6nc4:A, 6nc4:B, 5niy:A, 7o9h:A, 7o9h:B, 2xxa:D, 2xxa:B, 3zn8:D
29	3cwq:A	206	29	0.0699	0.0631	0.4483	2.3	3cwq:B
30	6kgw:A	452	87	0.1344	0.0553	0.2874	3.0	6kgs:A, 6kgt:A, 6kgu:A, 6kgv:A
31	8t4e:B	551	82	0.1505	0.0508	0.3415	3.4	8t4f:B, 8t4g:B, 8t4h:B, 8t4i:B, 8t4j:B
32	2ixf:A	255	39	0.0914	0.0667	0.4359	3.6	2ixe:A, 2ixe:D, 2ixf:B, 2ixf:C, 2ixf:D, 2ixg:A, 4k8o:A
33	7v5c:A	572	42	0.0914	0.0297	0.4048	5.2	7v5c:B, 7vfi:A, 7vfi:B
34	3dm5:A	416	30	0.0645	0.0288	0.4000	6.2	3dm5:B
35	3jaj:z	426	27	0.0645	0.0282	0.4444	6.4	6frk:x, 3jan:z, 7obq:x, 6r6g:AB
36	1xjq:A	563	32	0.0699	0.0231	0.4062	7.6	2pey:B, 1xnj:A
37	7obr:x	488	27	0.0645	0.0246	0.4444	7.7	2go5:W, 2j37:W, 5l3q:A, 5l3q:C, 1mfq:C, 7nfx:x, 7qwq:x, 1ry1:W, 4ue5:D, 6y2z:A, 6y32:A, 6y32:C, 6y32:E, 6y32:G
38	1xjq:B	590	32	0.0699	0.0220	0.4062	8.1	8i1m:A, 2ofw:A, 2ofw:B, 2ofw:C, 2ofw:D, 2ofw:E, 2ofw:F, 2ofw:G, 2ofw:H, 2ofx:A, 2ofx:B, 2pey:A, 2pez:A, 2pez:B, 2qjf:A, 2qjf:B, 1x6v:B, 1xnj:B
39	7rav:A	773	33	0.0914	0.0220	0.5152	8.9
40	5hci:E	259	24	0.0645	0.0463	0.5000	9.3	5hci:A, 5hci:B, 5hci:C, 5hci:D, 5hci:F

[Back]