Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
PEWLFEMNLGPPKTLEELDPESREYWRRLRKQNIWRHNRLSKNK

The query sequence (length=44) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8k2a:L4 83 44 1.0000 0.5301 1.0000 4.14e-27 8any:l, 6i9r:l, 8k2b:L4, 7l08:l, 7l20:l, 7o9k:l, 7o9m:l, 7odr:l, 7ods:l, 7odt:l, 7og4:l, 8oir:Bc, 8oit:Bc, 7po4:l, 7qi4:l, 7qi5:l, 7qi6:l, 6vlz:l, 6vmi:l, 8xt0:L4, 8xt1:L4, 8xt2:L4, 8xt3:L4, 6zm5:l, 6zm6:l, 6zs9:l, 6zsa:l, 6zsb:l, 6zsc:l, 6zsd:l, 6zse:l, 6zsg:l
2 6ydp:Bq 85 44 0.8636 0.4471 0.8636 2.43e-23 5aj4:Bq, 6gaw:Bq, 6gb2:Bq, 7nqh:Bq, 7nql:Bq, 7nsh:Bq, 7nsi:Bq, 7nsj:Bq, 8oin:Bc, 8oiq:Bc, 6ydw:Bq
3 5oy0:A 751 19 0.1818 0.0107 0.4211 0.82 8am5:a, 8asl:a, 8asp:a, 6hqb:A, 4kt0:A, 4l6v:A, 4l6v:a, 4l6v:1, 6nwa:A, 6nwa:a, 6nwa:H, 7o1v:A, 5oy0:a, 5oy0:1, 7umh:A, 7umh:H, 7umh:a, 6uzv:A, 6uzv:a, 6uzv:1, 6vpv:A, 6vpv:a, 6vpv:1
4 6kmx:aA 717 18 0.1818 0.0112 0.4444 0.86 6kmx:bA, 6kmx:cA
5 7s3d:A 749 18 0.1818 0.0107 0.4444 0.88 7s3d:G, 7s3d:a
6 8wm6:A 742 19 0.1818 0.0108 0.4211 0.93 8wmj:A, 8wmv:A, 8wmw:A, 7y7b:A, 7y8a:A
7 6kmw:aA 721 18 0.1818 0.0111 0.4444 0.95 6kmw:bA, 6kmw:cA
8 6k61:A 742 18 0.1818 0.0108 0.4444 0.95 6jeo:aA, 6jeo:bA, 6jeo:cA, 6jeo:dA, 6k61:a, 6tcl:A1, 6tcl:A2, 6tcl:A, 6tcl:AA, 7y3f:A
9 6tra:A 746 18 0.1818 0.0107 0.4444 0.97 4fe1:A, 7fix:A1, 7fix:A2, 7fix:A3, 1jb0:A, 6k33:aA, 6k33:bA, 6k33:cA, 6lu1:A, 7m75:A, 7m76:A, 7m78:A, 3pcq:A, 6pfy:A, 6pfy:G, 6pfy:Y, 6pgk:A, 6pgk:G, 6pgk:Y, 6trc:A, 6trc:a, 6trc:1, 6trd:A, 6trd:a, 6trd:1, 5zf0:A1, 5zf0:A2, 5zf0:A3, 5zf0:A4, 5zf0:A6, 5zf0:A5
10 6kif:A 751 18 0.1818 0.0107 0.4444 1.0 6kif:G, 6kif:e, 6kig:A, 6kig:G, 6kig:e
11 7lx0:G 751 18 0.1818 0.0107 0.4444 1.0 7lx0:a, 7lx0:A, 6pnj:A, 6pnj:G, 6pnj:a
12 7dr0:A 739 18 0.1818 0.0108 0.4444 1.0 7dr1:A, 7dr2:aA, 7dr2:bA, 7dr2:cA, 7dr2:dA
13 7yca:A 742 18 0.1818 0.0108 0.4444 1.1 7a4p:A, 7bgi:A, 7blx:A, 8cmo:A, 7d0j:A, 7dz7:A, 7dz8:A, 8h2u:A, 6ijj:A, 6ijo:A, 6jo5:A, 6jo6:A, 7r3k:A, 7wyi:A, 7wzn:A, 7zq9:A, 7zqc:A, 7zqd:A, 7zqd:A2, 6zzx:A, 6zzy:A
14 7blz:A 743 18 0.1818 0.0108 0.4444 1.1 6fos:A, 8wey:A, 5zgb:A, 5zgh:A
15 6ly5:a 742 19 0.1818 0.0108 0.4211 1.1 6l4u:A
16 7y5e:AN 745 18 0.1818 0.0107 0.4444 1.1 7y5e:A2, 7y7a:A7, 7y7a:Ao
17 7qco:A 728 18 0.1818 0.0110 0.4444 1.2 7qco:E, 7qco:e, 7qco:a
18 5l8r:A 743 18 0.1818 0.0108 0.4444 1.2 8bcv:A, 8bcw:A, 7dkz:A, 7ew6:A, 7ewk:A, 7f9o:A, 7f9o:e, 8htu:A, 8j6z:A, 8j7a:A, 8j7b:A, 7ksq:A, 7kux:A, 6l35:A, 3lw5:A, 2o01:A, 4rku:A, 7wfd:AA, 7wfe:BA, 7wg5:AA, 7wg5:BA, 8wgh:A, 2wsc:A, 2wse:A, 2wsf:A, 4xk8:A, 4xk8:a, 7xqp:A, 4y28:A, 6yac:A, 6yez:A, 5zji:A, 6zoo:A, 6zxs:A
19 7f4v:aA 772 18 0.1818 0.0104 0.4444 1.2 7f4v:bA, 7f4v:cA
20 5z98:B 182 25 0.2727 0.0659 0.4800 1.5 5z98:A
21 6igz:A 740 18 0.1818 0.0108 0.4444 1.6 6qph:A, 6rhz:A, 6sl5:A, 6yxr:A
22 4kik:A 619 26 0.2273 0.0162 0.3846 2.8
23 4kik:B 650 26 0.2273 0.0154 0.3846 3.0
24 8em7:A 4378 22 0.1818 0.0018 0.3636 3.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
25 8em4:A 3818 22 0.1818 0.0021 0.3636 3.6 8em4:B
26 8jjr:a 665 18 0.1591 0.0105 0.3889 3.8
27 8jze:a 670 18 0.1591 0.0104 0.3889 3.8 8jzf:a
28 8jxj:A 570 22 0.1818 0.0140 0.3636 4.4 8jxj:B
29 5w45:A 181 22 0.2727 0.0663 0.5455 5.0 6b0b:A, 6b0b:E, 6bbo:A, 6bbo:E, 8fvi:A, 5w45:B
30 6j3f:A 254 22 0.2045 0.0354 0.4091 5.0 6j3f:B
31 6agm:A 334 19 0.2045 0.0269 0.4737 5.8 6agm:B, 6agm:C, 6agm:D
32 4nqg:A 197 20 0.2045 0.0457 0.4500 5.8 4nqg:B
33 7coy:aA 685 18 0.1591 0.0102 0.3889 6.0 7coy:bA, 7coy:cA
34 7dwq:A 726 18 0.1591 0.0096 0.3889 6.0
35 8jw0:a 645 18 0.1591 0.0109 0.3889 6.5
36 1ofh:A 309 21 0.2045 0.0291 0.4286 6.6 1ofh:B, 1ofh:C, 1ofi:A, 1ofi:B, 1ofi:C
37 5h71:B 492 17 0.1818 0.0163 0.4706 6.7 5h6u:A, 5h6u:B, 5h71:A, 1j1n:A, 1j1n:B, 6jhx:A, 6jhx:B, 1kwh:A, 4tqu:Q, 4xig:Q, 4xtc:Q
38 9f17:A 413 20 0.1818 0.0194 0.4000 8.0 9f17:B, 7pvo:A, 8qwa:A, 6zxq:A
39 1g3i:A 326 21 0.2045 0.0276 0.4286 9.4 1g3i:B, 1g3i:C, 1g3i:D, 1g3i:E, 1g3i:F, 1g3i:S, 1g3i:U, 1g3i:V, 1g3i:W, 1g3i:X, 1kyi:A, 1kyi:B, 1kyi:C, 1kyi:D, 1kyi:E, 1kyi:F, 1kyi:S, 1kyi:T, 1kyi:U, 1kyi:V, 1kyi:W, 1kyi:X
40 1im2:A 346 21 0.2045 0.0260 0.4286 9.4 1g3i:T, 1g41:A
41 5w15:D 270 28 0.2500 0.0407 0.3929 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218